Gen
SET
SET nuclear proto-oncogene
- HGNC 10760↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de Ensembl ENSG00000119335↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de NCBI 6418↗(se abre en una pestaña nueva)
Resumen
- Localización citogenética
- 9q34.11
- Coordenadas
- Cromosoma 9: 128.689.222–128.696.396 (GRCh38)
- Exones
- 8 exones en 7,2 kb
- Proteína
- 277 aminoácidos
- También conocido como
- PHAPII, 2PP2A, IPP2A2, TAF-IBETA, IGAAD, TAF-I
- Transcrito MANE Select
- ENST00000322030.13NM_003011.4
- Tipo de locus
- gene with protein product
- Muy alta
- Alta
- Baja
- Muy baja
Genoma de referenciaGRCh38hg38
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Discapacidad intelectual
Uno de 233 genes relacionados con ello
- ClinGen califica la relación como definitiva
- 5 remitentes de GenCC la califican como definitiva o fuerte
Estructura de SET
- Secuencia codificante
- Región no traducida
- Intrón
- Sentido de la transcripción
- Sitios conocidos que causan enfermedad
- Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.
Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).
Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.
Los exones suman 2,9 kb de los 7,2 kb del gen; 834 de esas bases codifican la proteína.
Cómo lee una prueba genómica el gen SET
24
posiciones en SET donde ClinVar clasifica un cambio como patogénico o probablemente patogénico
2 de ellas (8,3 %) caen en regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer.
- Low mappability (2 sitios)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Un genoma completo cubre los 7,2 kb de SET, incluidos los intrones, y no solo los 2,9 kb de exones.
Genes vinculados a las mismas afecciones
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Comparte 1 afección
- ADKadenosine kinaseComparte 1 afección
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxComparte 1 afección
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Comparte 1 afección
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Comparte 1 afección
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseComparte 1 afección
- ANK3ankyrin 3Comparte 1 afección
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Comparte 1 afección
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Comparte 1 afección
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Comparte 1 afección
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Comparte 1 afección
- ARID1AAT-rich interaction domain 1AComparte 1 afección
Rasgos asociados a SET
La Human Phenotype Ontology recoge estos rasgos como características de las enfermedades raras que SET puede causar. La página de cada rasgo enumera los demás genes asociados a él.
Enlaces externos
Registros del gen
Transcrito
Proteína
Origen de estos datos
- HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su ubicación.
- MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
- GenCC y ClinGen, publicados en 2026-10-16: a qué afecciones está vinculado el gen y con qué grado de solidez.
- La lista ACMG de hallazgos secundarios, SF v3.2.
- ClinVar y las estratificaciones de GIAB: sitios conocidos que causan enfermedad, y las regiones que las lecturas cortas encuentran difíciles.
- Human Phenotype Ontology, versión 2026-09-01: los rasgos asociados al gen. Más información en hpo.jax.org.
- Versión de datos 2026.10.16-c6eea6bf.
Citar esta página
Dante Labs. (s. f.). Gen SET: SET nuclear proto-oncogene. Consultado el 17 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/set
Dante Labs. Gen SET: SET nuclear proto-oncogene [Internet]. [citado 17 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/set
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