Geeni
LAMP2
lysosome associated membrane protein 2
- HGNC 6501↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000005893↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 3920↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- Xq24
- Koordinaatit
- Kromosomi X: 120 426 148–120 469 296 (GRCh38)
- Eksonit
- 9 eksonia 43,1 kb:n alueella
- Proteiini
- 410 aminohappoa
- Periytyminen
- X-kytkentäinen dominantti
- Tunnetaan myös nimellä
- CD107b
- MANE Select -transkripti
- ENST00000200639.9NM_002294.3
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue LAMP2 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Danonin tauti
- X-kytkentäinen dominantti
Hypertrofinen kardiomyopatia, rytmihäiriöt, mukaan lukien Wolff-Parkinson-White -kuvio, lihasheikkous, kehitysvamma ja verkkokalvon muutokset. Sairastuneilla miehillä vakava sydänsairaus kehittyy yleensä murrosiässä tai nuoressa aikuisiässä, naisilla myöhemmin.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 5 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Sydämen tiivis seuranta, defibrillaattorin asennus ja varhainen sydänsiirron arviointi ovat usein tarpeen, ja myös sukulaiset voidaan testata.
Laajemmat ryhmät
Lysosomaalinen varastosairaus
- Lysosomaalinen kertymäsairaus (muut ja määrittelemättömät tyypit)
Yksi 59 siihen liittyvästä geenistä
Kattaa lysosomaaliset kertymäsairaudet, joilla ei ole omaa raporttia, kuten Farberin tauti ja muut ASAH1-geeniin liittyvät sairaudet, prosapsiini- (PSAP) -puutokset, multippeli sulfataasipuutos, mukopolysakkaridoosi tyypit IX ja X sekä Dorfman-Chanarinin tauti. Periytymistapa vaihtelee alatyypeittäin, useimmiten autosomaalisesti resessiivinen.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 5 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Periytyminen
- X-kytkentäinen dominantti
- Muutos on X-kromosomissa, ja yksi kopio riittää. Muutoksen omaava äiti siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta. Isä siirtää sen kaikille tyttärilleen eikä yhdellekään pojalleen.
LAMP2-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 6,5 kb geenin 43,1 kb:stä; 1 233 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä LAMP2
96
LAMP2-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 43,1 kb geenistä LAMP2, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 6,5 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ABHD5abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferaseYhteinen sairaus: 1
- AGAaspartylglucosaminidaseYhteinen sairaus: 1
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Yhteinen sairaus: 1
- ARSAarylsulfatase AYhteinen sairaus: 1
- ARSBarylsulfatase BYhteinen sairaus: 1
- ARSKarylsulfatase family member KYhteinen sairaus: 1
- ASAH1N-acylsphingosine amidohydrolase 1Yhteinen sairaus: 1
- CLCN6Cl-/H+ antiporter 6Yhteinen sairaus: 1
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, batteninYhteinen sairaus: 1
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthaseYhteinen sairaus: 1
- CLN6CLN6 transmembrane ER proteinYhteinen sairaus: 1
- CLN8CLN8 transmembrane ER and ERGIC proteinYhteinen sairaus: 1
Geeniin LAMP2 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita LAMP2 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). LAMP2-geeni: lysosome associated membrane protein 2. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/lamp2
Dante Labs. LAMP2-geeni: lysosome associated membrane protein 2 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/lamp2
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa