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Gen

TRAPPC2

trafficking protein particle complex subunit 2

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
Xp22.2
Koordinaten
Chromosom X: 13.712.245–13.734.620 (GRCh38)
Exons
6 Exons über 22,4 kb
Protein
140 Aminosäuren
Auch bekannt als
TRS20, SEDT, MIP-2A, ZNF547L, hYP38334
Frühere Symbole
SEDL
MANE-Select-Transkript
ENST00000380579.6NM_001011658.4
Locus-Typ
gene with protein product
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

ReferenzgenomGRCh38

Die Positionen auf den Gen- und Variantenseiten richten sich nach dieser Auswahl, in diesem Browser.

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet TRAPPC2 bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von TRAPPC2

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Bekannte krankheitsverursachende Stellen
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom X, mit einer Klammer, an der TRAPPC2 liegt. TRAPPC2 und 7 Gene in der Nähe auf Chromosom X, von 13.223.433 bis 14.223.432.Chromosom XXp22.2p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q2813,4 Mb13,6 Mb13,8 Mb14 Mb14,2 MbATXN3L: 13.318.647–13.320.053, Minus-StrangATXN3LEGFL6: 13.569.575–13.633.575, Plus-StrangEGFL6TCEANC: 13.653.078–13.681.964, Plus-StrangTCEANCRAB9A: 13.689.117–13.712.064, Plus-StrangRAB9ATRAPPC2: 13.712.245–13.734.620, Minus-StrangTRAPPC2OFD1: 13.734.667–13.777.955, Plus-StrangOFD1GPM6B: 13.770.691–13.938.838, Minus-StrangGPM6BGEMIN8: 13.998.099–14.029.928, Minus-StrangGEMIN8Diagramm von TRAPPC2: 6 Exons auf dem Minus-Strang von Chromosom XExon 6: 1 bekannte krankheitsverursachende StelleExon 5: 1 bekannte krankheitsverursachende StelleExon 4: 4 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 3: 1 bekannte krankheitsverursachende StelleExon 6: 13.712.245–13.714.505, 2.261 BasenExon 5: 13.716.004–13.716.089, 86 BasenExon 4: 13.716.534–13.716.678, 145 BasenExon 3: 13.719.871–13.719.982, 112 BasenExon 2: 13.734.044–13.734.185, 142 BasenExon 1: 13.734.525–13.734.620, 96 Basen6543215′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 2,8 kb der 22,4 kb des Gens aus; 423 dieser Basen kodieren für das Protein.

So liest ein Gentest TRAPPC2

10

Positionen in TRAPPC2, an denen ClinVar eine Veränderung als pathogen oder wahrscheinlich pathogen einstuft

2 davon (20 %) liegen in Bereichen, die Short Reads schwer erfassen.

  • Low mappability (1 Stelle)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • Segmental duplications (1 Stelle)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Ein Ganzgenom-Test erfasst alle 22,4 kb von TRAPPC2, einschließlich der Introns, und nicht nur die 2,8 kb Exons.

Woher diese Angaben stammen

  • HGNC: das Symbol des Gens, sein Name, weitere Symbole und seine Lage.
  • MANE Select v1.5, von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • ClinVar und die GIAB-Stratifizierungen: bekannte krankheitsverursachende Stellen sowie Regionen, die Kurzlesesequenzierung schwer erfassen kann.
  • Human Phenotype Ontology, Version 2026-09-01: die mit dem Gen verknüpften Merkmale. Weitere Informationen unter hpo.jax.org.
  • Datenversion 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (o. J.). TRAPPC2-Gen: trafficking protein particle complex subunit 2. Abgerufen am 17. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/trappc2

Vancouver

Dante Labs. TRAPPC2-Gen: trafficking protein particle complex subunit 2 [Internet]. [zitiert am 17. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/trappc2

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