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Gène

STAG3

STAG3 cohesin complex component

Résumé

Localisation cytogénétique
7q22.1
Coordonnées
Chromosome 7 : 100 177 918–100 214 381 (GRCh38)
Exons
34 exons sur 36,5 kb
Protéine
1 226 acides aminés
Aussi appelé
SA3
Transcrit MANE Select
ENST00000615138.5NM_001282717.2
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapports d'expertise pertinents pour ce gène

  • Infertilité féminine

    • Diminution ou absence de la capacité à concevoir chez la femme.

      • 2 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort

  • Infertilité masculine

    • Incapacité pour l'homme de féconder un ovocyte après une période donnée de rapports sexuels non protégés. La stérilité masculine correspond à une infertilité permanente.

      • 1 soumetteur GenCC le classe comme définitif ou fort

Structure de STAG3

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 7, avec un crochet à l'emplacement de STAG3. STAG3 et 46 gènes à proximité sur le chromosome 7, de 99 696 150 à 100 696 149.Chromosome 77q22.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.31q31.32q31.33q32.1q32.2q32.3q33q34q35q36.1q36.2q36.399,8 Mb100 Mb100,2 Mb100,4 Mb100,6 MbZSCAN25 : 99 616 623–99 738 531, brin directZSCAN25CYP3A7-CYP3A51P : 99 684 957–99 735 102, brin inverseCYP3A7-CYP3A51PCYP3A7 : 99 704 105–99 735 196, brin inverseCYP3A7CYP3A4 : 99 756 954–99 784 327, brin inverseCYP3A4CYP3A43 : 99 827 922–99 867 801, brin directCYP3A43OR2AE1 : 99 876 062–99 877 033, brin inverseOR2AE1TRIM4 : 99 876 958–99 919 604, brin inverseTRIM4GJC3 : 99 923 266–99 929 620, brin inverseGJC3AZGP1 : 99 966 720–99 976 074, brin inverseAZGP1ZKSCAN1 : 100 015 570–100 047 430, brin directZKSCAN1ZSCAN21 : 100 049 767–100 081 304, brin directZSCAN21ZNF3 : 100 056 868–100 082 706, brin inverseZNF3COPS6 : 100 088 948–100 095 185, brin directMCM7 : 100 092 233–100 101 940, brin inverseAP4M1 : 100 100 841–100 110 345, brin directTAF6 : 100 106 876–100 127 187, brin inverseCNPY4 : 100 119 614–100 125 511, brin directCNPY4MBLAC1 : 100 126 694–100 128 498, brin directLAMTOR4 : 100 148 888–100 155 945, brin directLAMTOR4TRAPPC14 : 100 154 420–100 158 737, brin inverseGAL3ST4 : 100 159 244–100 168 953, brin inverseGAL3ST4GPC2 : 100 169 602–100 177 389, brin inverseGPC2STAG3 : 100 177 918–100 214 381, brin directSTAG3 : 100 205 357–100 221 488, brin directPVRIG : 100 218 241–100 221 490, brin directPVRIGSPDYE3 : 100 307 702–100 322 372, brin directSPDYE3PILRB : 100 351 627–100 367 831, brin directPILRBPILRA : 100 367 530–100 400 098, brin directPILRA : 100 397 577–100 434 107, brin directZCWPW1 : 100 400 826–100 428 992, brin inverseZCWPW1MEPCE : 100 428 322–100 435 138, brin directMEPCEPPP1R35 : 100 435 261–100 436 546, brin inverseSPACDR : 100 456 620–100 464 277, brin inverseTSC22D4 : 100 466 508–100 479 257, brin inverse : 100 478 099–100 478 170, brin inverseNYAP1 : 100 483 605–100 494 802, brin directNYAP1AGFG2 : 100 539 169–100 569 429, brin directAGFG2SAP25 : 100 572 228–100 573 916, brin inverseSAP25LRCH4 : 100 574 011–100 586 236, brin inverseLRCH4FBXO24 : 100 583 982–100 601 117, brin directFBXO24PCOLCE : 100 602 321–100 608 175, brin directMOSPD3 : 100 612 102–100 616 004, brin directTFR2 : 100 620 416–100 642 779, brin inverseTFR2ACTL6B : 100 643 097–100 656 458, brin inverseACTL6BGNB2 : 100 673 477–100 679 174, brin directGNB2GIGYF1 : 100 679 505–100 694 481, brin inverseGIGYF1POP7 : 100 695 902–100 708 628, brin directPOP7Schéma de STAG3 : 34 exons sur le brin direct du chromosome 7Exon 11 : 1 site connu associé à une maladieExon 14 : 1 site connu associé à une maladieExon 15 : 1 site connu associé à une maladieExon 26 : 2 sites connus associés à une maladieExon 27 : 1 site connu associé à une maladieExon 28 : 1 site connu associé à une maladieExon 30 : 1 site connu associé à une maladieExon 32 : 1 site connu associé à une maladieExon 1 : 100 177 918–100 178 005, 88 basesExon 2 : 100 180 493–100 180 672, 180 basesExon 3 : 100 182 090–100 182 192, 103 basesExon 4 : 100 182 723–100 182 839, 117 basesExon 5 : 100 186 200–100 186 296, 97 basesExon 6 : 100 188 453–100 188 529, 77 basesExon 7 : 100 188 812–100 189 016, 205 basesExon 8 : 100 189 445–100 189 596, 152 basesExon 9 : 100 195 309–100 195 382, 74 basesExon 10 : 100 197 156–100 197 279, 124 basesExon 11 : 100 197 778–100 197 876, 99 basesExon 12 : 100 198 087–100 198 166, 80 basesExon 13 : 100 198 475–100 198 582, 108 basesExon 14 : 100 198 843–100 198 957, 115 basesExon 15 : 100 199 262–100 199 367, 106 basesExon 16 : 100 199 541–100 199 644, 104 basesExon 17 : 100 200 236–100 200 328, 93 basesExon 18 : 100 200 453–100 200 542, 90 basesExon 19 : 100 200 769–100 200 969, 201 basesExon 20 : 100 201 090–100 201 160, 71 basesExon 21 : 100 201 264–100 201 351, 88 basesExon 22 : 100 201 786–100 201 866, 81 basesExon 23 : 100 201 949–100 202 041, 93 basesExon 24 : 100 202 172–100 202 340, 169 basesExon 25 : 100 202 454–100 202 590, 137 basesExon 26 : 100 204 021–100 204 122, 102 basesExon 27 : 100 204 627–100 204 775, 149 basesExon 28 : 100 205 005–100 205 133, 129 basesExon 29 : 100 205 227–100 205 384, 158 basesExon 30 : 100 211 011–100 211 185, 175 basesExon 31 : 100 211 435–100 211 539, 105 basesExon 32 : 100 211 795–100 211 876, 82 basesExon 33 : 100 213 735–100 213 806, 72 basesExon 34 : 100 214 007–100 214 381, 375 bases151015202530345′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4,2 kb sur les 36,5 kb du gène ; 3 681 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit STAG3

10

positions dans STAG3 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

3 d'entre elles (30 %) se situent dans des régions que les lectures courtes peinent à analyser.

  • Segmental duplications (3 sites)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Un génome entier couvre les 36,5 kb de STAG3, introns compris, et pas seulement les 4,2 kb d'exons.

Gènes liés aux mêmes affections

Traits associés à STAG3

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que STAG3 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
  • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène STAG3 : STAG3 cohesin complex component. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/stag3

Vancouver

Dante Labs. Gène STAG3 : STAG3 cohesin complex component [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/stag3

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