Gå til indhold
Brug dine HSA- eller FSA-midler

Gen

TRAPPC2

trafficking protein particle complex subunit 2

Oversigt

Cytogenetisk placering
Xp22.2
Koordinater
Kromosom X: 13.712.245–13.734.620 (GRCh38)
Exoner
6 exoner fordelt over 22,4 kb
Protein
140 aminosyrer
Også kendt som
TRS20, SEDT, MIP-2A, ZNF547L, hYP38334
Tidligere symboler
SEDL
MANE Select-transkript
ENST00000380579.6NM_001011658.4
Lokustype
gene with protein product
  • Meget høj
  • Sikker
  • Lav
  • Meget lav

ReferencegenomGRCh38

Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.

Kurerede rapporter relevant for dette gen

Ingen Genome Test-rapport læser TRAPPC2 endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.

Sådan er TRAPPC2 opbygget

  • Kodende sekvens
  • Utranslateret region
  • Intron
  • Transkriptionsretning
  • Kendte sygdomsfremkaldende steder
  • Regioner, som korte læsninger har svært ved
Kromosom X, med en klamme ved TRAPPC2. TRAPPC2 og 7 gener i nærheden på kromosom X, fra 13.223.433 til 14.223.432.Kromosom XXp22.2p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q2813,4 Mb13,6 Mb13,8 Mb14 Mb14,2 MbATXN3L: 13.318.647–13.320.053, omvendt-strengATXN3LEGFL6: 13.569.575–13.633.575, fremadrettet-strengEGFL6TCEANC: 13.653.078–13.681.964, fremadrettet-strengTCEANCRAB9A: 13.689.117–13.712.064, fremadrettet-strengRAB9ATRAPPC2: 13.712.245–13.734.620, omvendt-strengTRAPPC2OFD1: 13.734.667–13.777.955, fremadrettet-strengOFD1GPM6B: 13.770.691–13.938.838, omvendt-strengGPM6BGEMIN8: 13.998.099–14.029.928, omvendt-strengGEMIN8Diagram af TRAPPC2: 6 exoner på omvendt-strengen af kromosom XExon 6: 1 kendt sygdomsfremkaldende stedExon 5: 1 kendt sygdomsfremkaldende stedExon 4: 4 kendte sygdomsfremkaldende stederExon 3: 1 kendt sygdomsfremkaldende stedExon 6: 13.712.245–13.714.505, 2.261 baserExon 5: 13.716.004–13.716.089, 86 baserExon 4: 13.716.534–13.716.678, 145 baserExon 3: 13.719.871–13.719.982, 112 baserExon 2: 13.734.044–13.734.185, 142 baserExon 1: 13.734.525–13.734.620, 96 baser6543215′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.

Eksoner udgør 2,8 kb af genets 22,4 kb; 423 af disse baser koder for proteinet.

Sådan læser en genomtest TRAPPC2

10

positioner i TRAPPC2, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen

2 af dem (20 %) ligger i regioner, som korte læsninger har svært ved.

  • Low mappability (1 sted)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • Segmental duplications (1 sted)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

En helgenomsanalyse dækker alle 22,4 kb af TRAPPC2, inklusive introner, og ikke kun de 2,8 kb eksoner.

Hvor oplysningerne kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
  • ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
  • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
  • Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.

Citér denne side

APA

Dante Labs. (u.d.). TRAPPC2-genet: trafficking protein particle complex subunit 2. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/trappc2

Vancouver

Dante Labs. TRAPPC2-genet: trafficking protein particle complex subunit 2 [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/trappc2

Én test. Svar for hele livet.

Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger

Bestil min Genome Test