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Gène

CCDC188

coiled-coil domain containing 188

Résumé

Localisation cytogénétique
22q11.21
Coordonnées
Chromosome 22 : 20 148 416–20 151 055 (GRCh38)
Exons
9 exons sur 2,6 kb
Protéine
402 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000439765.4NM_001365892.2
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore CCDC188. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de CCDC188

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 22, avec un crochet à l'emplacement de CCDC188. CCDC188 et 21 gènes à proximité sur le chromosome 22, de 19 649 736 à 20 649 735.Chromosome 2222q11.21p13p12p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.31q13.32q13.3319,8 Mb20 Mb20,2 Mb20,4 Mb20,6 MbSEPTIN5 : 19 714 117–19 724 781, brin directSEPTIN5 : 19 717 220–19 724 772, brin directGP1BB : 19 723 539–19 724 776, brin directGP1BBTBX1 : 19 756 703–19 783 593, brin directTBX1GNB1L : 19 781 243–19 854 947, brin inverseGNB1LRTL10 : 19 846 138–19 854 939, brin inverseRTL10TXNRD2 : 19 875 517–19 941 934, brin inverseTXNRD2COMT : 19 941 371–19 969 975, brin directCOMTARVCF : 19 969 866–20 016 862, brin inverseARVCFTANGO2 : 20 016 615–20 067 962, brin directTANGO2DGCR8 : 20 080 025–20 111 877, brin directTRMT2A : 20 111 866–20 117 392, brin inverseTRMT2ARANBP1 : 20 115 877–20 128 037, brin directRANBP1ZDHHC8 : 20 129 456–20 148 007, brin directZDHHC8CCDC188 : 20 148 416–20 151 055, brin inverseCCDC188RTN4R : 20 241 415–20 283 246, brin inverseRTN4RDGCR6L : 20 312 140–20 320 085, brin inverseDGCR6LZNF74 : 20 394 115–20 409 406, brin directZNF74SCARF2 : 20 424 584–20 438 332, brin inverseSCARF2 : 20 429 241–20 446 620, brin inverseKLHL22 : 20 441 519–20 496 893, brin inverseKLHL22MED15 : 20 495 913–20 587 632, brin directMED15Schéma de CCDC188 : 9 exons sur le brin inverse du chromosome 22Exon 9 : 20 148 416–20 148 800, 385 basesExon 8 : 20 148 875–20 148 924, 50 basesExon 7 : 20 149 187–20 149 244, 58 basesExon 6 : 20 149 412–20 149 476, 65 basesExon 5 : 20 149 581–20 149 640, 60 basesExon 4 : 20 149 724–20 149 780, 57 basesExon 3 : 20 149 955–20 150 059, 105 basesExon 2 : 20 150 143–20 150 250, 108 basesExon 1 : 20 150 468–20 151 055, 588 bases9876543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,5 kb sur les 2,6 kb du gène ; 1 209 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène CCDC188 : coiled-coil domain containing 188. Consulté le 16 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ccdc188

Vancouver

Dante Labs. Gène CCDC188 : coiled-coil domain containing 188 [Internet]. [consulté le 16 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ccdc188

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