Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

HIRA

histone cell cycle regulator

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
22q11.21
Koordináták
22. kromoszóma: 19 330 698–19 431 733 (GRCh38)
Exonok
25 exon, összesen 101 kb
Fehérje
1017 aminosav
Más néven ismert
DGCR1, TUP1
Korábbi jelölések
TUPLE1
MANE Select transzkriptum
ENST00000263208.5NM_003325.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) HIRA gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A HIRA felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
22. kromoszóma, a HIRA helyét zárójel jelöli. A HIRA és környékén 22 gén a 22. kromoszómán, 18 881 216–19 881 215 között.22. kromoszóma22q11.21p13p12p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.31q13.32q13.3319 Mb19,2 Mb19,4 Mb19,6 Mb19,8 MbDGCR6: 18 905 677–18 916 623, előre szálDGCR6: 18 906 238–18 947 732, előre szálPRODH: 18 912 696–18 936 451, fordított szálPRODHFAM246C: 19 029 524–19 031 242, előre szálFAM246CDGCR2: 19 036 280–19 122 461, fordított szálDGCR2ESS2: 19 130 279–19 144 684, fordított szálESS2TSSK2: 19 131 308–19 132 622, előre szálTSSK2GSC2: 19 146 993–19 150 292, fordított szálGSC2SLC25A1: 19 175 573–19 178 863, fordított szálSLC25A1CLTCL1: 19 179 319–19 291 774, fordított szálCLTCL1HIRA: 19 330 698–19 431 733, fordított szálHIRAC22orf39: 19 351 368–19 447 714, fordított szálC22orf39MRPL40: 19 431 837–19 436 078, előre szálMRPL40UFD1: 19 449 899–19 479 695, fordított szálUFD1CDC45: 19 479 457–19 520 612, előre szálCDC45CLDN5: 19 517 452–19 527 545, fordított szálCLDN5SEPTIN5: 19 714 117–19 724 781, előre szálSEPTIN5: 19 717 220–19 724 772, előre szálGP1BB: 19 723 539–19 724 776, előre szálGP1BBTBX1: 19 756 703–19 783 593, előre szálTBX1GNB1L: 19 781 243–19 854 947, fordított szálGNB1LRTL10: 19 846 138–19 854 939, fordított szálRTL10TXNRD2: 19 875 517–19 941 934, fordított szálTXNRD2A HIRA ábrája: 25 exon a(z) 22. kromoszóma fordított szálán25. exon: 19 330 698–19 331 556, 859 bázis24. exon: 19 351 358–19 351 446, 89 bázis23. exon: 19 353 356–19 353 519, 164 bázis22. exon: 19 353 996–19 354 118, 123 bázis21. exon: 19 355 760–19 355 865, 106 bázis20. exon: 19 356 230–19 356 288, 59 bázis19. exon: 19 356 890–19 357 051, 162 bázis18. exon: 19 359 336–19 359 484, 149 bázis17. exon: 19 361 237–19 361 341, 105 bázis16. exon: 19 361 727–19 361 931, 205 bázis15. exon: 19 375 631–19 375 792, 162 bázis14. exon: 19 377 869–19 378 066, 198 bázis13. exon: 19 383 620–19 383 705, 86 bázis12. exon: 19 385 521–19 385 736, 216 bázis11. exon: 19 387 711–19 387 816, 106 bázis10. exon: 19 388 484–19 388 554, 71 bázis9. exon: 19 392 101–19 392 214, 114 bázis8. exon: 19 394 342–19 394 509, 168 bázis7. exon: 19 396 787–19 396 947, 161 bázis6. exon: 19 397 992–19 398 087, 96 bázis5. exon: 19 405 786–19 405 880, 95 bázis4. exon: 19 407 184–19 407 274, 91 bázis3. exon: 19 408 483–19 408 593, 111 bázis2. exon: 19 410 716–19 410 778, 63 bázis1. exon: 19 431 440–19 431 733, 294 bázis25201510515′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 101 kb-jából 4,1 kb-ot tesznek ki; ezek közül 3054 bázis kódolja a fehérjét.

HIRA szekvenálása

6Könnyű

Mennyire nehéz a HIRA szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A HIRA exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ami tovább nehezíti: a HIRA exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Shared with chrY0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések6,7%
  • GC-tartalom19%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

A(z) HIRA génhez kapcsolódó tulajdonságok

Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) HIRA gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
  • Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). HIRA gén: histone cell cycle regulator. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/hira

Vancouver

Dante Labs. HIRA gén: histone cell cycle regulator [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/hira

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet