Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi

Geeni

TRAPPC2

trafficking protein particle complex subunit 2

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
Xp22.2
Koordinaatit
Kromosomi X: 13 712 245–13 734 620 (GRCh38)
Eksonit
6 eksonia 22,4 kb:n alueella
Proteiini
140 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
TRS20, SEDT, MIP-2A, ZNF547L, hYP38334
Aiemmat symbolit
SEDL
MANE Select -transkripti
ENST00000380579.6NM_001011658.4
Lokustyyppi
gene with protein product
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

ViitegenomiGRCh38

Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä TRAPPC2. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

TRAPPC2-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi X, jossa hakasulke osoittaa TRAPPC2-geenin sijainnin. TRAPPC2 ja 7 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa X, välillä 13 223 433–14 223 432.Kromosomi XXp22.2p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q2813,4 Mb13,6 Mb13,8 Mb14 Mb14,2 MbATXN3L: 13 318 647–13 320 053, juoste taaksepäinATXN3LEGFL6: 13 569 575–13 633 575, juoste eteenpäinEGFL6TCEANC: 13 653 078–13 681 964, juoste eteenpäinTCEANCRAB9A: 13 689 117–13 712 064, juoste eteenpäinRAB9ATRAPPC2: 13 712 245–13 734 620, juoste taaksepäinTRAPPC2OFD1: 13 734 667–13 777 955, juoste eteenpäinOFD1GPM6B: 13 770 691–13 938 838, juoste taaksepäinGPM6BGEMIN8: 13 998 099–14 029 928, juoste taaksepäinGEMIN8TRAPPC2-kaavio: 6 eksonia kromosomin X juosteella, taaksepäinEksoni 6: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEksoni 5: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEksoni 4: 4 tunnettua tautia aiheuttavaa kohtaaEksoni 3: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEkson 6: 13 712 245–13 714 505, 2 261 emästäEkson 5: 13 716 004–13 716 089, 86 emästäEkson 4: 13 716 534–13 716 678, 145 emästäEkson 3: 13 719 871–13 719 982, 112 emästäEkson 2: 13 734 044–13 734 185, 142 emästäEkson 1: 13 734 525–13 734 620, 96 emästä6543215′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 2,8 kb geenin 22,4 kb:stä; 423 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Miten genomitesti lukee geeniä TRAPPC2

10

TRAPPC2-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi

Niistä 2 (20 %) osuu alueille, joita lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.

  • Low mappability (1 kohta)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • Segmental duplications (1 kohta)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Kokogenomi kattaa kaikki 22,4 kb geenistä TRAPPC2, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 2,8 kb eksoneja.

Mistä tieto on peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
  • Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
  • Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). TRAPPC2-geeni: trafficking protein particle complex subunit 2. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/trappc2

Vancouver

Dante Labs. TRAPPC2-geeni: trafficking protein particle complex subunit 2 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/trappc2

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test