Gen
SERPINC1
serpin family C member 1
- HGNC 775↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000117601↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 462↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 1q25.1
- Koordinater
- Kromosom 1: 173 903 800–173 917 327 (GRCh38)
- Eksoner
- 7 eksoner over 13,5 kb
- Protein
- 464 aminosyrer
- Også kjent som
- ATIII, MGC22579
- Tidligere symboler
- AT3
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000367698.4NM_000488.4
- Lokustype
- Protein-coding
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/serpinc1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes SERPINC1 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Trombofili
- Arvelig trombofili
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 5 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Antikoagulasjon (varighet etter genotype); unngå østrogenholdige prevensjonsmidler; LMWH ved graviditetsprofylakse; forlenget antikoagulasjon etter kirurgi; livslang antikoagulasjon ved sammensatte/høyrisikogenotyper
Slik er SERPINC1 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
- Varianter med egen side
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 1,6 kb av genets 13,5 kb, og 1 395 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av SERPINC1
104
posisjoner i SERPINC1 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem ligger i en region som korte leseavlesninger har vanskelig for å dekke.
En helgenomsekvensering dekker alle 13,5 kb av SERPINC1, inkludert introner, ikke bare de 1,6 kb med eksoner.
Varianter med egen side (45)
De SERPINC1-variantene med egen side her, med flest stjerner for vurdering først. Hver side beskriver ClinVars offentlige opplysninger om varianten, aldri et resultat.
| Variant | HGVS c. | Ekson eller intron | Posisjon (GRCh38) | ClinVar-klassifisering | Vurderingsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A414T | c.1240G>A | Ekson 7 | 173 904 044 | Sannsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| A416P | c.1246G>C | Ekson 7 | 173 904 038 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| A416S | c.1246G>T | Ekson 7 | 173 904 038 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| A436T | c.1306G>A | Ekson 7 | 173 903 978 | Sannsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| c.624+1G>A | Intron 3 | 173 911 798 | Sannsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel | |
| c.1154-14G>A | Intron 5 | 173 907 528 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel | |
| c.1218+2T>C | Intron 6 | 173 907 448 | Sannsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel | |
| c.1219-2A>G | Intron 6 | 173 904 067 | Sannsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel | |
| E277Vfs*20 | c.830_831del | Ekson 5 | 173 909 873 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| F94Ifs*19 | c.280_283del | Ekson 2 | 173 914 677 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
Gener knyttet til de samme tilstandene
- F2coagulation factor II, thrombinDeler 1 tilstand
- F5coagulation factor VDeler 1 tilstand
- F9coagulation factor IXDeler 1 tilstand
- HRGhistidine rich glycoproteinDeler 1 tilstand
- PROCprotein C, inactivator of coagulation factors Va and VIIIaDeler 1 tilstand
- PROS1protein SDeler 1 tilstand
- SERPIND1serpin family D member 1Deler 1 tilstand
- THBDthrombomodulinDeler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til SERPINC1
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene SERPINC1 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-17: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.17-8666dff2.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). SERPINC1-genet: serpin family C member 1. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/serpinc1
Dante Labs. SERPINC1-genet: serpin family C member 1 [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/serpinc1
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker