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Gène

HERC1

HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1

Résumé

Localisation cytogénétique
15q22.31
Coordonnées
Chromosome 15 : 63 608 618–63 833 948 (GRCh38)
Exons
78 exons sur 225,3 kb
Protéine
4 861 acides aminés
Aussi appelé
p532, p619
Transcrit MANE Select
ENST00000443617.7NM_003922.4
Type de locus
gene with protein product

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore HERC1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de HERC1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 15, avec un crochet à l'emplacement de HERC1. HERC1 et 12 gènes à proximité sur le chromosome 15, de 63 221 283 à 64 221 282.Chromosome 1515q22.31p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q14q15.1q15.2q15.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26.1q26.2q26.363,4 Mb63,6 Mb63,8 Mb64 Mb64,2 MbRAB8B : 63 189 530–63 268 167, brin directRAB8BAPH1B : 63 276 018–63 309 126, brin directAPH1BCA12 : 63 321 378–63 382 252, brin inverseCA12USP3 : 63 504 501–63 594 640, brin directUSP3FBXL22 : 63 597 199–63 609 030, brin directFBXL22HERC1 : 63 608 618–63 833 948, brin inverseHERC1DAPK2 : 63 907 033–64 072 033, brin inverseDAPK2CIAO2A : 64 072 113–64 094 262, brin inverseCIAO2ASNX1 : 64 094 123–64 146 571, brin directSNX1SNX22 : 64 151 601–64 157 481, brin directSNX22PPIB : 64 155 740–64 163 159, brin inversePPIBCSNK1G1 : 64 165 525–64 356 554, brin inverseCSNK1G1 : 64 181 180–64 381 440, brin inverseSchéma de HERC1 : 78 exons sur le brin inverse du chromosome 15Exon 76 : 1 site connu associé à une maladieExon 75 : 1 site connu associé à une maladieExon 74 : 1 site connu associé à une maladieExon 71 : 1 site connu associé à une maladieExon 68 : 1 site connu associé à une maladieExon 57 : 1 site connu associé à une maladieExon 42 : 1 site connu associé à une maladieExon 38 : 1 site connu associé à une maladieExon 13 : 1 site connu associé à une maladieExon 4 : 1 site connu associé à une maladieExon 2 : 1 site connu associé à une maladieExon 78 : 63 608 618–63 609 266, 649 basesExon 77 : 63 612 251–63 612 556, 306 basesExon 76 : 63 615 768–63 615 920, 153 basesExon 75 : 63 616 430–63 616 682, 253 basesExon 74 : 63 622 815–63 622 891, 77 basesExon 73 : 63 623 725–63 623 890, 166 basesExon 72 : 63 624 158–63 624 327, 170 basesExon 71 : 63 625 985–63 626 154, 170 basesExon 70 : 63 628 677–63 628 815, 139 basesExon 69 : 63 630 466–63 630 635, 170 basesExon 68 : 63 632 709–63 632 811, 103 basesExon 67 : 63 633 848–63 633 970, 123 basesExon 66 : 63 634 733–63 634 888, 156 basesExon 65 : 63 635 961–63 636 142, 182 basesExon 64 : 63 637 505–63 637 643, 139 basesExon 63 : 63 638 411–63 638 536, 126 basesExon 62 : 63 638 711–63 638 776, 66 basesExon 61 : 63 640 152–63 640 445, 294 basesExon 60 : 63 641 470–63 641 643, 174 basesExon 59 : 63 642 957–63 643 058, 102 basesExon 58 : 63 643 404–63 643 550, 147 basesExon 57 : 63 644 992–63 645 097, 106 basesExon 56 : 63 645 483–63 645 682, 200 basesExon 55 : 63 648 069–63 648 199, 131 basesExon 54 : 63 649 725–63 649 925, 201 basesExon 53 : 63 651 253–63 651 380, 128 basesExon 52 : 63 652 414–63 652 541, 128 basesExon 51 : 63 654 119–63 654 324, 206 basesExon 50 : 63 655 742–63 655 955, 214 basesExon 49 : 63 656 088–63 656 358, 271 basesExon 48 : 63 658 544–63 658 718, 175 basesExon 47 : 63 659 736–63 659 936, 201 basesExon 46 : 63 660 973–63 661 025, 53 basesExon 45 : 63 661 753–63 662 021, 269 basesExon 44 : 63 662 984–63 663 204, 221 basesExon 43 : 63 664 470–63 664 594, 125 basesExon 42 : 63 665 919–63 666 150, 232 basesExon 41 : 63 666 356–63 666 472, 117 basesExon 40 : 63 669 538–63 669 698, 161 basesExon 39 : 63 672 496–63 672 694, 199 basesExon 38 : 63 674 342–63 675 117, 776 basesExon 37 : 63 677 845–63 678 365, 521 basesExon 36 : 63 680 077–63 680 160, 84 basesExon 35 : 63 680 537–63 680 776, 240 basesExon 34 : 63 686 359–63 686 535, 177 basesExon 33 : 63 689 589–63 689 699, 111 basesExon 32 : 63 690 541–63 690 647, 107 basesExon 31 : 63 692 411–63 692 566, 156 basesExon 30 : 63 693 964–63 694 157, 194 basesExon 29 : 63 694 312–63 694 549, 238 basesExon 28 : 63 694 774–63 694 894, 121 basesExon 27 : 63 696 124–63 696 339, 216 basesExon 26 : 63 698 728–63 698 996, 269 basesExon 25 : 63 706 780–63 706 831, 52 basesExon 24 : 63 712 775–63 712 895, 121 basesExon 23 : 63 713 353–63 713 665, 313 basesExon 22 : 63 716 302–63 716 473, 172 basesExon 21 : 63 718 574–63 718 694, 121 basesExon 20 : 63 718 783–63 718 897, 115 basesExon 19 : 63 723 182–63 723 355, 174 basesExon 18 : 63 725 292–63 725 513, 222 basesExon 17 : 63 727 647–63 727 838, 192 basesExon 16 : 63 729 236–63 729 368, 133 basesExon 15 : 63 729 497–63 729 649, 153 basesExon 14 : 63 732 924–63 733 145, 222 basesExon 13 : 63 734 724–63 734 849, 126 basesExon 12 : 63 746 918–63 747 083, 166 basesExon 11 : 63 747 724–63 747 858, 135 basesExon 10 : 63 749 367–63 749 538, 172 basesExon 9 : 63 749 647–63 749 791, 145 basesExon 8 : 63 752 958–63 753 085, 128 basesExon 7 : 63 754 505–63 754 648, 144 basesExon 6 : 63 755 229–63 755 325, 97 basesExon 5 : 63 756 437–63 756 748, 312 basesExon 4 : 63 758 175–63 758 369, 195 basesExon 3 : 63 764 096–63 764 191, 96 basesExon 2 : 63 774 694–63 775 649, 956 basesExon 1 : 63 833 827–63 833 948, 122 bases787570656055504540353025201510515′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 15,2 kb sur les 225,3 kb du gène ; 14 586 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit HERC1

12

positions dans HERC1 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 225,3 kb de HERC1, introns compris, et pas seulement les 15,2 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène HERC1 : HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/herc1

Vancouver

Dante Labs. Gène HERC1 : HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/herc1

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