Pereiti prie turinio
Naudokite savo HSA ar FSA lėšas

Genas

TRAPPC2

trafficking protein particle complex subunit 2

Santrauka

Citogenetinė vieta
Xp22.2
Koordinatės
Chromosoma X: 13 712 245–13 734 620 (GRCh38)
Eksonai
6 eksonų per 22,4 kb
Baltymas
140 aminorūgščių
Taip pat žinomas kaip
TRS20, SEDT, MIP-2A, ZNF547L, hYP38334
Ankstesni simboliai
SEDL
MANE Select transkriptas
ENST00000380579.6NM_001011658.4
Lokuso tipas
gene with protein product
  • Labai aukštas
  • Patikimas
  • Žemas
  • Labai žemas

Atskaitos genomasGRCh38

Pozicijos genų ir variantų puslapiuose rodomos pagal šį pasirinkimą šioje naršyklėje.

Kuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu

Nė viena Genome Test ataskaita dar nenuskaito TRAPPC2 geno. Testas seka visą jūsų genomą, todėl jūsų duomenyse jis vis tiek yra.

Kaip išdėstytas TRAPPC2

  • Koduojanti seka
  • Netransliuojama sritis
  • Intronas
  • Transkripcijos kryptis
  • Žinomos su liga susijusios vietos
  • Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Chromosoma X, su skliaustu, kur yra TRAPPC2. TRAPPC2 ir dar 7 genų šalia jo chromosomoje X, nuo 13 223 433 iki 14 223 432.Chromosoma XXp22.2p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q2813,4 Mb13,6 Mb13,8 Mb14 Mb14,2 MbATXN3L: 13 318 647–13 320 053, atvirkštinė grandinėATXN3LEGFL6: 13 569 575–13 633 575, tiesioginė grandinėEGFL6TCEANC: 13 653 078–13 681 964, tiesioginė grandinėTCEANCRAB9A: 13 689 117–13 712 064, tiesioginė grandinėRAB9ATRAPPC2: 13 712 245–13 734 620, atvirkštinė grandinėTRAPPC2OFD1: 13 734 667–13 777 955, tiesioginė grandinėOFD1GPM6B: 13 770 691–13 938 838, atvirkštinė grandinėGPM6BGEMIN8: 13 998 099–14 029 928, atvirkštinė grandinėGEMIN8TRAPPC2 diagrama: 6 eksonų, chromosoma X, atvirkštinė grandisEkson 6: 1 žinoma su liga susijusi vietaEkson 5: 1 žinoma su liga susijusi vietaEkson 4: 4 žinomų su liga susijusių vietųEkson 3: 1 žinoma su liga susijusi vietaEksonas 6: 13 712 245–13 714 505, 2 261 bazėEksonas 5: 13 716 004–13 716 089, 86 baziųEksonas 4: 13 716 534–13 716 678, 145 baziųEksonas 3: 13 719 871–13 719 982, 112 baziųEksonas 2: 13 734 044–13 734 185, 142 baziųEksonas 1: 13 734 525–13 734 620, 96 bazių6543215′3′

Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.

Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).

Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.

Eksonai sudaro 2,8 kb iš 22,4 kb geno; 423 šių bazių koduoja baltymą.

Kaip genomo tyrimas nuskaito TRAPPC2

10

TRAPPC2 geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį

Iš jų 2 (20 %) patenka į sritis, kurias trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.

  • Low mappability (1 vieta)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • Segmental duplications (1 vieta)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Viso genomo sekvenavimas apima visus 22,4 kb TRAPPC2 geno, įskaitant intronus, o ne tik 2,8 kb eksonų.

Iš kur tai

  • HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
  • MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
  • ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
  • Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
  • Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.

Cituoti šį puslapį

APA

Dante Labs. (be datos). TRAPPC2 genas: trafficking protein particle complex subunit 2. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/trappc2

Vancouver

Dante Labs. TRAPPC2 genas: trafficking protein particle complex subunit 2 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/trappc2

Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.

Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites

Įsigyti savo Genome Test