Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA

Gen

STAG3

STAG3 cohesin complex component

Shrnutí

Cytogenetická poloha
7q22.1
Souřadnice
Chromozom 7: 100 177 918–100 214 381 (GRCh38)
Exony
34 exonů na 36,5 kb
Protein
1 226 aminokyselin
Další názvy
SA3
Transkript MANE Select
ENST00000615138.5NM_001282717.2
Typ lokusu
gene with protein product
  • Velmi vysoká
  • Jistá
  • Nízká
  • Velmi nízká

Referenční genomGRCh38

Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.

Kurátorované reporty související s tímto genem

  • Female Infertility

    • Diminished or absent ability of a female to achieve conception.

      • 2 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou

  • Male Infertility

    • The inability of the male to effect fertilization of an ovum after a specified period of unprotected intercourse. Male sterility is permanent infertility.

      • 1 zadavatel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou

Jak je STAG3 uspořádán

  • Kódující sekvence
  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
  • Známá místa způsobující onemocnění
  • Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Chromozom 7, se závorkou u STAG3. STAG3 a 46 genů poblíž na chromozomu 7, od 99 696 150 do 100 696 149.Chromozom 77q22.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.31q31.32q31.33q32.1q32.2q32.3q33q34q35q36.1q36.2q36.399,8 Mb100 Mb100,2 Mb100,4 Mb100,6 MbZSCAN25: 99 616 623–99 738 531, řetězec dopřednémZSCAN25CYP3A7-CYP3A51P: 99 684 957–99 735 102, řetězec zpětnémCYP3A7-CYP3A51PCYP3A7: 99 704 105–99 735 196, řetězec zpětnémCYP3A7CYP3A4: 99 756 954–99 784 327, řetězec zpětnémCYP3A4CYP3A43: 99 827 922–99 867 801, řetězec dopřednémCYP3A43OR2AE1: 99 876 062–99 877 033, řetězec zpětnémOR2AE1TRIM4: 99 876 958–99 919 604, řetězec zpětnémTRIM4GJC3: 99 923 266–99 929 620, řetězec zpětnémGJC3AZGP1: 99 966 720–99 976 074, řetězec zpětnémAZGP1ZKSCAN1: 100 015 570–100 047 430, řetězec dopřednémZKSCAN1ZSCAN21: 100 049 767–100 081 304, řetězec dopřednémZSCAN21ZNF3: 100 056 868–100 082 706, řetězec zpětnémZNF3COPS6: 100 088 948–100 095 185, řetězec dopřednémMCM7: 100 092 233–100 101 940, řetězec zpětnémAP4M1: 100 100 841–100 110 345, řetězec dopřednémTAF6: 100 106 876–100 127 187, řetězec zpětnémCNPY4: 100 119 614–100 125 511, řetězec dopřednémCNPY4MBLAC1: 100 126 694–100 128 498, řetězec dopřednémLAMTOR4: 100 148 888–100 155 945, řetězec dopřednémLAMTOR4TRAPPC14: 100 154 420–100 158 737, řetězec zpětnémGAL3ST4: 100 159 244–100 168 953, řetězec zpětnémGAL3ST4GPC2: 100 169 602–100 177 389, řetězec zpětnémGPC2STAG3: 100 177 918–100 214 381, řetězec dopřednémSTAG3: 100 205 357–100 221 488, řetězec dopřednémPVRIG: 100 218 241–100 221 490, řetězec dopřednémPVRIGSPDYE3: 100 307 702–100 322 372, řetězec dopřednémSPDYE3PILRB: 100 351 627–100 367 831, řetězec dopřednémPILRBPILRA: 100 367 530–100 400 098, řetězec dopřednémPILRA: 100 397 577–100 434 107, řetězec dopřednémZCWPW1: 100 400 826–100 428 992, řetězec zpětnémZCWPW1MEPCE: 100 428 322–100 435 138, řetězec dopřednémMEPCEPPP1R35: 100 435 261–100 436 546, řetězec zpětnémSPACDR: 100 456 620–100 464 277, řetězec zpětnémTSC22D4: 100 466 508–100 479 257, řetězec zpětném: 100 478 099–100 478 170, řetězec zpětnémNYAP1: 100 483 605–100 494 802, řetězec dopřednémNYAP1AGFG2: 100 539 169–100 569 429, řetězec dopřednémAGFG2SAP25: 100 572 228–100 573 916, řetězec zpětnémSAP25LRCH4: 100 574 011–100 586 236, řetězec zpětnémLRCH4FBXO24: 100 583 982–100 601 117, řetězec dopřednémFBXO24PCOLCE: 100 602 321–100 608 175, řetězec dopřednémMOSPD3: 100 612 102–100 616 004, řetězec dopřednémTFR2: 100 620 416–100 642 779, řetězec zpětnémTFR2ACTL6B: 100 643 097–100 656 458, řetězec zpětnémACTL6BGNB2: 100 673 477–100 679 174, řetězec dopřednémGNB2GIGYF1: 100 679 505–100 694 481, řetězec zpětnémGIGYF1POP7: 100 695 902–100 708 628, řetězec dopřednémPOP7Schéma STAG3: 34 exonů na dopředném řetězci chromozomu 7Exon 11: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 14: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 15: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 26: 2 známých míst způsobujících onemocněníExon 27: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 28: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 30: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 32: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 1: 100 177 918–100 178 005, 88 bázíExon 2: 100 180 493–100 180 672, 180 bázíExon 3: 100 182 090–100 182 192, 103 bázíExon 4: 100 182 723–100 182 839, 117 bázíExon 5: 100 186 200–100 186 296, 97 bázíExon 6: 100 188 453–100 188 529, 77 bázíExon 7: 100 188 812–100 189 016, 205 bázíExon 8: 100 189 445–100 189 596, 152 bázíExon 9: 100 195 309–100 195 382, 74 bázíExon 10: 100 197 156–100 197 279, 124 bázíExon 11: 100 197 778–100 197 876, 99 bázíExon 12: 100 198 087–100 198 166, 80 bázíExon 13: 100 198 475–100 198 582, 108 bázíExon 14: 100 198 843–100 198 957, 115 bázíExon 15: 100 199 262–100 199 367, 106 bázíExon 16: 100 199 541–100 199 644, 104 bázíExon 17: 100 200 236–100 200 328, 93 bázíExon 18: 100 200 453–100 200 542, 90 bázíExon 19: 100 200 769–100 200 969, 201 bázíExon 20: 100 201 090–100 201 160, 71 bázíExon 21: 100 201 264–100 201 351, 88 bázíExon 22: 100 201 786–100 201 866, 81 bázíExon 23: 100 201 949–100 202 041, 93 bázíExon 24: 100 202 172–100 202 340, 169 bázíExon 25: 100 202 454–100 202 590, 137 bázíExon 26: 100 204 021–100 204 122, 102 bázíExon 27: 100 204 627–100 204 775, 149 bázíExon 28: 100 205 005–100 205 133, 129 bázíExon 29: 100 205 227–100 205 384, 158 bázíExon 30: 100 211 011–100 211 185, 175 bázíExon 31: 100 211 435–100 211 539, 105 bázíExon 32: 100 211 795–100 211 876, 82 bázíExon 33: 100 213 735–100 213 806, 72 bázíExon 34: 100 214 007–100 214 381, 375 bází151015202530345′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 4,2 kb z 36,5 kb genu; 3 681 těchto bází kódují protein.

Jak genetický test čte STAG3

10

pozic v genu STAG3, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní

Z nich 3 (30 %) leží v oblastech, které krátká čtení obtížně zachycují.

  • Segmental duplications (3 míst)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Celý genom pokrývá všech 36,5 kb genu STAG3, včetně intronů, nikoli jen 4,2 kb exonů.

Odkud údaje pocházejí

  • HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
  • GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
  • Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
  • ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
  • Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
  • Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen STAG3: STAG3 cohesin complex component. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/stag3

Vancouver

Dante Labs. Gen STAG3: STAG3 cohesin complex component [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/stag3

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test