Gen
UBQLN2
ubiquilin 2
- HGNC 12509↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000188021↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 29978↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- Xp11.21
- Koordinater
- Kromosom X: 56 563 627–56 567 868 (GRCh38)
- Exoner
- 1 exon på 4,2 kb
- Protein
- 624 aminosyror
- Även känd som
- Chap1, Dsk2, RIHFB2157, LIC-2, CHAP1/DSK2, PLIC-2, N4BP4, PLIC2
- MANE Select-transkript
- ENST00000338222.7NM_013444.4
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ubqln2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs UBQLN2, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Amyotrofisk lateralskleros (ALS)
- Amyotrofisk lateralskleros
En neurodegenerativ sjukdom som drabbar övre och nedre motoriska nervceller, i både sporadisk och familjär form.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 3 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
▶Åtgärdbarhet
Tofersen (Qalsody, FDA 2023) vid SOD1-ALS; ASO-studier för C9orf72 och FUS; riluzol; edaravon; AMX0035 (natriumfenylbutyrat-taurursodiol); multidisciplinär vård på ALS-mottagning; andningsstöd; genetisk rådgivning för familjemedlemmar
Så är UBQLN2 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 4,2 kb av genens 4,2 kb, och 1 875 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av UBQLN2
2Lätt
Hur svår UBQLN2 är att sekvensera med korta läsningar, av 100
0 · Lätt100 · Svår
Nästan alla exoner i UBQLN2 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.
Det som adderar: andelen av UBQLN2:s exoner i varje typ av svårt område
- MappbarhetSträckor där 100 eller 250 bp långa läsningar inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- RepetitionerTandemrepetitioner och serier av en och samma bas, som läsningar glider på och som kanske inte spänner över. Vikt 15 %.6,2 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksberedningen täcker tunnt. Vikt 10 %.15 %
- ReferenstäckningLuckor i referensassemblyn i närheten, där det inte finns någon sekvens för läsningar att anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
En poäng från Dante Labs egen forskning, byggd på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade områden.Så beräknas poängenVarje stapel är andelen av UBQLN2:s exonbaser i just den typen av svårt område. Varje typ kan i sig göra en gen svår, och varje ytterligare typ adderar mindre: 0 när ingen bas ligger i någon, 100 när varje bas ligger där läsningar inte kan placeras entydigt.
4
positioner i UBQLN2 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller trolig patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsekvensering täcker alla 4,2 kb av UBQLN2, inklusive introner, inte bara de 4,2 kb exoner.
ClinVar pathogenic variants (5)
The UBQLN2 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 3
- Sannolikt patogen 2
| Variant | Conditions | ClinVar-klassificering | Granskningsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_013444.4(UBQLN2):c.1490C>A (p.Pro497His) (opens in a new tab) | amyotrophic lateral sclerosis type 15 | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_013444.4(UBQLN2):c.1489C>T (p.Pro497Ser) (opens in a new tab) | amyotrophic lateral sclerosis type 15 | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_013444.4(UBQLN2):c.1516C>A (p.Pro506Thr) (opens in a new tab) | amyotrophic lateral sclerosis type 15 | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_013444.4(UBQLN2):c.1490C>T (p.Pro497Leu) (opens in a new tab) | amyotrophic lateral sclerosis type 15 | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_013444.4(UBQLN2):c.1663C>T (p.Pro555Ser) (opens in a new tab) | amyotrophic lateral sclerosis type 15 | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
Gener kopplade till samma tillstånd
- ALS2alsin Rho guanine nucleotide exchange factor ALS2Delar 1 tillstånd
- ANGangiogeninDelar 1 tillstånd
- ANXA11annexin A11Delar 1 tillstånd
- C9orf72C9orf72-SMCR8 complex subunitDelar 1 tillstånd
- CCNFcyclin FDelar 1 tillstånd
- CHCHD10coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 10Delar 1 tillstånd
- CHMP2Bcharged multivesicular body protein 2BDelar 1 tillstånd
- CYLDCYLD lysine 63 deubiquitinaseDelar 1 tillstånd
- DCTN1dynactin subunit 1Delar 1 tillstånd
- ERBB4erb-b2 receptor tyrosine kinase 4Delar 1 tillstånd
- FIG4FIG4 phosphoinositide 5-phosphataseDelar 1 tillstånd
- FUSFUS RNA binding proteinDelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till UBQLN2
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som UBQLN2 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the nervous system
- Lou Gehrig's disease
- Motor neuron atrophy
- Ongoing loss of nerve cells
- Abnormal gait
- Abnormal speech pattern
- Anxiety
- Arm dystonia
- Babinski sign
Visa ytterligare 34 egenskaper
- Behavioral abnormality
- Brisk reflexes
- Bulbar signs
- Can't control feelings
- CNS hypomyelination
- Cognitive impairment
- Delayed ability to walk
- Depression
- Difficulty articulating speech
- Dystonia
- Hoffmann sign
- Inability to walk
- Increased reflexes
- Muscle twitch
- Paralysis
- Abnormality of the cerebellum
- Ataxia
- Axial dystonia
- Chorea
- Clonus
- Difficulty sleeping
- Frontotemporal dementia
- Global developmental delay
- Head titubation
- High stepping
- Jaw hyperreflexia
- Language impairment
- Loss of articulate speech
- Oromandibular dystonia
- Parkinsonism
- Toe walking
- Axonal loss
- Gliosis
- Involuntary writhing movements in fingers, hands, toes, and feet
Abnormality of the musculoskeletal system
- Distal muscle wasting
- Generalized muscle weakness
- Lower limb spasticity
- Muscle degeneration
- Muscle weakness
- Uncontrollable movement in upper arms
- Fatigable weakness of bulbar muscles
- Fatigable weakness of respiratory muscles
Visa ytterligare 15 egenskaper
- Fatigable weakness of swallowing muscles
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Lower-limb joint contracture
- Muscle fiber degeneration
- Muscle spasm
- Progressive distal muscular atrophy
- Spastic diplegia
- Spasticity and rigidity of muscles
- Upper-limb joint contracture
- Weakness of outermost muscles
- Neck flexion weakness
- Opisthotonus
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Scoliosis
- Spastic paraparesis
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-18: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.18-8b139e39.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). UBQLN2-genen: ubiquilin 2. Hämtad 18 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/ubqln2
Dante Labs. UBQLN2-genen: ubiquilin 2 [Internet]. [citerad 18 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/ubqln2
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor