Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA

Gen

TRAPPC2

trafficking protein particle complex subunit 2

Shrnutí

Cytogenetická poloha
Xp22.2
Souřadnice
Chromozom X: 13 712 245–13 734 620 (GRCh38)
Exony
6 exonů na 22,4 kb
Protein
140 aminokyselin
Další názvy
TRS20, SEDT, MIP-2A, ZNF547L, hYP38334
Předchozí symboly
SEDL
Transkript MANE Select
ENST00000380579.6NM_001011658.4
Typ lokusu
gene with protein product
  • Velmi vysoká
  • Jistá
  • Nízká
  • Velmi nízká

Referenční genomGRCh38

Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.

Kurátorované reporty související s tímto genem

Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen TRAPPC2. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.

Jak je TRAPPC2 uspořádán

  • Kódující sekvence
  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
  • Známá místa způsobující onemocnění
  • Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Chromozom X, se závorkou u TRAPPC2. TRAPPC2 a 7 genů poblíž na chromozomu X, od 13 223 433 do 14 223 432.Chromozom XXp22.2p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q2813,4 Mb13,6 Mb13,8 Mb14 Mb14,2 MbATXN3L: 13 318 647–13 320 053, řetězec zpětnémATXN3LEGFL6: 13 569 575–13 633 575, řetězec dopřednémEGFL6TCEANC: 13 653 078–13 681 964, řetězec dopřednémTCEANCRAB9A: 13 689 117–13 712 064, řetězec dopřednémRAB9ATRAPPC2: 13 712 245–13 734 620, řetězec zpětnémTRAPPC2OFD1: 13 734 667–13 777 955, řetězec dopřednémOFD1GPM6B: 13 770 691–13 938 838, řetězec zpětnémGPM6BGEMIN8: 13 998 099–14 029 928, řetězec zpětnémGEMIN8Schéma TRAPPC2: 6 exonů na zpětném řetězci chromozomu XExon 6: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 5: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 4: 4 známých míst způsobujících onemocněníExon 3: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 6: 13 712 245–13 714 505, 2 261 bázíExon 5: 13 716 004–13 716 089, 86 bázíExon 4: 13 716 534–13 716 678, 145 bázíExon 3: 13 719 871–13 719 982, 112 bázíExon 2: 13 734 044–13 734 185, 142 bázíExon 1: 13 734 525–13 734 620, 96 bází6543215′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 2,8 kb z 22,4 kb genu; 423 těchto bází kódují protein.

Jak genetický test čte TRAPPC2

10

pozic v genu TRAPPC2, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní

Z nich 2 (20 %) leží v oblastech, které krátká čtení obtížně zachycují.

  • Low mappability (1 místo)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • Segmental duplications (1 místo)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Celý genom pokrývá všech 22,4 kb genu TRAPPC2, včetně intronů, nikoli jen 2,8 kb exonů.

Odkud údaje pocházejí

  • HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
  • ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
  • Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
  • Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen TRAPPC2: trafficking protein particle complex subunit 2. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/trappc2

Vancouver

Dante Labs. Gen TRAPPC2: trafficking protein particle complex subunit 2 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/trappc2

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test