Gene
CIITA
class II major histocompatibility complex transactivator
- HGNC 7067↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000179583↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 4261↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 16p13.13
- Coordinate
- Cromosoma 16: 10.877.202–10.936.394 (GRCh38)
- Esoni
- 20 esoni su 59,2 kb
- Proteina
- 1130 amminoacidi
- Noto anche come
- C2TA, NLRA
- Simboli precedenti
- MHC2TA
- Trascritto MANE Select
- ENST00000324288.14NM_000246.4
- Tipo di locus
- Protein-coding
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
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Immunodeficienza combinata grave
- Autosomica recessiva
L'immunodeficienza combinata grave (SCID) comprende un gruppo di rare immunodeficienze primarie di origine monogenica, caratterizzate dalla mancanza di linfociti T periferici funzionali, che porta a infezioni respiratorie gravi a esordio precoce e a un ritardo nella crescita. Tali condizioni vengono classificate in base al fenotipo immunologico in SCID con assenza di cellule T ma presenza di cellule B (SCID T-B+) o SCID con assenza di entrambe (SCID T-B-). Entrambi i gruppi includono diverse forme, con o senza cellule natural killer (NK).
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 3 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
Raggruppamenti più ampi
Altri errori innati dell'immunità
- Malattia da immunodeficienza
Uno di 170 geni collegati ad esso
Malattia caratterizzata da un deficit o da un'anomalia nei meccanismi dell'immunità, sia essa cellulare o umorale.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 3 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
▶Azionabilità
HSCT per SCID e PID gravi; terapia sostitutiva con immunoglobuline (IVIG/SCIG) per i deficit anticorpali; leniolisib (Joenja, FDA 2023) per APDS; terapia genica per ADA-SCID; abatacept per il deficit di CTLA4/LRBA; profilassi antibiotica; G-CSF per CGD
Struttura di CIITA
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 16,1 kb dei 59,2 kb del gene; 3393 di queste basi codificano la proteina.
Sequenziamento di CIITA
96
posizioni in CIITA in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di queste ricade in una regione che le letture corte faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 59,2 kb di CIITA, introni compresi, non solo i 16,1 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- ADAadenosine deaminaseCondivide 2 condizioni
- AK2adenylate kinase 2Condivide 2 condizioni
- BCL11BBCL11 transcription factor BCondivide 2 condizioni
- CARD11caspase recruitment domain family member 11Condivide 2 condizioni
- CARMIL2capping protein regulator and myosin 1 linker 2Condivide 2 condizioni
- CD247CD247 moleculeCondivide 2 condizioni
- CD3DCD3 delta subunit of T-cell receptor complexCondivide 2 condizioni
- CD3ECD3 epsilon subunit of T-cell receptor complexCondivide 2 condizioni
- CD70CD70 moleculeCondivide 2 condizioni
- CORO1Acoronin 1ACondivide 2 condizioni
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CCondivide 2 condizioni
- FOXN1forkhead box N1Condivide 2 condizioni
Tratti collegati a CIITA
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che CIITA può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the digestive system
- Recurrent infection of the gastrointestinal tract
- Chronic hepatitis due to cryptosporidium infection
- Diarrhea
- Protracted diarrhea
- Sclerosing cholangitis
- Bile duct inflammation
- Biliary tract abnormality
- Colitis
Mostra altri 3 tratti
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-17: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.17-8666dff2.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene CIITA: class II major histocompatibility complex transactivator. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/ciita
Dante Labs. Gene CIITA: class II major histocompatibility complex transactivator [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/ciita
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