Gen
DENND5A
DENN domain containing 5A
- HGNC 19344↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000184014↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 23258↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 11p15.4
- Koordinater
- Kromosom 11: 9 138 825–9 265 350 (GRCh38)
- Exoner
- 23 exoner på 126,5 kb
- Protein
- 1 287 aminosyror
- Även känd som
- KIAA1091, FLJ22354, FLJ33829, FLJ43455
- Tidigare symboler
- RAB6IP1
- MANE Select-transkript
- ENST00000328194.8NM_015213.4
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/dennd5a.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs DENND5A, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Epilepsi (fullständig panel)
- Epilepsi
En av 171 gener kopplade till den
En hjärnsjukdom som kännetecknas av episoder med onormalt ökad neuronal urladdning, vilket ger övergående episoder av sensoriska eller motoriska neurologiska störningar eller psykiska störningar. Dessa episoder kan, men behöver inte, vara förknippade med medvetslöshet eller krampanfall.
- 5 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Så är DENND5A uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 5 kb av genens 126,5 kb, och 3 864 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av DENND5A
1Låg
Hur svår DENND5A är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av DENND5As exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.3,7 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.7,8 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
6
positioner i DENND5A där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
Ett helgenomsekvensering täcker alla 126,5 kb av DENND5A, inklusive introner, inte bara de 5 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Delar 1 tillstånd
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseDelar 1 tillstånd
- ACTL6Bactin like 6BDelar 1 tillstånd
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Delar 1 tillstånd
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Delar 1 tillstånd
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDelar 1 tillstånd
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Delar 1 tillstånd
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Delar 1 tillstånd
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorDelar 1 tillstånd
- ARXaristaless related homeoboxDelar 1 tillstånd
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Delar 1 tillstånd
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till DENND5A
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som DENND5A kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the nervous system
- EEG abnormality
- Epileptic encephalopathy
- Grand mal seizures
- Severe global developmental delay
- Absent speech development
- Anxiety
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Clonic seizure
Visa ytterligare 13 egenskaper
- Dysplastic corpus callosum
- Exaggerated startle response
- Facial-lingual fasciculations
- Fluid-filled sac located in membrane surrounding brain or spinal cord
- Global developmental delay
- Jerking
- More active than typical
- Myoclonic seizure
- Tonic seizure
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Ventriculomegaly
- Increased reflexes
- Profound global developmental delay
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Coarse facial features
- Drooping lower lip
- Long eyelashes
- Open mouth
- Prominent nose
- Short philtrum
- Tented mouth
Visa ytterligare 4 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.18-e609d43e.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). DENND5A-genen: DENN domain containing 5A. Hämtad 18 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/dennd5a
Dante Labs. DENND5A-genen: DENN domain containing 5A [Internet]. [citerad 18 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/dennd5a
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor