Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

STAG3

STAG3 cohesin complex component

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
7q22.1
Koordinaadid
Kromosoom 7: 100 177 918–100 214 381 (GRCh38)
Eksonid
34 eksonit, ulatus 36,5 kb
Valk
1226 aminohapet
Tuntud ka kui
SA3
MANE Select transkript
ENST00000615138.5NM_001282717.2
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

  • Naiste viljatus

    • Naise vähenenud või puuduv võime rasestuda.

      • 2 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks

  • Meeste viljatus

    • Mehe võimetus viljastada munarakku pärast määratud ajavahemikku kaitsmata seksuaalvahekorda. Meeste steriilsus on püsiv viljatus.

      • 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks

Kuidas STAG3 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 7, millel on sulg kohal, kus asub STAG3. STAG3 ja sellele lähedal asuvad 46 geeni kromosoomil 7, vahemikus 99 696 150 kuni 100 696 149.Kromosoom 77q22.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.31q31.32q31.33q32.1q32.2q32.3q33q34q35q36.1q36.2q36.399,8 Mb100 Mb100,2 Mb100,4 Mb100,6 MbZSCAN25: 99 616 623–99 738 531, otsene ahelZSCAN25CYP3A7-CYP3A51P: 99 684 957–99 735 102, pöördne ahelCYP3A7-CYP3A51PCYP3A7: 99 704 105–99 735 196, pöördne ahelCYP3A7CYP3A4: 99 756 954–99 784 327, pöördne ahelCYP3A4CYP3A43: 99 827 922–99 867 801, otsene ahelCYP3A43OR2AE1: 99 876 062–99 877 033, pöördne ahelOR2AE1TRIM4: 99 876 958–99 919 604, pöördne ahelTRIM4GJC3: 99 923 266–99 929 620, pöördne ahelGJC3AZGP1: 99 966 720–99 976 074, pöördne ahelAZGP1ZKSCAN1: 100 015 570–100 047 430, otsene ahelZKSCAN1ZSCAN21: 100 049 767–100 081 304, otsene ahelZSCAN21ZNF3: 100 056 868–100 082 706, pöördne ahelZNF3COPS6: 100 088 948–100 095 185, otsene ahelMCM7: 100 092 233–100 101 940, pöördne ahelAP4M1: 100 100 841–100 110 345, otsene ahelTAF6: 100 106 876–100 127 187, pöördne ahelCNPY4: 100 119 614–100 125 511, otsene ahelCNPY4MBLAC1: 100 126 694–100 128 498, otsene ahelLAMTOR4: 100 148 888–100 155 945, otsene ahelLAMTOR4TRAPPC14: 100 154 420–100 158 737, pöördne ahelGAL3ST4: 100 159 244–100 168 953, pöördne ahelGAL3ST4GPC2: 100 169 602–100 177 389, pöördne ahelGPC2STAG3: 100 177 918–100 214 381, otsene ahelSTAG3: 100 205 357–100 221 488, otsene ahelPVRIG: 100 218 241–100 221 490, otsene ahelPVRIGSPDYE3: 100 307 702–100 322 372, otsene ahelSPDYE3PILRB: 100 351 627–100 367 831, otsene ahelPILRBPILRA: 100 367 530–100 400 098, otsene ahelPILRA: 100 397 577–100 434 107, otsene ahelZCWPW1: 100 400 826–100 428 992, pöördne ahelZCWPW1MEPCE: 100 428 322–100 435 138, otsene ahelMEPCEPPP1R35: 100 435 261–100 436 546, pöördne ahelSPACDR: 100 456 620–100 464 277, pöördne ahelTSC22D4: 100 466 508–100 479 257, pöördne ahel: 100 478 099–100 478 170, pöördne ahelNYAP1: 100 483 605–100 494 802, otsene ahelNYAP1AGFG2: 100 539 169–100 569 429, otsene ahelAGFG2SAP25: 100 572 228–100 573 916, pöördne ahelSAP25LRCH4: 100 574 011–100 586 236, pöördne ahelLRCH4FBXO24: 100 583 982–100 601 117, otsene ahelFBXO24PCOLCE: 100 602 321–100 608 175, otsene ahelMOSPD3: 100 612 102–100 616 004, otsene ahelTFR2: 100 620 416–100 642 779, pöördne ahelTFR2ACTL6B: 100 643 097–100 656 458, pöördne ahelACTL6BGNB2: 100 673 477–100 679 174, otsene ahelGNB2GIGYF1: 100 679 505–100 694 481, pöördne ahelGIGYF1POP7: 100 695 902–100 708 628, otsene ahelPOP7STAG3 skeem: 34 eksonit kromosoomi 7 otsene ahelalEkson 11: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 14: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 15: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 26: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 27: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 28: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 30: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 32: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 1: 100 177 918–100 178 005, 88 alustEkson 2: 100 180 493–100 180 672, 180 alustEkson 3: 100 182 090–100 182 192, 103 alustEkson 4: 100 182 723–100 182 839, 117 alustEkson 5: 100 186 200–100 186 296, 97 alustEkson 6: 100 188 453–100 188 529, 77 alustEkson 7: 100 188 812–100 189 016, 205 alustEkson 8: 100 189 445–100 189 596, 152 alustEkson 9: 100 195 309–100 195 382, 74 alustEkson 10: 100 197 156–100 197 279, 124 alustEkson 11: 100 197 778–100 197 876, 99 alustEkson 12: 100 198 087–100 198 166, 80 alustEkson 13: 100 198 475–100 198 582, 108 alustEkson 14: 100 198 843–100 198 957, 115 alustEkson 15: 100 199 262–100 199 367, 106 alustEkson 16: 100 199 541–100 199 644, 104 alustEkson 17: 100 200 236–100 200 328, 93 alustEkson 18: 100 200 453–100 200 542, 90 alustEkson 19: 100 200 769–100 200 969, 201 alustEkson 20: 100 201 090–100 201 160, 71 alustEkson 21: 100 201 264–100 201 351, 88 alustEkson 22: 100 201 786–100 201 866, 81 alustEkson 23: 100 201 949–100 202 041, 93 alustEkson 24: 100 202 172–100 202 340, 169 alustEkson 25: 100 202 454–100 202 590, 137 alustEkson 26: 100 204 021–100 204 122, 102 alustEkson 27: 100 204 627–100 204 775, 149 alustEkson 28: 100 205 005–100 205 133, 129 alustEkson 29: 100 205 227–100 205 384, 158 alustEkson 30: 100 211 011–100 211 185, 175 alustEkson 31: 100 211 435–100 211 539, 105 alustEkson 32: 100 211 795–100 211 876, 82 alustEkson 33: 100 213 735–100 213 806, 72 alustEkson 34: 100 214 007–100 214 381, 375 alust151015202530345′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 4,2 kb kogupikkusega 36,5 kb; neist 3681 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse STAG3

10

kohad geenis STAG3, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist 3 (30%) asuvad lõikudes, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

  • Segmental duplications (3 kohta)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni STAG3 36,5 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (4,2 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
  • ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). STAG3 geen: STAG3 cohesin complex component. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/stag3

Vancouver

Dante Labs. STAG3 geen: STAG3 cohesin complex component [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/stag3

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test