Gene
SLC5A7
solute carrier family 5 member 7
- HGNC 14025↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000115665↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 60482↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 2q12.3
- Coordinate
- Cromosoma 2: 107.986.524–108.013.994 (GRCh38)
- Esoni
- 9 esoni su 27,5 kb
- Proteina
- 580 amminoacidi
- Noto anche come
- hCHT, CHT1, ChT
- Trascritto MANE Select
- ENST00000264047.3NM_021815.5
- Tipo di locus
- Codificanti per proteine
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Questa pagina come dati
Aggiunga .json all'indirizzo della pagina, oppure richieda application/json, per leggerla come JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/slc5a7.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLegga SLC5A7 e il resto del suo genoma con un unico test.
A partire da 449 $Spedizione gratuita · Risultati in 6–8 settimane
Ottieni il mio Genome TestReport curati rilevanti per questo gene
Malattia di Charcot-Marie-Tooth
- Neuropatia motoria ereditaria distale
Neuropatie ereditarie che interessano principalmente i nervi motori, provocando debolezza e atrofia delle mani e dei piedi, inclusa la neuropatia correlata a SORD.
- ClinGen valuta il legame come moderato
- 2 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
Sindrome miastenica congenita
- Sindrome miastenica congenita (tutti i tipi)
Termine generico che comprende tutte le sindromi miastteniche congenite, incluse le forme più comuni associate ai geni CHRNE, RAPSN, DOK7 e MUSK.
- 4 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
▶Azionabilità
Molte forme rispondono a farmaci specifici come piridostigmina, salbutamolo o efedrina, e la scelta più adatta dipende dal gene coinvolto.
Atrofia muscolare spinale
Un gruppo di patologie caratterizzate dalla degenerazione delle cellule delle corna anteriori del midollo spinale, che porta a debolezza muscolare progressiva e atrofia.
- ClinGen valuta il legame come moderato
- 2 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
▶Azionabilità
Terapia genica (onasemnogene abeparvovec), terapia con oligonucleotidi antisenso (nusinersen), modulatore orale dello splicing (risdiplam), cure di supporto
Struttura di SLC5A7
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 5,2 kb dei 27,5 kb del gene; 1743 di queste basi codificano la proteina.
Sequenziamento di SLC5A7
1Bassa
Quanto è difficile sequenziare SLC5A7 con letture corte, su 100Ogni barra indica la quota di basi degli esoni di SLC5A7 che si trovano in quel tipo di regione difficile. Il punteggio le pondera in base a quanto ciascuna pesa su una chiamata con letture corte: 0 quando nessuna base si trova in una regione di questo tipo, 100 quando ogni base si trova in tutte.
- MappabilitàTratti in cui le letture da 100 o 250 bp non possono essere collocate in modo univoco, quindi una chiamata in quelle zone potrebbe mancare o essere errata. Peso 35%.0%
- OmologiaDuplicazioni segmentali: copie altrove nel genoma, come paraloghi e pseudogeni, con identità del 90% o superiore. Peso 30%.0%
- RipetizioniRipetizioni in tandem e sequenze di una stessa base ripetuta, su cui le letture tendono a scivolare e che potrebbero non essere coperte per intero. Peso 15%.4%
- Contenuto di GCFinestre con meno del 25% o più del 65% di G e C, che la preparazione della libreria copre con difficoltà. Peso 10%.8,8%
- Copertura di riferimentoLacune nell'assemblaggio di riferimento vicine, dove non c'è una sequenza a cui le letture possano allinearsi. Peso 10%.0%
14
posizioni in SLC5A7 in cui ClinVar classifica una variante come patogenica o probabilmente patogenica
Nessuna di queste cade in una regione che le letture corte faticano a sequenziare.
Un genoma intero copre tutti i 27,5 kb di SLC5A7, introni inclusi, e non solo i 5,2 kb degli esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- ATP7AATPase copper transporting alphaCondivide 2 condizioni
- BSCL2BSCL2 lipid droplet biogenesis associated, seipinCondivide 2 condizioni
- DCTN1dynactin subunit 1Condivide 2 condizioni
- DNAJB2DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B2Condivide 2 condizioni
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1Condivide 2 condizioni
- EMILIN1elastin microfibril interfacer 1Condivide 2 condizioni
- FBXO38F-box protein 38Condivide 2 condizioni
- GARS1glycyl-tRNA synthetase 1Condivide 2 condizioni
- HSPB8heat shock protein family B (small) member 8Condivide 2 condizioni
- IGHMBP2immunoglobulin mu DNA binding protein 2Condivide 2 condizioni
- PLEKHG5pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G5Condivide 2 condizioni
- REEP1receptor accessory protein 1Condivide 2 condizioni
Tratti collegati a SLC5A7
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che SLC5A7 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati nel 2026-10-17: le condizioni a cui il gene è associato e il grado di associazione.
- L'elenco ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: i siti noti che causano malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili.
- Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.18-e609d43e.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene SLC5A7: solute carrier family 5 member 7. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/slc5a7
Dante Labs. Gene SLC5A7: solute carrier family 5 member 7 [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/slc5a7
Un solo test. Risposte per tutta la vita.
A partire da 449 $Spedizione gratuita · Risultati in 6–8 settimane