Gène
MAN2B2
mannosidase alpha class 2B member 2
- HGNC 29623↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000013288↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 23324↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 4p16.1
- Coordonnées
- Chromosome 4 : 6 575 189–6 623 362 (GRCh38)
- Exons
- 19 exons sur 48,2 kb
- Protéine
- 1 009 acides aminés
- Aussi appelé
- KIAA0935, EpMAN
- Transcrit MANE Select
- ENST00000285599.8NM_015274.3
- Type de locus
- Codant pour une protéine
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
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Structure de MAN2B2
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 5,1 kb sur les 48,2 kb du gène ; 3 030 de ces bases codent pour la protéine.
Séquençage de MAN2B2
2Faible
Difficulté de séquençage de MAN2B2 avec des lectures courtes, sur 100Chaque barre représente la part des bases d'exons de MAN2B2 situées dans ce type de région difficile. Le score les pondère selon le coût de chacune pour un appel en lecture courte : 0 lorsqu'aucune base ne se trouve dans une telle région, 100 lorsque chaque base se trouve dans toutes.
- CartographiabilitéZones où des lectures de 100 ou 250 pb ne peuvent pas être placées de façon unique, si bien qu'un appel à cet endroit peut être manquant ou erroné. Poids 35 %.0 %
- HomologieDuplications segmentaires : copies ailleurs dans le génome, comme les paralogues et les pseudogènes, à 90 % d'identité ou plus. Poids 30 %.0 %
- RépétitionsRépétitions en tandem et séquences d'une même base, sur lesquelles les lectures glissent et qu'elles peuvent ne pas couvrir entièrement. Poids 15 %.2,6 %
- Teneur en GCFenêtres dont le taux de G et de C est inférieur à 25 % ou supérieur à 65 %, que la préparation de la bibliothèque couvre mal. Poids 10 %.15 %
- Couverture de référenceLacunes de l'assemblage de référence à proximité, où il n'existe aucune séquence sur laquelle les lectures peuvent s'aligner. Poids 10 %.0 %
2
positions dans MAN2B2 où ClinVar classe une variation comme pathogène ou probablement pathogène
Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à couvrir.
Un génome complet couvre les 48,2 kb de MAN2B2, introns compris, et pas seulement les 5,1 kb d'exons.
Traits associés à MAN2B2
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que MAN2B2 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Abnormally low T cell receptor excision circle level
- Decreased blood lymphocyte number
- Decreased naive CD4+ T cell proportion
- Decreased naive CD8+ T cell proportion
- Decreased total CD4+ T cell proportion
- Increased CD21low B cell proportion
- Increased plasmablast proportion
- Inverted CD4:CD8 ratio
Afficher 3 traits supplémentaires
Abnormality of the nervous system
- Choking episodes
- Delayed ability to crawl
- Delayed ability to walk
- Delayed speech and language development
- Drowsiness
- Encephalomalacia
- Epilepsy
- Gliosis
Afficher 2 traits supplémentaires
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où proviennent ces données
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.17-8666dff2.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène MAN2B2 : mannosidase alpha class 2B member 2. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/man2b2
Dante Labs. Gène MAN2B2 : mannosidase alpha class 2B member 2 [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/man2b2
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