Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel

Gen

STAG3

STAG3 cohesin complex component

Sammanfattning

Cytogenetisk position
7q22.1
Koordinater
Kromosom 7: 100 177 918–100 214 381 (GRCh38)
Exoner
34 exoner på 36,5 kb
Protein
1 226 aminosyror
Även känd som
SA3
MANE Select-transkript
ENST00000615138.5NM_001282717.2
Lokustyp
gene with protein product
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

ReferensgenomGRCh38

Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

  • Kvinnlig infertilitet

    • Nedsatt eller frånvarande förmåga hos en kvinna att bli gravid.

      • 2 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark

  • Manlig infertilitet

    • Mannens oförmåga att befrukta en äggcell efter en angiven period av oskyddat samlag. Manlig sterilitet är permanent infertilitet.

      • 1 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark

Så är STAG3 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Kända sjukdomsorsakande ställen
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 7, med en parentes där STAG3 finns. STAG3 och 46 gener i närheten på kromosom 7, från 99 696 150 till 100 696 149.Kromosom 77q22.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.31q31.32q31.33q32.1q32.2q32.3q33q34q35q36.1q36.2q36.399,8 Mb100 Mb100,2 Mb100,4 Mb100,6 MbZSCAN25: 99 616 623–99 738 531, framåt-strängZSCAN25CYP3A7-CYP3A51P: 99 684 957–99 735 102, bakåt-strängCYP3A7-CYP3A51PCYP3A7: 99 704 105–99 735 196, bakåt-strängCYP3A7CYP3A4: 99 756 954–99 784 327, bakåt-strängCYP3A4CYP3A43: 99 827 922–99 867 801, framåt-strängCYP3A43OR2AE1: 99 876 062–99 877 033, bakåt-strängOR2AE1TRIM4: 99 876 958–99 919 604, bakåt-strängTRIM4GJC3: 99 923 266–99 929 620, bakåt-strängGJC3AZGP1: 99 966 720–99 976 074, bakåt-strängAZGP1ZKSCAN1: 100 015 570–100 047 430, framåt-strängZKSCAN1ZSCAN21: 100 049 767–100 081 304, framåt-strängZSCAN21ZNF3: 100 056 868–100 082 706, bakåt-strängZNF3COPS6: 100 088 948–100 095 185, framåt-strängMCM7: 100 092 233–100 101 940, bakåt-strängAP4M1: 100 100 841–100 110 345, framåt-strängTAF6: 100 106 876–100 127 187, bakåt-strängCNPY4: 100 119 614–100 125 511, framåt-strängCNPY4MBLAC1: 100 126 694–100 128 498, framåt-strängLAMTOR4: 100 148 888–100 155 945, framåt-strängLAMTOR4TRAPPC14: 100 154 420–100 158 737, bakåt-strängGAL3ST4: 100 159 244–100 168 953, bakåt-strängGAL3ST4GPC2: 100 169 602–100 177 389, bakåt-strängGPC2STAG3: 100 177 918–100 214 381, framåt-strängSTAG3: 100 205 357–100 221 488, framåt-strängPVRIG: 100 218 241–100 221 490, framåt-strängPVRIGSPDYE3: 100 307 702–100 322 372, framåt-strängSPDYE3PILRB: 100 351 627–100 367 831, framåt-strängPILRBPILRA: 100 367 530–100 400 098, framåt-strängPILRA: 100 397 577–100 434 107, framåt-strängZCWPW1: 100 400 826–100 428 992, bakåt-strängZCWPW1MEPCE: 100 428 322–100 435 138, framåt-strängMEPCEPPP1R35: 100 435 261–100 436 546, bakåt-strängSPACDR: 100 456 620–100 464 277, bakåt-strängTSC22D4: 100 466 508–100 479 257, bakåt-sträng: 100 478 099–100 478 170, bakåt-strängNYAP1: 100 483 605–100 494 802, framåt-strängNYAP1AGFG2: 100 539 169–100 569 429, framåt-strängAGFG2SAP25: 100 572 228–100 573 916, bakåt-strängSAP25LRCH4: 100 574 011–100 586 236, bakåt-strängLRCH4FBXO24: 100 583 982–100 601 117, framåt-strängFBXO24PCOLCE: 100 602 321–100 608 175, framåt-strängMOSPD3: 100 612 102–100 616 004, framåt-strängTFR2: 100 620 416–100 642 779, bakåt-strängTFR2ACTL6B: 100 643 097–100 656 458, bakåt-strängACTL6BGNB2: 100 673 477–100 679 174, framåt-strängGNB2GIGYF1: 100 679 505–100 694 481, bakåt-strängGIGYF1POP7: 100 695 902–100 708 628, framåt-strängPOP7Diagram över STAG3: 34 exoner på framåt-strängen av kromosom 7Exon 11: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 14: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 15: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 26: 2 kända sjukdomsorsakande ställenExon 27: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 28: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 30: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 32: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 1: 100 177 918–100 178 005, 88 baserExon 2: 100 180 493–100 180 672, 180 baserExon 3: 100 182 090–100 182 192, 103 baserExon 4: 100 182 723–100 182 839, 117 baserExon 5: 100 186 200–100 186 296, 97 baserExon 6: 100 188 453–100 188 529, 77 baserExon 7: 100 188 812–100 189 016, 205 baserExon 8: 100 189 445–100 189 596, 152 baserExon 9: 100 195 309–100 195 382, 74 baserExon 10: 100 197 156–100 197 279, 124 baserExon 11: 100 197 778–100 197 876, 99 baserExon 12: 100 198 087–100 198 166, 80 baserExon 13: 100 198 475–100 198 582, 108 baserExon 14: 100 198 843–100 198 957, 115 baserExon 15: 100 199 262–100 199 367, 106 baserExon 16: 100 199 541–100 199 644, 104 baserExon 17: 100 200 236–100 200 328, 93 baserExon 18: 100 200 453–100 200 542, 90 baserExon 19: 100 200 769–100 200 969, 201 baserExon 20: 100 201 090–100 201 160, 71 baserExon 21: 100 201 264–100 201 351, 88 baserExon 22: 100 201 786–100 201 866, 81 baserExon 23: 100 201 949–100 202 041, 93 baserExon 24: 100 202 172–100 202 340, 169 baserExon 25: 100 202 454–100 202 590, 137 baserExon 26: 100 204 021–100 204 122, 102 baserExon 27: 100 204 627–100 204 775, 149 baserExon 28: 100 205 005–100 205 133, 129 baserExon 29: 100 205 227–100 205 384, 158 baserExon 30: 100 211 011–100 211 185, 175 baserExon 31: 100 211 435–100 211 539, 105 baserExon 32: 100 211 795–100 211 876, 82 baserExon 33: 100 213 735–100 213 806, 72 baserExon 34: 100 214 007–100 214 381, 375 baser151015202530345′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 4,2 kb av genens 36,5 kb, och 3 681 av dessa baser kodar för proteinet.

Så läser ett genomtest STAG3

10

positioner i STAG3 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen

3 av dem (30 %) ligger i områden som korta läsningar har svårt för.

  • Segmental duplications (3 ställen)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

En helgenomsanalys täcker alla 36,5 kb av STAG3, med introner inräknade, inte bara de 4,2 kb exoner.

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
  • ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
  • ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
  • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
  • Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). STAG3-genen: STAG3 cohesin complex component. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/stag3

Vancouver

Dante Labs. STAG3-genen: STAG3 cohesin complex component [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/stag3

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test