Geen
TPI1
triosephosphate isomerase 1
- HGNC 12009↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000111669↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 7167↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 12p13.31
- Koordinaadid
- Kromosoom 12: 6 867 531–6 870 948 (GRCh38)
- Eksonid
- 7 eksonit, ulatus 3,4 kb
- Valk
- 249 aminohapet
- MANE Select transkript
- ENST00000396705.10NM_000365.6
- Lookuse tüüp
- Protein-coding
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tpi1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe TPI1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Pyruvatkinaasi defitsiit ja muud punaste vereliblede ensüümihäired
- Triosefosfaat-isomeraasi defitsiitAutosoomne retsessiivne
Autosomaalselt retsessiivne haigus, mida põhjustavad muutused geenis TPI1. Sellega kaasnevad hemolüütiline aneemia ja progresseeruvad närvi- ja lihasprobleemid, mis algavad varases lapseeas, ning sagedased infektsioonid.
- 2 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
▶Tegevusvõimalikkus
Diagnoos toetab sümptomaatilist ravi ja aitab kaasa perenõustamisele.
Kuidas TPI1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 1,4 kb kogupikkusega 3,4 kb; neist 750 alust kodeerivad valku.
Sekveneerimine: TPI1
3
TPI1 positsioonid, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu piirkonnas, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
Terve genoom katab kogu TPI1 geeni 3,4 kb ulatuses, sealhulgas intronid, mitte ainult 1,4 kb eksoneid.
Geeniga TPI1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida TPI1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Low muscle tone
- Muscle degeneration
- Diaphragmatic paralysis
- Decreased lung function due to weak breathing muscles
- Generalized decreased muscle tone
- Hunched back
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Muscle tissue disease
Näita veel 2 tunnust
Abnormality of the nervous system
- Central nervous system degeneration
- Degeneration of cerebrum
- Decreased nerve conduction velocity
- Decreased reflex response
- Dystonia
- Global developmental delay
- Peripheral neuropathy
- Tremor
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-17: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.17-8666dff2.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). TPI1 geen: triosephosphate isomerase 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/tpi1
Dante Labs. TPI1 geen: triosephosphate isomerase 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/tpi1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast