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Gène

GFI1

growth factor independent 1 transcriptional repressor

Résumé

Localisation cytogénétique
1p22.1
Coordonnées
Chromosome 1 : 92 473 043–92 486 925 (GRCh38)
Exons
7 exons sur 13,9 kb
Protéine
422 acides aminés
Aussi appelé
GFI1A, GFI-1
Symboles précédents
ZNF163
Transcrit MANE Select
ENST00000294702.6NM_005263.5
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Structure de GFI1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de GFI1. GFI1 et 10 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 91 979 984 à 92 979 983.Chromosome 11p22.1p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4492 Mb92,2 Mb92,4 Mb92,6 Mb92,8 MbBRDT : 91 949 343–92 014 426, brin directBRDTEPHX4 : 92 029 427–92 063 728, brin directEPHX4SETSIP : 92 074 533–92 075 411, brin inverseSETSIPBTBD8 : 92 080 305–92 184 725, brin directBTBD8C1orf146 : 92 217 915–92 245 813, brin directC1orf146GLMN : 92 245 786–92 299 009, brin inverseGLMNRPAP2 : 92 299 010–92 438 687, brin directRPAP2GFI1 : 92 473 043–92 486 925, brin inverseGFI1EVI5 : 92 508 696–92 792 424, brin inverseEVI5DIPK1A : 92 830 514–92 961 522, brin inverseDIPK1ARPL5 : 92 831 990–92 841 924, brin directRPL5Schéma de GFI1 : 7 exons sur le brin inverse du chromosome 1Exon 7 : 1 site connu associé à une maladieExon 7 : 92 473 043–92 476 207, 3 165 basesExon 6 : 92 478 588–92 478 753, 166 basesExon 5 : 92 480 348–92 480 485, 138 basesExon 4 : 92 480 601–92 481 088, 488 basesExon 3 : 92 482 864–92 483 046, 183 basesExon 2 : 92 483 373–92 483 586, 214 basesExon 1 : 92 486 726–92 486 925, 200 bases76543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4,6 kb sur les 13,9 kb du gène ; 1 269 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit GFI1

1

position dans GFI1 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 13,9 kb de GFI1, introns compris, et pas seulement les 4,6 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
  • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène GFI1 : growth factor independent 1 transcriptional repressor. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/gfi1

Vancouver

Dante Labs. Gène GFI1 : growth factor independent 1 transcriptional repressor [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/gfi1

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