Geeni
JAK3
Janus kinase 3
- HGNC 6193↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000105639↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 3718↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 19p13.11
- Koordinaatit
- Kromosomi 19: 17 824 782–17 847 982 (GRCh38)
- Eksonit
- 24 eksonia 23,2 kb:n alueella
- Proteiini
- 1 124 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- L-JAK, JAKL, LJAK, JAK3_HUMAN, JAK-3
- MANE Select -transkripti
- ENST00000458235.7NM_000215.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue JAK3 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Vakava yhdistynyt immuunipuutos
- Autosomaalinen resessiivinen
Vakava yhdistynyt immuunipuutos (SCID) on ryhmä harvinaisia monogeenisiä primaarisia immuunipuutossairauksia, joille on ominaista toimivien perifeeristen T-lymfosyyttien puute. Tämä johtaa varhaisessa iässä alkaviin vakavoihin hengitystieinfektioihin ja kasvun häiriintymiseen. Sairaudet luokitellaan immunologisen fenotyypin mukaan SCID-muotoihin, joissa T-solut puuttuvat mutta B-solut ovat läsnä (T-B+ SCID), tai SCID-muotoihin, joissa sekä T- että B-solut puuttuvat (T-B- SCID). Molemmat ryhmät sisältävät useita muotoja, joissa luonnollisia tappajasoluja (NK-soluja) voi olla tai ei ole.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 5 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Laajemmat ryhmät
Muut synnynnäiset immuunijärjestelmän häiriöt
- Immuunipuutossairaus
Yksi 170 siihen liittyvästä geenistä
Sairaus, jossa immuniteettimekanismeissa on puutetta tai vikaa, joko solullisessa tai humoraalisessa immuniteetissa.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 5 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
HSCT vakavan yhdistelmäimmuunipuutoksen (SCID) ja vakavien primaaristen immuunipuutosten hoitoon; immunoglobuliinikorvaushoito (IVIG/SCIG) vasta-ainepuutoksiin; leniolisib (Joenja, FDA 2023) APDS-oireyhtymään; geenihoito ADA-SCID-tautiin; abatasepti CTLA4- ja LRBA-puutoksiin; profylaktiset antibiootit; G-CSF krooniseen granulomatoottiseen sairauteen (CGD)
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
JAK3-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
- Variantit, joilla on sivu
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 5,4 kb geenin 23,2 kb:stä; 3 375 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä JAK3
131
JAK3-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 23,2 kb geenistä JAK3, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 5,4 kb eksoneja.
Variantit, joilla on sivu (17)
Tässä ovat JAK3-variantit, joilla on sivu, eniten arvostelutähtiä saaneet ensin. Jokainen sivu kuvaa ClinVarin julkista tietuetta variantista, ei koskaan tulosta.
| Variantti | HGVS c. | Eksoni tai introni | Sijainti (GRCh38) | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|---|---|
| c.862-2A>G | Introni 6 | 17 841 764 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.1701+1G>A | Introni 12 | 17 837 931 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.1914G>T | Eksoni 14 | 17 835 924 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.2680+89G>A | Introni 19 | 17 832 430 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| C193Y | c.578G>A | Eksoni 6 | 17 842 599 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| C227Pfs*49 | c.678_679del | Eksoni 6 | 17 842 497 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| C565X | c.1695C>A | Eksoni 12 | 17 837 938 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| D784N | c.2350G>A | Eksoni 17 | 17 834 571 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| G589S | c.1765G>A | Eksoni 13 | 17 837 150 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| K59X | c.175A>T | Eksoni 2 | 17 844 243 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ADAadenosine deaminaseYhteisiä sairauksia: 2
- AK2adenylate kinase 2Yhteisiä sairauksia: 2
- BCL11BBCL11 transcription factor BYhteisiä sairauksia: 2
- CARD11caspase recruitment domain family member 11Yhteisiä sairauksia: 2
- CARMIL2capping protein regulator and myosin 1 linker 2Yhteisiä sairauksia: 2
- CD247CD247 moleculeYhteisiä sairauksia: 2
- CD3DCD3 delta subunit of T-cell receptor complexYhteisiä sairauksia: 2
- CD3ECD3 epsilon subunit of T-cell receptor complexYhteisiä sairauksia: 2
- CD70CD70 moleculeYhteisiä sairauksia: 2
- CIITAclass II major histocompatibility complex transactivatorYhteisiä sairauksia: 2
- CORO1Acoronin 1AYhteisiä sairauksia: 2
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CYhteisiä sairauksia: 2
Geeniin JAK3 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita JAK3 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the immune system
- Pneumonia
- Recurrent chest infections
- Recurrent opportunistic infections
- Recurrent respiratory infections
- Pimple
- Recurrent pneumonia
- Recurrent viral infections
- Skin rash
Näytä 3 piirrettä lisää
Abnormal cellular phenotype
- Abnormality of B cell physiology
- Decreased anti-CD3/28-induced T-cell proliferation
- Impaired phytohemagglutinin-induced T lymphocyte transformation
- Panhypogammaglobulinemia
- Decreased mitogen-induced T-cell proliferation
- Impaired T cell function
- Decreased circulating IgA concentration
- Decreased circulating IgG concentration
Näytä 2 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). JAK3-geeni: Janus kinase 3. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/jak3
Dante Labs. JAK3-geeni: Janus kinase 3 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/jak3
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa