Gén
ZNF423
zinc finger protein 423
- HGNC 16762↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000102935↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 23090↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 16q12.1
- Koordináták
- 16. kromoszóma: 49 487 524–49 856 112 (GRCh38)
- Exonok
- 8 exon, összesen 368,6 kb
- Fehérje
- 1292 aminosav
- Más néven ismert
- KIAA0760, OAZ, hOAZ, Ebfaz, Zfp104, NPHP14, JBTS19
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000563137.7NM_001379286.1
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/znf423.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a ZNF423-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Joubert Syndrome And Related Disorders
- Joubert Syndrome
A ciliopathy defined by a malformation of the cerebellum and brainstem (the molar tooth sign), with low muscle tone, developmental delay and abnormal eye movements, sometimes with kidney, liver or eye involvement.
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Nephronophthisis and Senior-Løken Syndrome
- NephronophthisisAutoszomális recesszív
A recessively inherited kidney disease, caused by variants in NPHP1 and other cilia genes, in which progressive tubulointerstitial scarring leads to kidney failure, typically in the first three decades of life.
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Knowing allows regular kidney function monitoring, timely planning for dialysis or transplantation, and carrier testing for relatives.
A ZNF423 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 368,6 kb-jából 8 kb-ot tesznek ki; ezek közül 3879 bázis kódolja a fehérjét.
ZNF423 szekvenálása
4Könnyű
Mennyire nehéz a ZNF423 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból
0 · Könnyű100 · Nehéz
A ZNF423 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.
Ami tovább nehezíti: a ZNF423 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így a hívás ott hiányozhat vagy hibás lehet. Súly: 100%.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genom más helyein lévő másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Súly: 60%.0%
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Súly: 60%.0%
- Referencia-lefedettségA közeli referencia-összeszerelés hiányai, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez az olvasatok igazodhatnának. Súly: 50%.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló ismétlések, amelyeken az olvasatok megcsúsznak, és amelyeket esetleg nem fognak át. Súly: 30%.3,4%
- GC-tartalomOlyan szakaszok, ahol a G és C bázisok aránya 25% alatti vagy 65% feletti, és amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Súly: 20%.14%
A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk kiMinden oszlop a ZNF423 exonbázisainak azon arányát mutatja, amely az adott típusú nehéz régióban van. Bármelyik típus önmagában is nehézzé teheti a gént, a további típusok azonban egyre kevesebbet adnak hozzá: 0, ha egy bázis sem esik egyik típusba sem, 100, ha minden bázis olyan helyen van, ahol az olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- NPHP1nephrocystin 12 betegséget oszt meg
- TMEM67transmembrane protein 672 betegséget oszt meg
- ADAMTS9ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 91 betegséget oszt meg
- AHI1Abelson helper integration site 11 betegséget oszt meg
- ANKS6ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 61 betegséget oszt meg
- ARL13BARF like GTPase 13B1 betegséget oszt meg
- ARL3ARF like GTPase 31 betegséget oszt meg
- ARMC9armadillo repeat containing 91 betegséget oszt meg
- B9D1B9 domain containing 11 betegséget oszt meg
- B9D2B9 domain containing 21 betegséget oszt meg
- CC2D2Acoiled-coil and C2 domain containing 2A1 betegséget oszt meg
- CEP104centrosomal protein 1041 betegséget oszt meg
A(z) ZNF423 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) ZNF423 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Molar tooth sign on MRI
- Autism spectrum disorder
- Behavioral abnormality
- Abnormality of neuronal migration
Még 3 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the eye
- Breakdown of light-sensitive cells in back of eye
- Birth defect that causes a hole in the innermost layer at the back of the eye
- Blindness
- Cat eye
- Drooping upper eyelid
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Visual impairment
- Cross-eyed
Még 1 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-19 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.19-9814e911.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). ZNF423 gén: zinc finger protein 423. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/znf423
Dante Labs. ZNF423 gén: zinc finger protein 423 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/znf423
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt