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Gène

SCARF2

scavenger receptor class F member 2

Résumé

Localisation cytogénétique
22q11.21
Coordonnées
Chromosome 22 : 20 424 584–20 437 825 (GRCh38)
Exons
11 exons sur 13,2 kb
Protéine
866 acides aminés
Aussi appelé
SREC-II, SREC2, HUMZD58C02
Transcrit MANE Select
ENST00000622235.5NM_182895.5
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SCARF2. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SCARF2

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 22, avec un crochet à l'emplacement de SCARF2. SCARF2 et 19 gènes à proximité sur le chromosome 22, de 19 931 205 à 20 931 204.Chromosome 2222q11.21p13p12p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.31q13.32q13.3320 Mb20,2 Mb20,4 Mb20,6 Mb20,8 MbTXNRD2 : 19 875 517–19 941 934, brin inverseTXNRD2COMT : 19 941 371–19 969 975, brin directCOMTARVCF : 19 969 866–20 016 862, brin inverseARVCFTANGO2 : 20 016 615–20 067 962, brin directTANGO2DGCR8 : 20 080 025–20 111 877, brin directTRMT2A : 20 111 866–20 117 392, brin inverseTRMT2ARANBP1 : 20 115 877–20 128 037, brin directRANBP1ZDHHC8 : 20 129 456–20 148 007, brin directZDHHC8CCDC188 : 20 146 381–20 151 059, brin inverseCCDC188RTN4R : 20 241 415–20 283 246, brin inverseRTN4RDGCR6L : 20 312 140–20 320 085, brin inverseDGCR6LZNF74 : 20 394 115–20 409 406, brin directZNF74SCARF2 : 20 424 584–20 437 825, brin inverseSCARF2 : 20 429 241–20 446 620, brin inverseKLHL22 : 20 441 519–20 496 893, brin inverseKLHL22MED15 : 20 495 913–20 587 632, brin directMED15PI4KA : 20 707 691–20 859 417, brin inversePI4KASERPIND1 : 20 774 092–20 787 721, brin directSERPIND1SNAP29 : 20 858 537–20 891 218, brin directSNAP29CRKL : 20 917 353–20 953 747, brin directCRKLSchéma de SCARF2 : 11 exons sur le brin inverse du chromosome 22Exon 11 : 1 site connu associé à une maladieExon 6 : 1 site connu associé à une maladieExon 5 : 1 site connu associé à une maladieExon 1 : 2 sites connus associés à une maladieExon 11 : 20 424 584–20 426 282, 1 699 basesExon 10 : 20 427 398–20 427 550, 153 basesExon 9 : 20 429 225–20 429 340, 116 basesExon 8 : 20 429 536–20 429 653, 118 basesExon 7 : 20 429 730–20 429 833, 104 basesExon 6 : 20 430 429–20 430 557, 129 basesExon 5 : 20 430 690–20 430 908, 219 basesExon 4 : 20 431 018–20 431 537, 520 basesExon 3 : 20 431 745–20 431 846, 102 basesExon 2 : 20 431 930–20 431 988, 59 basesExon 1 : 20 437 582–20 437 825, 244 bases1110864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,5 kb sur les 13,2 kb du gène ; 2 601 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit SCARF2

5

positions dans SCARF2 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 13,2 kb de SCARF2, introns compris, et pas seulement les 3,5 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SCARF2 : scavenger receptor class F member 2. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/scarf2

Vancouver

Dante Labs. Gène SCARF2 : scavenger receptor class F member 2 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/scarf2

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