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Gène

TRAPPC2

trafficking protein particle complex subunit 2

Résumé

Localisation cytogénétique
Xp22.2
Coordonnées
Chromosome X : 13 712 245–13 734 620 (GRCh38)
Exons
6 exons sur 22,4 kb
Protéine
140 acides aminés
Aussi appelé
TRS20, SEDT, MIP-2A, ZNF547L, hYP38334
Symboles précédents
SEDL
Transcrit MANE Select
ENST00000380579.6NM_001011658.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore TRAPPC2. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de TRAPPC2

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome X, avec un crochet à l'emplacement de TRAPPC2. TRAPPC2 et 7 gènes à proximité sur le chromosome X, de 13 223 433 à 14 223 432.Chromosome XXp22.2p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q2813,4 Mb13,6 Mb13,8 Mb14 Mb14,2 MbATXN3L : 13 318 647–13 320 053, brin inverseATXN3LEGFL6 : 13 569 575–13 633 575, brin directEGFL6TCEANC : 13 653 078–13 681 964, brin directTCEANCRAB9A : 13 689 117–13 712 064, brin directRAB9ATRAPPC2 : 13 712 245–13 734 620, brin inverseTRAPPC2OFD1 : 13 734 667–13 777 955, brin directOFD1GPM6B : 13 770 691–13 938 838, brin inverseGPM6BGEMIN8 : 13 998 099–14 029 928, brin inverseGEMIN8Schéma de TRAPPC2 : 6 exons sur le brin inverse du chromosome XExon 6 : 1 site connu associé à une maladieExon 5 : 1 site connu associé à une maladieExon 4 : 4 sites connus associés à une maladieExon 3 : 1 site connu associé à une maladieExon 6 : 13 712 245–13 714 505, 2 261 basesExon 5 : 13 716 004–13 716 089, 86 basesExon 4 : 13 716 534–13 716 678, 145 basesExon 3 : 13 719 871–13 719 982, 112 basesExon 2 : 13 734 044–13 734 185, 142 basesExon 1 : 13 734 525–13 734 620, 96 bases6543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,8 kb sur les 22,4 kb du gène ; 423 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit TRAPPC2

10

positions dans TRAPPC2 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

2 d'entre elles (20 %) se situent dans des régions que les lectures courtes peinent à analyser.

  • Low mappability (1 site)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • Segmental duplications (1 site)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Un génome entier couvre les 22,4 kb de TRAPPC2, introns compris, et pas seulement les 2,8 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène TRAPPC2 : trafficking protein particle complex subunit 2. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/trappc2

Vancouver

Dante Labs. Gène TRAPPC2 : trafficking protein particle complex subunit 2 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/trappc2

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