Geen
ABCB4
ATP binding cassette subfamily B member 4
- HGNC 45↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000005471↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 5244↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 7q21.12
- Koordinaadid
- Kromosoom 7: 87 401 696–87 475 680 (GRCh38)
- Eksonid
- 28 eksonit, ulatus 74 kb
- Valk
- 1279 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne retsessiivne
- Tuntud ka kui
- MDR2, PFIC-3, GBD1
- Varasemad tähised
- PGY3, MDR3
- MANE Select transkript
- ENST00000649586.2NM_000443.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe ABCB4 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Perekondlik intrahepatiline kolestaas
- Autosoomne retsessiivne
Intrahepaatilise kolestaasi juhtum, mida põhjustab indiviidi genoomi pärilik muutus.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Fosfolipidiga seotud madala sisaldusega kolelitiaas
- Sapipõie haigus 1
Harvaesinev pärilik maksahaigus, mida iseloomustab sapi madal fosfolipiidide sisaldus ning sümptomaatiline ja korduv kolelitiaas, mis areneb enne 40. eluaastat.
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- Kolelitiaas
Sapipõies või sapiteedes moodustuvate kristalliseerunud sadestiste olemasolu, mis koosnevad peamiselt kolesteroolist, bilirubiinist ja sapist.
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Pärandumine
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas ABCB4 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 4,3 kb kogupikkusega 74 kb; neist 3840 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse ABCB4
215
kohad geenis ABCB4, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist 6 (2,8%) asuvad lõikudes, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
- Low mappability (6 kohta)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni ABCB4 74 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (4,3 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- ABCB11ATP binding cassette subfamily B member 11Jagab 1 haigust
- ATP8B1ATPase phospholipid transporting 8B1Jagab 1 haigust
- KIF12kinesin family member 12Jagab 1 haigust
- MYO5Bmyosin VBJagab 1 haigust
- NR1H4nuclear receptor subfamily 1 group H member 4Jagab 1 haigust
- PSKH1protein serine kinase H1Jagab 1 haigust
- TJP2tight junction protein 2Jagab 1 haigust
- USP53ubiquitin specific peptidase 53Jagab 1 haigust
- ZFYVE19zinc finger FYVE-type containing 19Jagab 1 haigust
Geeniga ABCB4 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida ABCB4 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the digestive system
- Bile duct proliferation
- Cholesterol gallstones
- Diarrhea
- Enlarged liver
- Gallstones
- Jaundice
- Portal fibrosis
- Portal inflammation
Näita veel 19 tunnust
- Scar tissue replaces healthy tissue in the liver
- Slowed or blocked flow of bile from liver
- Abdominal colic
- Impaired release of bile from liver
- Abnormality of the digestive system
- Accumulation of fluid in the abdomen
- Bile duct inflammation
- Biliary tract obstruction
- Gallbladder inflammation
- Hepatocellular carcinoma
- Liver cancer
- Pancreatic inflammation
- Abdominal pain
- Abnormality of the pancreas
- Biliary cirrhosis
- Liver abscess
- Sclerosing cholangitis
- Hepatic fibrosis
- Malabsorption
Laboratory abnormality
- Elevated gamma-glutamyltransferase level
- High liver enzymes
- Increased serum bile acid concentration
- Elevated alkaline phosphatase
- Elevated serum cholesterol
- High blood bilirubin levels
- Diabetes mellitus
- Abnormal liver function tests during pregnancy
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). ABCB4 geen: ATP binding cassette subfamily B member 4. Vaadatud 16. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/abcb4
Dante Labs. ABCB4 geen: ATP binding cassette subfamily B member 4 [Internet]. [viidatud 16. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/abcb4
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast