Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

SLCO2A1

solute carrier organic anion transporter family member 2A1

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
3q22.1-q22.2
Koordinaadid
Kromosoom 3: 133 932 701–134 029 925 (GRCh38)
Eksonid
14 eksonit, ulatus 97,2 kb
Valk
643 aminohapet
Tuntud ka kui
PGT, OATP2A1
Varasemad tähised
SLC21A2, MATR1
MANE Select transkript
ENST00000310926.11NM_005630.3
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni SLCO2A1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas SLCO2A1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 3, millel on sulg kohal, kus asub SLCO2A1. SLCO2A1 ja sellele lähedal asuvad 8 geeni kromosoomil 3, vahemikus 133 481 313 kuni 134 481 312.Kromosoom 33q22.1-q22.2p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29133,6 Mb133,8 Mb134 Mb134,2 Mb134,4 MbCDV3: 133 573 543–133 590 274, otsene ahelCDV3TOPBP1: 133 598 175–133 662 380, pöördne ahelTOPBP1TF: 133 745 862–133 796 641, otsene ahelTFSRPRB: 133 784 023–133 825 772, otsene ahelSRPRBRAB6B: 133 819 939–133 895 889, pöördne ahelRAB6BSLCO2A1: 133 932 701–134 029 925, pöördne ahelSLCO2A1RYK: 134 065 303–134 250 929, pöördne ahelRYKAMOTL2: 134 355 347–134 375 479, pöördne ahelAMOTL2ANAPC13: 134 476 251–134 486 716, pöördne ahelANAPC13SLCO2A1 skeem: 14 eksonit kromosoomi 3 pöördne ahelalEkson 13: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 11: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 10: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 9: 3 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 8: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 6: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 5: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 4: 3 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 3: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 2: 3 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 14: 133 932 701–133 934 830, 2130 alustEkson 13: 133 935 774–133 935 897, 124 alustEkson 12: 133 938 429–133 938 493, 65 alustEkson 11: 133 942 605–133 942 768, 164 alustEkson 10: 133 945 095–133 945 260, 166 alustEkson 9: 133 947 256–133 947 445, 190 alustEkson 8: 133 948 536–133 948 700, 165 alustEkson 7: 133 948 893–133 948 971, 79 alustEkson 6: 133 951 208–133 951 344, 137 alustEkson 5: 133 953 663–133 953 761, 99 alustEkson 4: 133 954 966–133 955 193, 228 alustEkson 3: 133 973 663–133 973 825, 163 alustEkson 2: 133 979 481–133 979 618, 138 alustEkson 1: 134 029 707–134 029 925, 219 alust141210864215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 4,1 kb kogupikkusega 97,2 kb; neist 1932 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse SLCO2A1

26

kohad geenis SLCO2A1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni SLCO2A1 97,2 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (4,1 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). SLCO2A1 geen: solute carrier organic anion transporter family member 2A1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/slco2a1

Vancouver

Dante Labs. SLCO2A1 geen: solute carrier organic anion transporter family member 2A1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/slco2a1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test