Gen
JAK2
Janus kinase 2
- HGNC 6192↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000096968↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 3717↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 9p24.1
- Koordinater
- Kromosom 9: 4.985.272–5.129.948 (GRCh38)
- Exoner
- 25 exoner fordelt over 144,7 kb
- Protein
- 1.132 aminosyrer, 130,7 kDa
- Også kendt som
- JTK10
- MANE Select-transkript
- ENST00000381652.4NM_004972.4
- Lokustype
- Proteinkodende
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Del denne side
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller anmod om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/jak2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs JAK2 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurateret rapport relevant for dette gen
Arvelig trombocytæmi (JAK2)
- Trombocytæmi 3Autosomal dominant
Forårsaget af en arvelig ændring i JAK2, som giver et signalprotein, der styrer produktionen af blodceller. De rapporterede ændringer ligger i de dele af proteinet, der styrer dets aktivitet, og gør det mere aktivt, hvilket øger blodpladeproduktionen. Den første beskrevne, JAK2 R564Q, blev fundet i en familie med dominant arvelig trombocytæmi.
- GenCC 22 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
▶Actionability
Opfølgning hos en hæmatolog, herunder overvågning af blodtal, da blodkræft er forekommet i nogle berørte familier. Evidensgrundlaget er begrænset, og der findes ingen aftalte retningslinjer for børn. Da den nedarves autosomalt dominant, har hvert barn af en berørt forælder en chance på 1 ud af 2 for at arve ændringen, og test af slægtninge kan vise, hvem andre der bærer den.
Læs JAK2 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestSådan er JAK2 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 7 kb af genets 144,7 kb; 3.399 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af JAK2
3Let
Hvor svær JAK2 er at sekventere med korte reads, ud af 100
0 · Let100 · Svær
Næsten alle eksonerne i JAK2 ligger, hvor korte reads kan kortlægges uden problemer.
Det der forstærker det: andelen af JAK2s eksoner i hver type svært område
- MappabilityStrækninger, hvor 100 eller 250 bp reads ikke kan placeres entydigt, så et kald der hører til her, kan mangle eller være forkert. Alene ville et gen, der helt ligger i denne type region, få en score på 100.0 %
- HomologiSegmentale duplikationer: kopier andre steder i genomet, fx paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mere. Alene ville et gen, der helt ligger i denne type region, få en score på 60.0 %
- Delt med chrYDe pseudoautosomale regioner og den X-transponerede region, hvor chrX og chrY har den samme eller næsten samme sekvens, så et read fra den ene kan blive placeret på den anden. Alene ville et gen, der helt ligger i denne type region, få en score på 60.0 %
- ReferencedækningHuller i referenceassemblyet i nærheden, hvor der ikke findes nogen sekvens, reads kan justeres til. Alene ville et gen, der helt ligger i denne type region, få en score på 50.0 %
- GentagelserTandemgentagelser og løb af én base, som reads glider på og måske ikke spænder over. Alene ville et gen, der helt ligger i denne type region, få en score på 30.2,7 %
- GC-indholdVinduer under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dækker tyndt. Alene ville et gen, der helt ligger i denne type region, få en score på 20.11 %
En Dante Labs-score baseret på vores egen forskning, bygget på NIST's Genome in a Bottle-kort over svært sekventerbare regioner.Sådan scores detHver søjle er andelen af JAK2s eksonbaser i den type svære region. En enkelt type kan alene gøre et gen svært, og hver ekstra type tilføjer mindre: 0, når ingen base er i nogen, 100, når alle baser ligger, hvor reads ikke kan placeres entydigt.
5
positioner i JAK2, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i et område, som korte reads har svært ved.
En helgenomanalyse dækker alle 144,7 kb af JAK2, inklusive introner, og ikke kun de 7 kb eksoner.
Patogene ClinVar-varianter (5)
De JAK2-varianter, som ClinVar klassificerer som patogene eller sandsynligvis patogene for en eller anden tilstand, og som er gennemgået af mindst én indsender med kriterier, samt de mest gennemgåede af dem. Det er ClinVars offentlige register over genet, aldrig et resultat.
- Patogen 1
- Sandsynligvis patogen 4
| Variant | Tilstande | ClinVar-klassifikation | Gennemgangsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_004972.4(JAK2):c.1849G>T (p.Val617Phe) | Budd-Chiari syndrome og 5 andre | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_004972.4(JAK2):c.1691G>A (p.Arg564Gln) | Budd-Chiari syndrome og 5 andre | Sandsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_004972.4(JAK2):c.2600G>A (p.Arg867Gln) | Budd-Chiari syndrome og 5 andre | Sandsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_004972.4(JAK2):c.2813G>A (p.Arg938Gln) | thrombocythemia 3 | Sandsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_004972.4(JAK2):c.3284C>T (p.Pro1095Leu) | acquired polycythemia vera | Sandsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
Træk knyttet til JAK2
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, JAK2 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Extramedullary hematopoiesis
- Increased circulating hemoglobin concentration
- Increased hematocrit
- Increased number of platelets in blood
- Myelofibrosis
- Abnormal shape of platelets
- Acute blood cancer
- Bleeding gums
Vis 36 træk mere
- Bleeding tendency
- Blood clot in artery
- Blood clot in vein
- Bloody nose
- Bone marrow disease
- Bruising susceptibility
- Increased megakaryocyte count
- Increased red blood cells
- Megakaryocyte nucleus hyperlobulation
- Myelodysplasia
- Platelet abnormalities
- Prolonged bleeding time
- Abnormal megakaryocyte morphology
- Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Blood clot in liver vein
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Low platelet count
- Abnormal blood clot
- Acute myeloid leukemia
- Blood clot in portal vein
- Blood spots
- Bone marrow hypercellularity
- Chronic myelogenous leukemia
- Ecchymosis
- Elevated white blood count
- Gastrointestinal bleeding
- Low blood cell count
- Petechiae
- Poikilocytosis
- Blood tumor
- Bleeding in brain
- Increased micromegakaryocyte count
- Increased red blood cell mass
- Myeloproliferative disorder
- Peripheral blood clot
- Thromboembolism
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transskriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-23: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG's liste over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved.
- Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: scoren for sekventeringsvanskelighed.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- AlphaFold DB-model AF-O60674-F1, version 6, fra Google DeepMind og EMBL-EBI (CC BY 4.0): proteinets struktur, som AlphaFold forudsiger den, ikke som den er målt, og modellens sikkerhed for hver del.
- Dataudgivelse 2026.10.23-dc0c0517.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). JAK2-genet: Janus kinase 2. Hentet 24. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/jak2
Dante Labs. JAK2-genet: Janus kinase 2 [Internet]. [citeret 24. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/jak2
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger