Gen
TOGARAM1
TOG array regulator of axonemal microtubules 1
- HGNC 19959↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000198718↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 23116↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 14q21.2
- Koordinatlar
- Kromozom 14: 44.962.190–45.074.431 (GRCh38)
- Eksonlar
- 112,2 kb boyunca 20 ekson
- Protein
- 1.773 amino asit
- Diğer adları
- Crescerin-1, crescerin
- Önceki semboller
- KIAA0423, FAM179B
- MANE Select transkripti
- ENST00000361462.7NM_001308120.2
- Lokus türü
- Protein kodlayan
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Bu sayfanın veri olarak görünümü
Veriyi JSON olarak okumak için sayfa adresinin sonuna .json ekleyin veya application/json isteyin.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/togaram1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameTOGARAM1 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili rapor
Joubert Sendromu ve İlgili Bozukluklar
- Joubert Sendromu
Serebellum ve beyin sapının malformasyonuyla (molar diş işareti) tanımlanan, düşük kas tonusu, gelişimsel gecikme ve anormal göz hareketleriyle seyreden, bazen böbrek, karaciğer veya göz tutulumuyla birlikte görülen bir siliopati.
- 2 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
TOGARAM1 geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 112,2 kb uzunluğunun 6,4 kb'sini oluşturur; bu bazların 5.322 tanesi proteini kodlar.
TOGARAM1 dizilemesi
1Düşük
100 üzerinden, TOGARAM1 genini kısa okumalarla dizilemenin ne kadar zor olduğuHer çubuk, TOGARAM1 geninin ekson bazlarının bu tür zorlu bölgelerdeki payını gösterir. Puan, bunları kısa okuma çağrısına maliyetlerine göre ağırlıklandırır: hiçbir baz herhangi birinde yer almadığında 0, her baz hepsinde yer aldığında 100.
- Eşlenebilirlik100 veya 250 bp'lik okumaların tek anlamlı şekilde yerleştirilemediği bölgeler; bu bölgelerdeki bir çağrı eksik ya da hatalı olabilir. Ağırlık %35.%0
- HomolojiSegmental duplikasyonlar: paralog ve psödogenler gibi genomun başka yerlerindeki, %90 ve üzeri benzerlikteki kopyalar. Ağırlık %30.%0
- TekrarlarOkumaların kaydığı ve kapsayamayabileceği tandem tekrarlar ile tek baz dizileri. Ağırlık %15.%1,5
- GC içeriği%25'in altında veya %65'in üzerinde G ve C oranına sahip pencereler; kütüphane hazırlığının yetersiz kapsadığı alanlar. Ağırlık %10.%2,9
- Referans kapsamıYakındaki referans dizilimindeki boşluklar; okumaların hizalanacağı bir dizinin bulunmadığı bölgeler. Ağırlık %10.%0
18
ClinVar'ın patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı bir değişikliğin TOGARAM1 içindeki konumları
Bunlardan hiçbiri, kısa okumaların zorlandığı bir bölgeye düşmüyor.
Tüm genom, intronlar dahil, TOGARAM1 genin tamamı olan 112,2 kb'yi kapsar; yalnızca 6,4 kb'lik ekzonları değil.
Aynı durumlarla ilişkili genler
- AHI1Abelson helper integration site 11 durumu paylaşıyor
- ARL13BARF like GTPase 13B1 durumu paylaşıyor
- ARL3ARF like GTPase 31 durumu paylaşıyor
- ARMC9armadillo repeat containing 91 durumu paylaşıyor
- B9D1B9 domain containing 11 durumu paylaşıyor
- B9D2B9 domain containing 21 durumu paylaşıyor
- CC2D2Acoiled-coil and C2 domain containing 2A1 durumu paylaşıyor
- CEP104centrosomal protein 1041 durumu paylaşıyor
- CEP120centrosomal protein 1201 durumu paylaşıyor
- CEP290centrosomal protein 2901 durumu paylaşıyor
- CEP41centrosomal protein 411 durumu paylaşıyor
- CPLANE1ciliogenesis and planar polarity effector complex subunit 11 durumu paylaşıyor
TOGARAM1 ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, TOGARAM1 geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Abnormality of the eye
- Oculomotor apraxia
- Deeply set eye
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Wide-set eyes
- Abnormally small eyeball
- Cat eye
- Cross-eyed
- Drooping upper eyelid
1 özellik daha göster
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
- 2026-10-17 tarihli GenCC ve ClinGen: genin hangi durumlarla ilişkili olduğu ve bu ilişkinin ne kadar güçlü olduğu.
- ACMG ikincil bulgular listesi, SF v3.2.
- ClinVar ve GIAB tabakalandırmaları: bilinen hastalığa neden olan bölgeler ve kısa okumaların zorlandığı alanlar.
- NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
- Veri sürümü 2026.10.17-8666dff2.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). TOGARAM1 geni: TOG array regulator of axonemal microtubules 1. Erişim tarihi: 18 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/togaram1
Dante Labs. TOGARAM1 geni: TOG array regulator of axonemal microtubules 1 [Internet]. [alıntı tarihi 18 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/togaram1
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde