Genas
BLM
BLM RecQ like helicase
- HGNC 1058↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000197299↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 641↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 15q26.1
- Koordinatės
- Chromosoma 15: 90 717 346–90 816 166 (GRCh38)
- Eksonai
- 22 eksonų per 98,8 kb
- Baltymas
- 1 417 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- BS, RECQL3, RECQ2
- MANE Select transkriptas
- ENST00000355112.8NM_000057.4
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/blm.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite BLM ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Nė viena Genome Test ataskaita dar nenuskaito BLM geno. Testas seka visą jūsų genomą, todėl jūsų duomenyse jis vis tiek yra.
Kaip išdėstytas BLM
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 5,2 kb iš 98,8 kb geno; 4 254 šių bazių koduoja baltymą.
BLM sekvenavimas
1Lengva
Kaip sunku sekvenuoti BLM trumpaisiais skaitiniais, iš 100
0 · Lengva100 · Sunku
Beveik visi BLM eksonai yra vietose, kur trumpieji skaitiniai atvaizduojami aiškiai.
Prie to prisideda kiekvienos sunkių sričių rūšies dalis tarp BLM eksonų
- AtvaizduojamumasRuožai, kuriuose 100 arba 250 bp skaitinių negalima vienareikšmiškai priskirti, todėl ten iškvietimas gali būti praleistas arba neteisingas. Svoris 35 %.1,1 %
- HomologijaSegmentinės dubliakacijos: genomo kopijos kitur, pavyzdžiui, paralogai ir pseudogenai, kurių identiškumas 90 % ar didesnis. Svoris 30 %.0 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido seka, kuriais skaitiniai slysta ir kurių gali neaprėpti. Svoris 15 %.3,3 %
- GC kiekisLangai, kuriuose G ir C yra mažiau nei 25 % arba daugiau nei 65 %, bibliotekos paruošimo metu aprėpiami silpnai. Svoris 10 %.2,9 %
- Nuorodinės sekos aprėptisNetoliese esantys nuorodinės sekos surinkinio tarpai, kur skaitiniams nėra su kuo susilyginti. Svoris 10 %.0 %
Dante Labs balas, sukurtas remiantis mūsų pačių tyrimu, paremtu NIST Genome in a Bottle sunkiai sekvenuojamų sričių žemėlapiais.Kaip skaičiuojamas balasKiekviena juosta rodo, kokia BLM eksonų bazių dalis yra tokioje sunkioje srityje. Balas sveria juos pagal tai, kiek kiekvienas kainuoja trumpųjų skaitinių iškvietimui: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokią, 100, kai kiekviena bazė patenka į visas.
482
BLM pozicijos, kuriose ClinVar pakeitimus priskiria patogeniniams arba tikriausiai patogeniniams
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurioje trumpi skaitiniai sunkiai nustatomi.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 98,8 kb BLM geno, įskaitant intronus, o ne tik 5,2 kb eksonų.
ClinVar pathogenic variants (539)
The BLM variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogeninis 308
- Patogeninis / tikriausiai patogeninis 98
- Tikriausiai patogeninis 133
| Variantas | Conditions | ClinVar klasifikacija | Apžvalgos būsena |
|---|---|---|---|
| NM_000057.4(BLM):c.83C>G (p.Ser28Ter) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.311C>A (p.Ser104Ter) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.497C>G (p.Ser166Ter) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.557_559del (p.Ser186_Lys187delinsTer) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.557C>A (p.Ser186Ter) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.572_573del (p.Arg191fs) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.581_582del (p.Phe193_Phe194insTer) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.604_607del (p.Asn202fs) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.608_609del (p.Thr203fs) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.700_713del (p.Asp234fs) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.772_773del (p.Leu258fs) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.814A>T (p.Lys272Ter) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.839_888del (p.Glu279_Leu280insTer) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.991_995del (p.Lys331fs) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.1003_1006dup (p.Ser336delinsThrTer) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.1043dup (p.Met348fs) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.1083_1084del (p.Cys361_Asp362delinsTer) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.1180_1181del (p.Leu394fs) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.1284G>A (p.Trp428Ter) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.1341del (p.Asn448fs) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.1346del (p.Ser449fs) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.1358T>G (p.Leu453Ter) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.1366dup (p.Ser456fs) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.1489C>T (p.Gln497Ter) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_000057.4(BLM):c.1544del (p.Asn515fs) (opens in a new tab) | Bloom syndrome | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
See all 539 with every other BLM variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Savybės, susijusios su BLM
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti BLM, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the integument
- Patchy hypopigmentation
- Patchy lightened skin
- Birthmark
- Photosensitive skin
- Abnormal blistering of the skin
- Paronychia
- Patchy baldness
- Poikiloderma
Rodyti dar 3 savybių
Abnormality of the immune system
- Malar rash
- Abnormality of the immune system
- Recurrent infections
- Skin rash
- Abscess
- Bronchitis
- Pneumonia
- Severe Toxoplasma infection
Rodyti dar 2 savybių
Abnormality of the genitourinary system
- Early menopause
- Male infertility
- Absent sperm in semen
- Frequent urinary tract infections
- Low sperm count
- Malignant genitourinary tract tumor
- Nephroblastoma
- Decreased fertility in females
Rodyti dar 1 savybę
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir regionai, kuriuos trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.18-8b139e39.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). BLM genas: BLM RecQ like helicase. Pasiekta 2026 m. spalio 18 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/blm
Dante Labs. BLM genas: BLM RecQ like helicase [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 18 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/blm
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites