Gène
SUMF1
sulfatase modifying factor 1
- HGNC 20376↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000144455↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 285362↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 3p26.1
- Coordonnées
- Chromosome 3 : 4 361 146–4 467 269 (GRCh38)
- Exons
- 9 exons sur 106,1 kb
- Protéine
- 374 acides aminés
- Aussi appelé
- FGE, UNQ3037
- Transcrit MANE Select
- ENST00000272902.10NM_182760.4
- Type de locus
- gene with protein product
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
Génome de référenceGRCh38hg38
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Obtenir mon Genome TestRapport d'expertise pertinent pour ce gène
Maladie de surcharge lysosomale
- Maladie de surcharge lysosomale (autres types et types non précisés)
L'un des 59 gènes qui lui sont liés
Couvre les maladies de surcharge lysosomale sans rapport dédié, telles que la maladie de Farber et d'autres troubles liés à ASAH1, les déficits en prosaposine (PSAP), le déficit en sulfatases multiples, les mucopolysaccharidoses de types IX et X, et la maladie de Dorfman-Chanarin ; le mode de transmission varie selon le sous-type, le plus souvent autosomique récessif.
- ClinGen classe ce lien comme définitif
- 6 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Structure de SUMF1
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 2,1 kb sur les 106,1 kb du gène ; 1 125 de ces bases codent pour la protéine.
Comment un test génomique lit SUMF1
144
positions dans SUMF1 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène
Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.
Un génome entier couvre les 106,1 kb de SUMF1, introns compris, et pas seulement les 2,1 kb d'exons.
Gènes liés aux mêmes affections
- ABHD5abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferasePartage 1 affection
- AGAaspartylglucosaminidasePartage 1 affection
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Partage 1 affection
- ARSAarylsulfatase APartage 1 affection
- ARSBarylsulfatase BPartage 1 affection
- ARSKarylsulfatase family member KPartage 1 affection
- ASAH1N-acylsphingosine amidohydrolase 1Partage 1 affection
- CLCN6Cl-/H+ antiporter 6Partage 1 affection
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, batteninPartage 1 affection
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthasePartage 1 affection
- CLN6CLN6 transmembrane ER proteinPartage 1 affection
- CLN8CLN8 transmembrane ER and ERGIC proteinPartage 1 affection
Traits associés à SUMF1
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que SUMF1 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où viennent ces informations
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène SUMF1 : sulfatase modifying factor 1. Consulté le 16 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/sumf1
Dante Labs. Gène SUMF1 : sulfatase modifying factor 1 [Internet]. [consulté le 16 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/sumf1
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