Geeni
TRNT1
tRNA nucleotidyl transferase 1
- HGNC 17341↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000072756↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 51095↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 3p26.2
- Koordinaatit
- Kromosomi 3: 3 126 940–3 149 023 (GRCh38)
- Eksonit
- 8 eksonia 22,1 kb:n alueella
- Proteiini
- 434 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- MtCCA, CGI-47, CCA1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000251607.11NM_182916.3
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue TRNT1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Perinnölliset sideroblastiset anemiat
- Perinnöllinen sideroblastinen anemia
Ryhmä sairauksia, joita aiheuttavat muutokset geeneissä kuten ALAS2 ja ABCB7 (X-kromosomaalinen), SLC25A38, GLRX5, PUS1, YARS2 ja TRNT1 (resessiivinen) sekä HSPA9 (dominantti). Jotkin muodot vaikuttavat myös lihaksiin, hermostoon tai immuunijärjestelmään.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
X-kromosomaalinen ALAS2-muoto reagoi usein B6-vitamiiniin (püridoksiiniin), ja diagnoosi ohjaa raudan kertymisen seurantaa sekä erottaa nämä sairaudet hankinnaisesta myelodysplastisesta oireyhtymästä.
TRNT1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 2,3 kb geenin 22,1 kb:stä; 1 305 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä TRNT1
75
TRNT1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 22,1 kb geenistä TRNT1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 2,3 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ABCB7ATP binding cassette subfamily B member 7Yhteinen sairaus: 1
- ALAS25'-aminolevulinate synthase 2Yhteinen sairaus: 1
- GLRX5glutaredoxin 5Yhteinen sairaus: 1
- HSPA9heat shock protein family A (Hsp70) member 9Yhteinen sairaus: 1
- PUS1pseudouridine synthase 1Yhteinen sairaus: 1
- SLC25A38solute carrier family 25 member 38Yhteinen sairaus: 1
- YARS2tyrosyl-tRNA synthetase 2Yhteinen sairaus: 1
Geeniin TRNT1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita TRNT1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the eye
- Difficulties with night vision
- Photoreceptor layer loss on macular OCT
- Retinal atrophy
- Macular edema
- Optic disc pallor
- Peripheral retinal atrophy
- Rod-cone dystrophy
- Spicular pigmentation of the retina
Näytä 4 piirrettä lisää
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Decreased mean corpuscular volume
- Hypochromic microcytic anemia
- Sideroblastic anemia
- Low B cell count
- Elliptocytosis
- Hypochromia
- Poikilocytosis
- Unequal size of red blood cells
Näytä 2 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). TRNT1-geeni: tRNA nucleotidyl transferase 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/trnt1
Dante Labs. TRNT1-geeni: tRNA nucleotidyl transferase 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/trnt1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa