Geeni
DSG2
desmoglein 2
- HGNC 3049↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000046604↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 1829↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 18q12.1
- Koordinaatit
- Kromosomi 18: 31 498 177–31 549 008 (GRCh38)
- Eksonit
- 15 eksonia 50,8 kb:n alueella
- Proteiini
- 1 118 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- CDHF5
- MANE Select -transkripti
- ENST00000261590.13NM_001943.5
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue DSG2 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Arytmogeeninen kardiomyopatia
- Arytmogeeninen oikean kammion kardiomyopatia (ARVC)
Sydänlihaksen vähittäinen korvautuminen rasva- ja arpikudoksella, pääasiassa oikeassa kammiossa, mikä aiheuttaa kammiorytmihäiriöitä. Taustalla on yleensä muutoksia desmosomigeeneissä PKP2, DSP, DSG2, DSC2 ja JUP tai geeneissä TMEM43, PLN tai DES.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelossa
Mitä tieto muuttaa
Diagnoosi tukee säännöllistä rytmin seurantaa, neuvontaa kestävyysliikunnan rajoittamisesta, päätöksentekoa implantoitavasta defibrillaattorista sekä sukulaisten tutkimista.
DSG2-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
- Variantit, joilla on sivu
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 5,7 kb geenin 50,8 kb:stä; 3 357 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä DSG2
136
DSG2-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 50,8 kb geenistä DSG2, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 5,7 kb eksoneja.
Variantit, joilla on sivu (31)
Tässä ovat DSG2-variantit, joilla on sivu, eniten arvostelutähtiä saaneet ensin. Jokainen sivu kuvaa ClinVarin julkista tietuetta variantista, ei koskaan tulosta.
| Variantti | HGVS c. | Eksoni tai introni | Sijainti (GRCh38) | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|---|---|
| A753Lfs*15 | c.2257del | Eksoni 14 | 31 542 771 | Patogeeninen/todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
| c.523+1_523+2del | Eksoni 5 | 31 521 243 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja | |
| c.523+1G>A | Introni 5 | 31 521 244 | Patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja | |
| c.523+1G>T | Introni 5 | 31 521 244 | Patogeeninen/todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja | |
| c.523+2T>C | Introni 5 | 31 521 245 | Patogeeninen/todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja | |
| c.1423+1G>T | Introni 10 | 31 535 413 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja | |
| C591X | c.1773_1774del | Eksoni 12 | 31 538 869 | Patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
| D494A | c.1481A>C | Eksoni 11 | 31 536 259 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
| D794Pfs*16 | c.2375_2379dup | Eksoni 15 | 31 545 760 | Patogeeninen/todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
| E1018Gfs*20 | c.3052dup | Eksoni 15 | 31 546 435 | Patogeeninen/todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- CDH2cadherin 2Yhteinen sairaus: 1
- DESdesminYhteinen sairaus: 1
- DSC2desmocollin 2Yhteinen sairaus: 1
- DSPdesmoplakinYhteinen sairaus: 1
- JUPjunction plakoglobinYhteinen sairaus: 1
- PKP2plakophilin 2Yhteinen sairaus: 1
- PLNphospholambanYhteinen sairaus: 1
- RYR2ryanodine receptor 2Yhteinen sairaus: 1
- TMEM43transmembrane protein 43Yhteinen sairaus: 1
Geeniin DSG2 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita DSG2 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). DSG2-geeni: desmoglein 2. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/dsg2
Dante Labs. DSG2-geeni: desmoglein 2 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/dsg2
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa