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Gene

SLCO2A1

solute carrier organic anion transporter family member 2A1

Sintesi

Localizzazione citogenetica
3q22.1-q22.2
Coordinate
Cromosoma 3: 133.932.701–134.029.925 (GRCh38)
Esoni
14 esoni su 97,2 kb
Proteina
643 amminoacidi
Noto anche come
PGT, OATP2A1
Simboli precedenti
SLC21A2, MATR1
Trascritto MANE Select
ENST00000310926.11NM_005630.3
Tipo di locus
Protein-coding
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora SLCO2A1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di SLCO2A1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 3, con una parentesi dove si trova SLCO2A1. SLCO2A1 e 8 geni nelle vicinanze sul cromosoma 3, da 133.481.313 a 134.481.312.Cromosoma 33q22.1-q22.2p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29133,6 Mb133,8 Mb134 Mb134,2 Mb134,4 MbCDV3: 133.573.543–133.590.274, filamento direttoCDV3TOPBP1: 133.598.175–133.662.380, filamento inversoTOPBP1TF: 133.745.862–133.796.641, filamento direttoTFSRPRB: 133.784.023–133.825.772, filamento direttoSRPRBRAB6B: 133.819.939–133.895.889, filamento inversoRAB6BSLCO2A1: 133.932.701–134.029.925, filamento inversoSLCO2A1RYK: 134.065.303–134.250.929, filamento inversoRYKAMOTL2: 134.355.347–134.375.479, filamento inversoAMOTL2ANAPC13: 134.476.251–134.486.716, filamento inversoANAPC13Diagramma di SLCO2A1: 14 esoni sul filamento inverso del cromosoma 3Esone 13: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 11: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 10: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 9: 3 siti noti causativi di malattiaEsone 8: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 6: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 5: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 4: 3 siti noti causativi di malattiaEsone 3: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 2: 3 siti noti causativi di malattiaEsone 14: 133.932.701–133.934.830, 2130 basiEsone 13: 133.935.774–133.935.897, 124 basiEsone 12: 133.938.429–133.938.493, 65 basiEsone 11: 133.942.605–133.942.768, 164 basiEsone 10: 133.945.095–133.945.260, 166 basiEsone 9: 133.947.256–133.947.445, 190 basiEsone 8: 133.948.536–133.948.700, 165 basiEsone 7: 133.948.893–133.948.971, 79 basiEsone 6: 133.951.208–133.951.344, 137 basiEsone 5: 133.953.663–133.953.761, 99 basiEsone 4: 133.954.966–133.955.193, 228 basiEsone 3: 133.973.663–133.973.825, 163 basiEsone 2: 133.979.481–133.979.618, 138 basiEsone 1: 134.029.707–134.029.925, 219 basi141210864215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 4,1 kb dei 97,2 kb del gene; 1932 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di SLCO2A1

26

posizioni in SLCO2A1 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di queste ricade in una regione che le letture corte faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 97,2 kb di SLCO2A1, introni compresi, non solo i 4,1 kb di esoni.

Tratti collegati a SLCO2A1

L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che SLCO2A1 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.17-8666dff2.

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Dante Labs. (s.d.). Gene SLCO2A1: solute carrier organic anion transporter family member 2A1. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/slco2a1

Vancouver

Dante Labs. Gene SLCO2A1: solute carrier organic anion transporter family member 2A1 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/slco2a1

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