Gen
SUMF1
sulfatase modifying factor 1
- HGNC 20376↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000144455↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 285362↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 3p26.1
- Koordinater
- Kromosom 3: 4 361 146–4 467 269 (GRCh38)
- Exoner
- 9 exoner på 106,1 kb
- Protein
- 374 aminosyror
- Även känd som
- FGE, UNQ3037
- MANE Select-transkript
- ENST00000272902.10NM_182760.4
- Lokustyp
- Protein-coding
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/sumf1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs SUMF1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Lysosomal lagringssjukdom
- Lysosomal lagringssjukdom (andra och ospecificerade typer)
En av 59 gener kopplade till den
Omfattar lysosomala lagringssjukdomar utan egen rapport, till exempel Farbers sjukdom och andra ASAH1-relaterade sjukdomar, brist på prosaposin (PSAP), multipel sulfatasbrist, mukopolysackaridos typ IX och X samt Dorfman-Chanarins sjukdom; nedärvningen varierar mellan undertyperna, oftast autosomalt recessiv.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 6 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Så är SUMF1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 2,1 kb av genens 106,1 kb, och 1 125 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av SUMF1
144
positioner i SUMF1 där ClinVar klassificerar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i en region som korta läsningar har svårt att täcka.
En helgenomsekvensering täcker alla 106,1 kb av SUMF1, inklusive introner, och inte bara de 2,1 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- ABHD5abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferaseDelar 1 tillstånd
- AGAaspartylglucosaminidaseDelar 1 tillstånd
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Delar 1 tillstånd
- ARSAarylsulfatase ADelar 1 tillstånd
- ARSBarylsulfatase BDelar 1 tillstånd
- ARSKarylsulfatase family member KDelar 1 tillstånd
- ASAH1N-acylsphingosine amidohydrolase 1Delar 1 tillstånd
- CLCN6Cl-/H+ antiporter 6Delar 1 tillstånd
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, batteninDelar 1 tillstånd
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthaseDelar 1 tillstånd
- CLN6CLN6 transmembrane ER proteinDelar 1 tillstånd
- CLN8CLN8 transmembrane ER and ERGIC proteinDelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till SUMF1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SUMF1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SUMF1-genen: sulfatase modifying factor 1. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/sumf1
Dante Labs. SUMF1-genen: sulfatase modifying factor 1 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/sumf1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor