Geen
SERPINC1
serpin family C member 1
- HGNC 775↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000117601↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 462↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 1q25.1
- Koordinaadid
- Kromosoom 1: 173 903 800–173 917 327 (GRCh38)
- Eksonid
- 7 eksonit, ulatus 13,5 kb
- Valk
- 464 aminohapet
- Tuntud ka kui
- ATIII, MGC22579
- Varasemad tähised
- AT3
- MANE Select transkript
- ENST00000367698.4NM_000488.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe SERPINC1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Trombofiilia
- Pärilik trombofiilia
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 5 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Antikoagulatsioon (kestus genotüübi järgi); väldige östrogeeni sisaldavaid rasestumisvastaseid vahendeid; pärast rasedust profülaktiline LMWH; pikendatud antikoagulatsioon pärast operatsiooni; eluaegne antikoagulatsioon liitgenotüüpide või suure riskiga genotüüpide korral
Kuidas SERPINC1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
- Variandid, millel on leht
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 1,6 kb kogupikkusega 13,5 kb; neist 1395 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse SERPINC1
104
kohad geenis SERPINC1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni SERPINC1 13,5 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (1,6 kb).
Variandid, millel on leht (45)
Siin on SERPINC1 variandid, millel on leht, kõige rohkem hindamistähti kõigepealt. Iga leht kirjeldab ClinVari avalikku andmekogu variandi kohta, mitte tulemust.
| Variant | HGVS c. | Ekson või intron | Positsioon (GRCh38) | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A414T | c.1240G>A | Ekson 7 | 173 904 044 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A416P | c.1246G>C | Ekson 7 | 173 904 038 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A416S | c.1246G>T | Ekson 7 | 173 904 038 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A436T | c.1306G>A | Ekson 7 | 173 903 978 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| c.624+1G>A | Intron 3 | 173 911 798 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.1154-14G>A | Intron 5 | 173 907 528 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.1218+2T>C | Intron 6 | 173 907 448 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.1219-2A>G | Intron 6 | 173 904 067 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| E277Vfs*20 | c.830_831del | Ekson 5 | 173 909 873 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| F94Ifs*19 | c.280_283del | Ekson 2 | 173 914 677 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
Samade haigustega seotud geenid
- F2coagulation factor II, thrombinJagab 1 haigust
- F5coagulation factor VJagab 1 haigust
- F9coagulation factor IXJagab 1 haigust
- HRGhistidine rich glycoproteinJagab 1 haigust
- PROCprotein C, inactivator of coagulation factors Va and VIIIaJagab 1 haigust
- PROS1protein SJagab 1 haigust
- SERPIND1serpin family D member 1Jagab 1 haigust
- THBDthrombomodulinJagab 1 haigust
Geeniga SERPINC1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida SERPINC1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). SERPINC1 geen: serpin family C member 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/serpinc1
Dante Labs. SERPINC1 geen: serpin family C member 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/serpinc1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast