Gen
EXT1
exostosin glycosyltransferase 1
- HGNC 3512↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000182197↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 2131↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 8q24.11
- Koordinater
- Kromosom 8: 117.794.490–118.111.826 (GRCh38)
- Exoner
- 11 exoner fordelt over 317,3 kb
- Protein
- 746 aminosyrer
- Også kendt som
- ttv
- Tidligere symboler
- LGCR, LGS
- MANE Select-transkript
- ENST00000378204.7NM_000127.3
- Lokustype
- Proteinkodende
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ext1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs EXT1 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurateret rapport relevant for dette gen
Hereditær multipel osteokondrom
- Autosomal dominant
En tilstand, der hovedsageligt skyldes varianter i EXT1 eller EXT2, hvor godartede knoglevækster med bruskhætte udvikler sig i enderne af de lange knogler.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 4 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
▶Handlingsrelevans
Viden gør det muligt at overvåge for vækstproblemer og for den lille livstidsrisiko (ca. 2 til 5 %) for, at en osteokondrom udvikler sig til et kondrosarkom.
Sådan er EXT1 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 8,2 kb af genets 317,3 kb; 2.241 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af EXT1
397
positioner i EXT1, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte reads har svært ved at finde.
En hel genomsekventering dækker alle 317,3 kb af EXT1, inklusive introns, og ikke kun de 8,2 kb af exons.
ClinVar pathogenic variants (481)
The EXT1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 433
- Patogen/sandsynligvis patogen 3
- Sandsynligvis patogen 45
| Variant | Conditions | ClinVar-klassifikation | Gennemgangsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_000127.3(EXT1):c.1911C>A (p.Tyr637Ter) (opens in a new tab) | hereditary multiple osteochondromas | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000127.3(EXT1):c.1773del (p.Tyr592fs) (opens in a new tab) | hereditary multiple osteochondromas | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000127.3(EXT1):c.1633-1G>A (opens in a new tab) | hereditary multiple osteochondromas | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000127.3(EXT1):c.1469del (p.Leu490fs) (opens in a new tab) | chondrosarcoma and 2 others | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000127.3(EXT1):c.1468dup (p.Leu490fs) (opens in a new tab) | chondrosarcoma and 2 others | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000127.3(EXT1):c.1315_1337dup (p.Asn446_Lys447insHisValThrValTer) (opens in a new tab) | hereditary multiple osteochondromas | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000127.3(EXT1):c.1019G>T (p.Arg340Leu) (opens in a new tab) | chondrosarcoma and 2 others | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000127.3(EXT1):c.1019G>A (p.Arg340His) (opens in a new tab) | exostoses, multiple, type 1 and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000127.3(EXT1):c.1018C>T (p.Arg340Cys) (opens in a new tab) | chondrosarcoma and 2 others | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000127.3(EXT1):c.963-2A>G (opens in a new tab) | hereditary multiple osteochondromas | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000127.3(EXT1):c.2101C>T (p.Arg701Ter) (opens in a new tab) | exostoses, multiple, type 1 and 1 other | Patogen/sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000127.3(EXT1):c.608A>G (p.Tyr203Cys) (opens in a new tab) | hereditary multiple osteochondromas | Patogen/sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000127.3(EXT1):c.70G>T (p.Gly24Ter) (opens in a new tab) | exostoses, multiple, type 1 and 1 other | Patogen/sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000127.3(EXT1):c.2055+52_*298del (opens in a new tab) | exostoses, multiple, type 1 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000127.3(EXT1):c.2133G>A (p.Trp711Ter) (opens in a new tab) | hereditary multiple osteochondromas | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000127.3(EXT1):c.2132G>A (p.Trp711Ter) (opens in a new tab) | hereditary multiple osteochondromas | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000127.3(EXT1):c.2131del (p.Trp711fs) (opens in a new tab) | hereditary multiple osteochondromas | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000127.3(EXT1):c.2119dup (p.Thr707fs) (opens in a new tab) | hereditary multiple osteochondromas | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000127.3(EXT1):c.2115del (p.Met705fs) (opens in a new tab) | hereditary multiple osteochondromas | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000127.3(EXT1):c.2107_2108del (p.Ser703fs) (opens in a new tab) | hereditary multiple osteochondromas | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000127.3(EXT1):c.2104C>T (p.Gln702Ter) (opens in a new tab) | hereditary multiple osteochondromas | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000127.3(EXT1):c.2077del (p.Ala693fs) (opens in a new tab) | chondrosarcoma and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000127.3(EXT1):c.2065del (p.Ala689fs) (opens in a new tab) | hereditary multiple osteochondromas | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000127.3(EXT1):c.2059del (p.Ser687fs) (opens in a new tab) | hereditary multiple osteochondromas | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000127.3(EXT1):c.2053C>T (p.Gln685Ter) (opens in a new tab) | exostoses, multiple, type 1 and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
See all 481 with every other EXT1 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Gener knyttet til de samme sygdomme
Træk knyttet til EXT1
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, EXT1 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of limbs
- Cone-shaped end part of finger bones
- Abnormal shape of bones of the lower limbs
- Abnormality of the knee
- Abnormality of the thighbone
- Deformed forearm bones
- Abnormal morphology of ulna
- Abnormal shape of hand
- Abnormality of the calf bone
Vis 22 træk mere
- Abnormality of the shankbone
- Avascular necrosis of the capital femoral epiphysis
- Bilateral single transverse palmar creases
- Bowing of the long bones
- Broad wide portion of long bone
- Coxa valga
- Deformed radius
- Femoroacetabular impingement
- Forearm undergrowth
- Knock knees
- Left and right leg differ in length or width
- Limb undergrowth
- Limitation of knee mobility
- Short fingers or toes
- Short lower limbs
- Shortened long bone of hand
- Talipes
- Abnormal ankle bones
- Abnormal wrist bones
- Talipes valgus
- Coxa vara
- Madelung-like forearm deformities
Abnormality of the musculoskeletal system
- Multiple exostoses
- Osteochondroma
- Bone pain
- Delayed bone maturation
- Formation of new noncancerous bone on top of existing bone
- Multiple long-bone exostoses
- Abnormal bone structure
- Abnormal shape of cartilage
Vis 18 træk mere
- Double-Jointed
- Functional motor deficit
- Joint dislocation
- Limitation of joint mobility
- Abnormal formation of the hip
- Arthritis
- Bursitis
- Chondrosarcoma
- Limited hip movement
- Low muscle tone
- Short long bone
- Abnormal shape of pelvis bone
- Bone fracture
- Neuropathic spinal arthropathy
- Rib exostoses
- Scapular exostoses
- Pelvic bone exostoses
- Protuberances at ends of long bones
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor det kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-18: hvilke tilstande genet er forbundet med, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende steder og de regioner, som korte læsninger har svært ved.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.18-8b139e39.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). EXT1-genet: exostosin glycosyltransferase 1. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/ext1
Dante Labs. EXT1-genet: exostosin glycosyltransferase 1 [Internet]. [citeret 18. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/ext1
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger