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Gène

TAF6

TATA-box binding protein associated factor 6

Résumé

Localisation cytogénétique
7q22.1
Coordonnées
Chromosome 7 : 100 107 070–100 119 358 (GRCh38)
Exons
15 exons sur 12,3 kb
Protéine
677 acides aminés
Aussi appelé
TAFII70, TAFII80, MGC:8964, TAFII85
Symboles précédents
TAF2E
Transcrit MANE Select
ENST00000453269.7NM_139315.3
Type de locus
Protein-coding
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore TAF6. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de TAF6

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
Chromosome 7, avec un crochet à l'emplacement de TAF6. TAF6 et 42 gènes à proximité sur le chromosome 7, de 99 613 214 à 100 613 213.Chromosome 77q22.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.31q31.32q31.33q32.1q32.2q32.3q33q34q35q36.1q36.2q36.399,8 Mb100 Mb100,2 Mb100,4 Mb100,6 MbZSCAN25 : 99 616 623–99 738 531, brin directZSCAN25CYP3A5 : 99 647 442–99 680 043, brin inverseCYP3A5CYP3A7-CYP3A51P : 99 684 957–99 735 102, brin inverseCYP3A7-CYP3A51PCYP3A7 : 99 704 105–99 735 196, brin inverseCYP3A7CYP3A4 : 99 756 954–99 784 327, brin inverseCYP3A4CYP3A43 : 99 827 922–99 867 801, brin directCYP3A43OR2AE1 : 99 876 062–99 877 033, brin inverseOR2AE1TRIM4 : 99 876 958–99 919 604, brin inverseTRIM4GJC3 : 99 923 266–99 929 620, brin inverseGJC3AZGP1 : 99 966 720–99 976 074, brin inverseAZGP1ZKSCAN1 : 100 015 570–100 047 430, brin directZKSCAN1ZSCAN21 : 100 049 767–100 081 304, brin directZNF3 : 100 056 868–100 082 706, brin inverseZNF3COPS6 : 100 088 948–100 095 185, brin directMCM7 : 100 092 233–100 101 940, brin inverseAP4M1 : 100 100 841–100 110 345, brin directAP4M1TAF6 : 100 107 070–100 119 358, brin inverseTAF6CNPY4 : 100 119 614–100 125 511, brin directCNPY4MBLAC1 : 100 126 694–100 128 498, brin directMBLAC1LAMTOR4 : 100 148 888–100 155 945, brin directTRAPPC14 : 100 154 420–100 158 737, brin inverseGAL3ST4 : 100 159 244–100 168 953, brin inverseGPC2 : 100 169 602–100 177 389, brin inverseGPC2STAG3 : 100 177 563–100 214 387, brin directSTAG3 : 100 205 357–100 221 488, brin directPVRIG : 100 218 241–100 221 490, brin directPVRIGSPDYE3 : 100 307 702–100 322 372, brin directSPDYE3PILRB : 100 351 627–100 367 831, brin directPILRBPILRA : 100 367 530–100 400 098, brin directPILRA : 100 397 577–100 434 107, brin directZCWPW1 : 100 400 826–100 428 992, brin inverseZCWPW1MEPCE : 100 428 322–100 435 138, brin directMEPCEPPP1R35 : 100 435 261–100 436 546, brin inverseSPACDR : 100 456 620–100 464 277, brin inverseTSC22D4 : 100 466 508–100 479 257, brin inverse : 100 478 099–100 478 170, brin inverseNYAP1 : 100 483 605–100 494 802, brin directNYAP1AGFG2 : 100 539 169–100 569 429, brin directAGFG2SAP25 : 100 572 228–100 573 916, brin inverseSAP25LRCH4 : 100 574 011–100 586 236, brin inverseLRCH4FBXO24 : 100 583 982–100 601 117, brin directFBXO24PCOLCE : 100 602 321–100 608 175, brin directMOSPD3 : 100 612 102–100 616 004, brin directSchéma de TAF6 : 15 exons sur le brin inverse du chromosome 7Exon 3 : 1 site connu associé à une maladieExon 15 : 100 107 070–100 107 623, 554 basesExon 14 : 100 107 926–100 108 123, 198 basesExon 13 : 100 108 367–100 108 540, 174 basesExon 12 : 100 109 948–100 110 073, 126 basesExon 11 : 100 110 200–100 110 274, 75 basesExon 10 : 100 111 139–100 111 321, 183 basesExon 9 : 100 111 728–100 111 829, 102 basesExon 8 : 100 111 922–100 111 999, 78 basesExon 7 : 100 112 108–100 112 253, 146 basesExon 6 : 100 112 798–100 112 917, 120 basesExon 5 : 100 113 349–100 113 405, 57 basesExon 4 : 100 113 616–100 113 769, 154 basesExon 3 : 100 113 868–100 113 954, 87 basesExon 2 : 100 114 054–100 114 268, 215 basesExon 1 : 100 119 204–100 119 358, 155 bases15141210864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,4 kb sur les 12,3 kb du gène ; 2 034 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de TAF6

2

positions de TAF6 où ClinVar classe une variante comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 12,3 kb de TAF6, introns compris, et pas seulement les 2,4 kb d'exons.

Traits associés à TAF6

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que TAF6 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène TAF6 : TATA-box binding protein associated factor 6. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/taf6

Vancouver

Dante Labs. Gène TAF6 : TATA-box binding protein associated factor 6 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/taf6

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