Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA

Gen

SET

SET nuclear proto-oncogene

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
9q34.11
Koordinater
Kromosom 9: 128 689 222–128 696 396 (GRCh38)
Eksoner
8 eksoner over 7,2 kb
Protein
277 aminosyrer
Også kjent som
PHAPII, 2PP2A, IPP2A2, TAF-IBETA, IGAAD, TAF-I
MANE Select-transkripsjon
ENST00000322030.13NM_003011.4
Lokustype
gene with protein product
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

ReferansegenomGRCh38

Posisjoner på gen- og variantsidene følger dette valget i denne nettleseren.

Kuratert rapport som er relevant for dette genet

    Slik er SET bygget opp

    • Kodende sekvens
    • Utranslatert region
    • Intron
    • Transkripsjonsretning
    • Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
    • Områder som korte avlesninger sliter med
    Kromosom 9, med en parentes der SET står. SET og 33 gener i nærheten på kromosom 9, fra 128 192 809 til 129 192 808.Kromosom 99q34.11p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.3128,2 Mb128,4 Mb128,6 Mb128,8 Mb129 MbCIZ1: 128 161 233–128 204 482, bakover-strengCIZ1DNM1: 128 191 655–128 255 254, fremover-strengDNM1GOLGA2: 128 255 829–128 276 036, bakover-strengGOLGA2SWI5: 128 275 379–128 316 123, fremover-strengSWI5TRUB2: 128 305 159–128 322 741, bakover-strengTRUB2COQ4: 128 322 483–128 334 073, fremover-strengCOQ4SLC27A4: 128 340 475–128 363 283, fremover-strengSLC27A4URM1: 128 371 341–128 392 017, fremover-strengURM1CERCAM: 128 411 575–128 437 362, fremover-strengCERCAMODF2: 128 455 181–128 502 162, fremover-strengODF2GLE1: 128 504 655–128 543 874, fremover-strengGLE1SPTAN1: 128 552 558–128 633 663, fremover-strengSPTAN1DYNC2I2: 128 633 646–128 656 847, bakover-strengDYNC2I2SET: 128 689 222–128 696 396, fremover-strengSETPKN3: 128 702 489–128 720 924, fremover-strengPKN3ZDHHC12: 128 720 862–128 724 146, bakover-strengZDHHC12ZER1: 128 729 785–128 772 414, bakover-strengZER1TBC1D13: 128 787 227–128 810 432, fremover-strengTBC1D13ENDOG: 128 818 451–128 822 683, fremover-strengENDOGSPOUT1: 128 819 651–128 829 838, bakover-strengSPOUT1KYAT1: 128 819 663–128 881 931, bakover-strengKYAT1KYAT1: 128 832 937–128 882 556, bakover-strengLRRC8A: 128 882 120–128 918 042, fremover-strengLRRC8APHYHD1: 128 920 966–128 942 051, fremover-strengPHYHD1: 128 941 478–128 957 021, fremover-strengDOLK: 128 945 530–128 947 603, bakover-strengDOLKNUP188: 128 947 681–129 007 836, fremover-strengNUP188SH3GLB2: 128 992 788–129 028 369, bakover-strengSH3GLB2MIGA2: 129 036 614–129 072 094, fremover-strengMIGA2DOLPP1: 129 081 097–129 091 161, fremover-strengDOLPP1CRAT: 129 092 813–129 111 313, bakover-strengCRATPTPA: 129 110 550–129 148 946, fremover-strengPTPA: 129 139 413–129 260 575, fremover-strengIER5L: 129 175 552–129 178 261, bakover-strengIER5LDiagram av SET: 8 eksoner på fremover-strengen til kromosom 9Ekson 1: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 2: 3 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 3: 4 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 4: 4 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 5: 3 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 6: 4 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 7: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 1: 128 689 222–128 689 655, 434 baserEkson 2: 128 691 170–128 691 227, 58 baserEkson 3: 128 691 858–128 692 000, 143 baserEkson 4: 128 692 662–128 692 765, 104 baserEkson 5: 128 692 868–128 692 981, 114 baserEkson 6: 128 693 638–128 693 808, 171 baserEkson 7: 128 693 896–128 694 042, 147 baserEkson 8: 128 694 641–128 696 396, 1 756 baser123456785′3′

    Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

    Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

    Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

    Eksonene utgjør 2,9 kb av genets 7,2 kb, og 834 av disse basene koder for proteinet.

    Slik leser en genetisk test SET

    24

    posisjoner i SET der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen

    2 av dem (8,3 %) faller i områder som korte avlesninger sliter med.

    • Low mappability (2 posisjoner)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.

    En helgenomsekvensering dekker alle 7,2 kb av SET, inkludert introner, og ikke bare de 2,9 kb med eksoner.

    Hvor dette kommer fra

    • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
    • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
    • GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-16: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
    • ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
    • ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
    • The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
    • Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.

    Siter denne siden

    APA

    Dante Labs. (u.d.). SET-genet: SET nuclear proto-oncogene. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/set

    Vancouver

    Dante Labs. SET-genet: SET nuclear proto-oncogene [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/set

    Én test. En livstid med svar.

    Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

    Få mitt Genome Test