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Gène

SLCO2A1

solute carrier organic anion transporter family member 2A1

Résumé

Localisation cytogénétique
3q22.1-q22.2
Coordonnées
Chromosome 3 : 133 932 701–134 029 925 (GRCh38)
Exons
14 exons sur 97,2 kb
Protéine
643 acides aminés
Aussi appelé
PGT, OATP2A1
Symboles précédents
SLC21A2, MATR1
Transcrit MANE Select
ENST00000310926.11NM_005630.3
Type de locus
Protein-coding
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SLCO2A1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SLCO2A1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 3, avec un crochet à l'emplacement de SLCO2A1. SLCO2A1 et 8 gènes à proximité sur le chromosome 3, de 133 481 313 à 134 481 312.Chromosome 33q22.1-q22.2p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29133,6 Mb133,8 Mb134 Mb134,2 Mb134,4 MbCDV3 : 133 573 543–133 590 274, brin directCDV3TOPBP1 : 133 598 175–133 662 380, brin inverseTOPBP1TF : 133 745 862–133 796 641, brin directTFSRPRB : 133 784 023–133 825 772, brin directSRPRBRAB6B : 133 819 939–133 895 889, brin inverseRAB6BSLCO2A1 : 133 932 701–134 029 925, brin inverseSLCO2A1RYK : 134 065 303–134 250 929, brin inverseRYKAMOTL2 : 134 355 347–134 375 479, brin inverseAMOTL2ANAPC13 : 134 476 251–134 486 716, brin inverseANAPC13Schéma de SLCO2A1 : 14 exons sur le brin inverse du chromosome 3Exon 13 : 2 sites connus associés à une maladieExon 11 : 2 sites connus associés à une maladieExon 10 : 1 site connu associé à une maladieExon 9 : 3 sites connus associés à une maladieExon 8 : 2 sites connus associés à une maladieExon 6 : 1 site connu associé à une maladieExon 5 : 2 sites connus associés à une maladieExon 4 : 3 sites connus associés à une maladieExon 3 : 2 sites connus associés à une maladieExon 2 : 3 sites connus associés à une maladieExon 14 : 133 932 701–133 934 830, 2 130 basesExon 13 : 133 935 774–133 935 897, 124 basesExon 12 : 133 938 429–133 938 493, 65 basesExon 11 : 133 942 605–133 942 768, 164 basesExon 10 : 133 945 095–133 945 260, 166 basesExon 9 : 133 947 256–133 947 445, 190 basesExon 8 : 133 948 536–133 948 700, 165 basesExon 7 : 133 948 893–133 948 971, 79 basesExon 6 : 133 951 208–133 951 344, 137 basesExon 5 : 133 953 663–133 953 761, 99 basesExon 4 : 133 954 966–133 955 193, 228 basesExon 3 : 133 973 663–133 973 825, 163 basesExon 2 : 133 979 481–133 979 618, 138 basesExon 1 : 134 029 707–134 029 925, 219 bases141210864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4,1 kb sur les 97,2 kb du gène ; 1 932 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de SLCO2A1

26

positions de SLCO2A1 où ClinVar classe une variante comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 97,2 kb de SLCO2A1, introns compris, et pas seulement les 4,1 kb d'exons.

Traits associés à SLCO2A1

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que SLCO2A1 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.17-8666dff2.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SLCO2A1 : solute carrier organic anion transporter family member 2A1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/slco2a1

Vancouver

Dante Labs. Gène SLCO2A1 : solute carrier organic anion transporter family member 2A1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/slco2a1

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