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Gene

STAG3

STAG3 cohesin complex component

Sintesi

Localizzazione citogenetica
7q22.1
Coordinate
Cromosoma 7: 100.177.918–100.214.381 (GRCh38)
Esoni
34 esoni su 36,5 kb
Proteina
1226 amminoacidi
Noto anche come
SA3
Trascritto MANE Select
ENST00000615138.5NM_001282717.2
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curati rilevanti per questo gene

  • Infertilità femminile

    • Ridotta o assente capacità di una donna di concepire.

      • 2 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte

  • Infertilità maschile

    • L'incapacità dell'uomo di fecondare un ovulo dopo un determinato periodo di rapporti non protetti. La sterilità maschile è un'infertilità permanente.

      • 1 segnalatore GenCC lo valuta come definitivo o forte

Struttura di STAG3

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 7, con una parentesi dove si trova STAG3. STAG3 e 46 geni nelle vicinanze sul cromosoma 7, da 99.696.150 a 100.696.149.Cromosoma 77q22.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.31q31.32q31.33q32.1q32.2q32.3q33q34q35q36.1q36.2q36.399,8 Mb100 Mb100,2 Mb100,4 Mb100,6 MbZSCAN25: 99.616.623–99.738.531, filamento direttoZSCAN25CYP3A7-CYP3A51P: 99.684.957–99.735.102, filamento inversoCYP3A7-CYP3A51PCYP3A7: 99.704.105–99.735.196, filamento inversoCYP3A7CYP3A4: 99.756.954–99.784.327, filamento inversoCYP3A4CYP3A43: 99.827.922–99.867.801, filamento direttoCYP3A43OR2AE1: 99.876.062–99.877.033, filamento inversoOR2AE1TRIM4: 99.876.958–99.919.604, filamento inversoTRIM4GJC3: 99.923.266–99.929.620, filamento inversoGJC3AZGP1: 99.966.720–99.976.074, filamento inversoAZGP1ZKSCAN1: 100.015.570–100.047.430, filamento direttoZKSCAN1ZSCAN21: 100.049.767–100.081.304, filamento direttoZSCAN21ZNF3: 100.056.868–100.082.706, filamento inversoZNF3COPS6: 100.088.948–100.095.185, filamento direttoMCM7: 100.092.233–100.101.940, filamento inversoAP4M1: 100.100.841–100.110.345, filamento direttoTAF6: 100.106.876–100.127.187, filamento inversoCNPY4: 100.119.614–100.125.511, filamento direttoCNPY4MBLAC1: 100.126.694–100.128.498, filamento direttoLAMTOR4: 100.148.888–100.155.945, filamento direttoLAMTOR4TRAPPC14: 100.154.420–100.158.737, filamento inversoGAL3ST4: 100.159.244–100.168.953, filamento inversoGAL3ST4GPC2: 100.169.602–100.177.389, filamento inversoGPC2STAG3: 100.177.918–100.214.381, filamento direttoSTAG3: 100.205.357–100.221.488, filamento direttoPVRIG: 100.218.241–100.221.490, filamento direttoPVRIGSPDYE3: 100.307.702–100.322.372, filamento direttoSPDYE3PILRB: 100.351.627–100.367.831, filamento direttoPILRBPILRA: 100.367.530–100.400.098, filamento direttoPILRA: 100.397.577–100.434.107, filamento direttoZCWPW1: 100.400.826–100.428.992, filamento inversoZCWPW1MEPCE: 100.428.322–100.435.138, filamento direttoMEPCEPPP1R35: 100.435.261–100.436.546, filamento inversoSPACDR: 100.456.620–100.464.277, filamento inversoTSC22D4: 100.466.508–100.479.257, filamento inverso: 100.478.099–100.478.170, filamento inversoNYAP1: 100.483.605–100.494.802, filamento direttoNYAP1AGFG2: 100.539.169–100.569.429, filamento direttoAGFG2SAP25: 100.572.228–100.573.916, filamento inversoSAP25LRCH4: 100.574.011–100.586.236, filamento inversoLRCH4FBXO24: 100.583.982–100.601.117, filamento direttoFBXO24PCOLCE: 100.602.321–100.608.175, filamento direttoMOSPD3: 100.612.102–100.616.004, filamento direttoTFR2: 100.620.416–100.642.779, filamento inversoTFR2ACTL6B: 100.643.097–100.656.458, filamento inversoACTL6BGNB2: 100.673.477–100.679.174, filamento direttoGNB2GIGYF1: 100.679.505–100.694.481, filamento inversoGIGYF1POP7: 100.695.902–100.708.628, filamento direttoPOP7Diagramma di STAG3: 34 esoni sul filamento diretto del cromosoma 7Esone 11: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 14: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 15: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 26: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 27: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 28: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 30: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 32: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 1: 100.177.918–100.178.005, 88 basiEsone 2: 100.180.493–100.180.672, 180 basiEsone 3: 100.182.090–100.182.192, 103 basiEsone 4: 100.182.723–100.182.839, 117 basiEsone 5: 100.186.200–100.186.296, 97 basiEsone 6: 100.188.453–100.188.529, 77 basiEsone 7: 100.188.812–100.189.016, 205 basiEsone 8: 100.189.445–100.189.596, 152 basiEsone 9: 100.195.309–100.195.382, 74 basiEsone 10: 100.197.156–100.197.279, 124 basiEsone 11: 100.197.778–100.197.876, 99 basiEsone 12: 100.198.087–100.198.166, 80 basiEsone 13: 100.198.475–100.198.582, 108 basiEsone 14: 100.198.843–100.198.957, 115 basiEsone 15: 100.199.262–100.199.367, 106 basiEsone 16: 100.199.541–100.199.644, 104 basiEsone 17: 100.200.236–100.200.328, 93 basiEsone 18: 100.200.453–100.200.542, 90 basiEsone 19: 100.200.769–100.200.969, 201 basiEsone 20: 100.201.090–100.201.160, 71 basiEsone 21: 100.201.264–100.201.351, 88 basiEsone 22: 100.201.786–100.201.866, 81 basiEsone 23: 100.201.949–100.202.041, 93 basiEsone 24: 100.202.172–100.202.340, 169 basiEsone 25: 100.202.454–100.202.590, 137 basiEsone 26: 100.204.021–100.204.122, 102 basiEsone 27: 100.204.627–100.204.775, 149 basiEsone 28: 100.205.005–100.205.133, 129 basiEsone 29: 100.205.227–100.205.384, 158 basiEsone 30: 100.211.011–100.211.185, 175 basiEsone 31: 100.211.435–100.211.539, 105 basiEsone 32: 100.211.795–100.211.876, 82 basiEsone 33: 100.213.735–100.213.806, 72 basiEsone 34: 100.214.007–100.214.381, 375 basi151015202530345′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 4,2 kb dei 36,5 kb del gene; 3681 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge STAG3

10

posizioni in STAG3 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

3 di esse (30%) si trovano in regioni che le letture brevi faticano a leggere.

  • Segmental duplications (3 siti)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Un genoma intero copre tutti i 36,5 kb di STAG3, introni inclusi, non solo i 4,2 kb di esoni.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
  • La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gene STAG3: STAG3 cohesin complex component. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/stag3

Vancouver

Dante Labs. Gene STAG3: STAG3 cohesin complex component [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/stag3

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