Geeni
SERPINC1
serpin family C member 1
- HGNC 775↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000117601↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 462↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 1q25.1
- Koordinaatit
- Kromosomi 1: 173 903 800–173 917 327 (GRCh38)
- Eksonit
- 7 eksonia 13,5 kb:n alueella
- Proteiini
- 464 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- ATIII, MGC22579
- Aiemmat symbolit
- AT3
- MANE Select -transkripti
- ENST00000367698.4NM_000488.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/serpinc1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue SERPINC1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Trombofilia
- Perinnöllinen trombofilia
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: varma
- 5 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
Toimenpidettävyys
Antikoagulaatio (kesto genotyypin mukaan); estrogeenia sisältävien ehkäisyvalmisteiden välttäminen; pienimolekyylisen hepariinin käyttö raskauden ehkäisyyn; antikoagulaation pidentäminen leikkauksen jälkeen; elinikäinen antikoagulaatio yhdistelmä- tai suuririskisille genotyypeille
SERPINC1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
- Variantit, joilla on sivu
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 1,6 kb geenin 13,5 kb:stä; 1 395 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: SERPINC1
104
SERPINC1-geenin kohdat, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet luvut hankalasti tavoittavat.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 13,5 kb geenistä SERPINC1, mukaan lukien introni-alueet, eikä pelkästään 1,6 kb eksoneja.
Variantit, joilla on sivu (45)
Tässä ovat SERPINC1-variantit, joilla on sivu, eniten arvostelutähtiä saaneet ensin. Jokainen sivu kuvaa ClinVarin julkista tietuetta variantista, ei koskaan tulosta.
| Variantti | HGVS c. | Eksoni tai introni | Sijainti (GRCh38) | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|---|---|
| A414T | c.1240G>A | Eksoni 7 | 173 904 044 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A416P | c.1246G>C | Eksoni 7 | 173 904 038 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A416S | c.1246G>T | Eksoni 7 | 173 904 038 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A436T | c.1306G>A | Eksoni 7 | 173 903 978 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| c.624+1G>A | Introni 3 | 173 911 798 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.1154-14G>A | Introni 5 | 173 907 528 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.1218+2T>C | Introni 6 | 173 907 448 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.1219-2A>G | Introni 6 | 173 904 067 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| E277Vfs*20 | c.830_831del | Eksoni 5 | 173 909 873 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| F94Ifs*19 | c.280_283del | Eksoni 2 | 173 914 677 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- F2coagulation factor II, thrombinYhteinen sairaus: 1
- F5coagulation factor VYhteinen sairaus: 1
- F9coagulation factor IXYhteinen sairaus: 1
- HRGhistidine rich glycoproteinYhteinen sairaus: 1
- PROCprotein C, inactivator of coagulation factors Va and VIIIaYhteinen sairaus: 1
- PROS1protein SYhteinen sairaus: 1
- SERPIND1serpin family D member 1Yhteinen sairaus: 1
- THBDthrombomodulinYhteinen sairaus: 1
Geeniin SERPINC1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita SERPINC1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). SERPINC1-geeni: serpin family C member 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/serpinc1
Dante Labs. SERPINC1-geeni: serpin family C member 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/serpinc1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa