Geeni
RP9
RP9 pre-mRNA splicing factor
- HGNC 10288↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000164610↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 6100↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 7p14.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 7: 33 094 797–33 109 404 (GRCh38)
- Eksonit
- 6 eksonia 14,6 kb:n alueella
- Proteiini
- 221 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- PAP-1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000297157.8NM_203288.2
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue RP9 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Retinitis pigmentosa
Yksi 77 siihen liittyvästä geenistä
Perinnöllisten verkkokalvon dystrofioiden ryhmä, jossa sauvasolut ja sitten tappisolut menettävät asteittain toimintakykynsä. Tästä seuraa yösokeutta ja hitaasti etenevä reunanäön heikkeneminen.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
RP9-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 1,1 kb geenin 14,6 kb:stä; 666 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä RP9
2
RP9-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Niistä 1 (50 %) osuu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
- Low mappability (1 kohta)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Kokogenomi kattaa kaikki 14,6 kb geenistä RP9, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 1,1 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ABCA4ATP binding cassette subfamily A member 4Yhteinen sairaus: 1
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 5Yhteinen sairaus: 1
- AHRaryl hydrocarbon receptorYhteinen sairaus: 1
- ARHGEF18Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18Yhteinen sairaus: 1
- ARL2BPARF like GTPase 2 binding proteinYhteinen sairaus: 1
- ARL3ARF like GTPase 3Yhteinen sairaus: 1
- ARL6ARF like GTPase 6Yhteinen sairaus: 1
- BBS2Bardet-Biedl syndrome 2Yhteinen sairaus: 1
- BEST1bestrophin 1Yhteinen sairaus: 1
- CA4carbonic anhydrase 4Yhteinen sairaus: 1
- CC2D2Acoiled-coil and C2 domain containing 2AYhteinen sairaus: 1
- CDHR1cadherin related family member 1Yhteinen sairaus: 1
Geeniin RP9 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita RP9 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the eye
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal retinal pigmentation
- Blindness
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Optic atrophy
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
Näytä 24 piirrettä lisää
- Spicular pigmentation of the retina
- Visual impairment
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Bulging cornea
- Cystoid macular edema
- Difficulties with night vision
- Eye muscle paralysis
- Glaucoma
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal atrophy
- Abnormal color vision
- Clouding of the lens of the eye
- Decreased clarity of vision
- Macular atrophy
- Macular edema
- Photopsia
- Limited peripheral vision
- Rod-cone dystrophy
- Undetectable light- and dark-adapted electroretinogram
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). RP9-geeni: RP9 pre-mRNA splicing factor. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/rp9
Dante Labs. RP9-geeni: RP9 pre-mRNA splicing factor [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/rp9
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa