Geeni
ABHD5
abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferase
- HGNC 21396↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000011198↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 51099↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 3p21.33
- Koordinaatit
- Kromosomi 3: 43 690 938–43 722 725 (GRCh38)
- Eksonit
- 7 eksonia 31,8 kb:n alueella
- Proteiini
- 349 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- CGI-58, NCIE2
- MANE Select -transkripti
- ENST00000644371.2NM_016006.6
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue ABHD5 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Lysosomaalinen varastosairaus
- Lysosomaalinen kertymäsairaus (muut ja määrittelemättömät tyypit)
Yksi 59 siihen liittyvästä geenistä
Kattaa lysosomaaliset kertymäsairaudet, joilla ei ole omaa raporttia, kuten Farberin tauti ja muut ASAH1-geeniin liittyvät sairaudet, prosapsiini- (PSAP) -puutokset, multippeli sulfataasipuutos, mukopolysakkaridoosi tyypit IX ja X sekä Dorfman-Chanarinin tauti. Periytymistapa vaihtelee alatyypeittäin, useimmiten autosomaalisesti resessiivinen.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
ABHD5-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 5,3 kb geenin 31,8 kb:stä; 1 050 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä ABHD5
11
ABHD5-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 31,8 kb geenistä ABHD5, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 5,3 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- AGAaspartylglucosaminidaseYhteinen sairaus: 1
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Yhteinen sairaus: 1
- ARSAarylsulfatase AYhteinen sairaus: 1
- ARSBarylsulfatase BYhteinen sairaus: 1
- ARSKarylsulfatase family member KYhteinen sairaus: 1
- ASAH1N-acylsphingosine amidohydrolase 1Yhteinen sairaus: 1
- CLCN6Cl-/H+ antiporter 6Yhteinen sairaus: 1
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, batteninYhteinen sairaus: 1
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthaseYhteinen sairaus: 1
- CLN6CLN6 transmembrane ER proteinYhteinen sairaus: 1
- CLN8CLN8 transmembrane ER and ERGIC proteinYhteinen sairaus: 1
- CTNScystinosin, lysosomal cystine transporterYhteinen sairaus: 1
Geeniin ABHD5 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita ABHD5 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). ABHD5-geeni: abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferase. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/abhd5
Dante Labs. ABHD5-geeni: abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferase [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/abhd5
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa