Geeni
RAG1
recombination activating 1
- HGNC 9831↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000166349↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 5896↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 11p12
- Koordinaatit
- Kromosomi 11: 36 568 007–36 579 762 (GRCh38)
- Eksonit
- 2 eksonia 11,8 kb:n alueella
- Proteiini
- 1 043 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- RNF74, MGC43321
- MANE Select -transkripti
- ENST00000299440.6NM_000448.3
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue RAG1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Vakava yhdistynyt immuunipuutos
- Autosomaalinen resessiivinen
Vakava yhdistynyt immuunipuutos (SCID) on ryhmä harvinaisia monogeenisiä primaarisia immuunipuutossairauksia, joille on ominaista toimivien perifeeristen T-lymfosyyttien puute. Tämä johtaa varhaisessa iässä alkaviin vakavoihin hengitystieinfektioihin ja kasvun häiriintymiseen. Sairaudet luokitellaan immunologisen fenotyypin mukaan SCID-muotoihin, joissa T-solut puuttuvat mutta B-solut ovat läsnä (T-B+ SCID), tai SCID-muotoihin, joissa sekä T- että B-solut puuttuvat (T-B- SCID). Molemmat ryhmät sisältävät useita muotoja, joissa luonnollisia tappajasoluja (NK-soluja) voi olla tai ei ole.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 6 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Laajemmat ryhmät
Muut synnynnäiset immuunijärjestelmän häiriöt
- Immuunipuutossairaus
Yksi 170 siihen liittyvästä geenistä
Sairaus, jossa immuniteettimekanismeissa on puutetta tai vikaa, joko solullisessa tai humoraalisessa immuniteetissa.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 6 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
HSCT vakavan yhdistelmäimmuunipuutoksen (SCID) ja vakavien primaaristen immuunipuutosten hoitoon; immunoglobuliinikorvaushoito (IVIG/SCIG) vasta-ainepuutoksiin; leniolisib (Joenja, FDA 2023) APDS-oireyhtymään; geenihoito ADA-SCID-tautiin; abatasepti CTLA4- ja LRBA-puutoksiin; profylaktiset antibiootit; G-CSF krooniseen granulomatoottiseen sairauteen (CGD)
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
RAG1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 6,6 kb geenin 11,8 kb:stä; 3 132 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä RAG1
144
RAG1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 11,8 kb geenistä RAG1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 6,6 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ADAadenosine deaminaseYhteisiä sairauksia: 2
- AK2adenylate kinase 2Yhteisiä sairauksia: 2
- BCL11BBCL11 transcription factor BYhteisiä sairauksia: 2
- CARD11caspase recruitment domain family member 11Yhteisiä sairauksia: 2
- CARMIL2capping protein regulator and myosin 1 linker 2Yhteisiä sairauksia: 2
- CD247CD247 moleculeYhteisiä sairauksia: 2
- CD3DCD3 delta subunit of T-cell receptor complexYhteisiä sairauksia: 2
- CD3ECD3 epsilon subunit of T-cell receptor complexYhteisiä sairauksia: 2
- CD70CD70 moleculeYhteisiä sairauksia: 2
- CIITAclass II major histocompatibility complex transactivatorYhteisiä sairauksia: 2
- CORO1Acoronin 1AYhteisiä sairauksia: 2
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CYhteisiä sairauksia: 2
Geeniin RAG1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita RAG1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the immune system
- Complete or near-complete absence of specific antibody response to tetanus vaccine
- Congenital exfoliative erythroderma
- Decreased circulating isohemagglutinin concentration
- Decreased immune function
- Eczema
- Eosinophilic dermal infiltration
- Infection in blood stream
- Meningitis
Näytä 20 piirrettä lisää
- Pimple
- Pneumocystis jirovecii pneumonia
- Pneumonia
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent skin infections
- Recurrent viral infections
- Severe cytomegalovirus infection
- Skin rash
- Subcutaneous abscess
- Unusual bronchiolitis
- Red scaly skin caused by inflammatory skin disease
- Severe combined immunodeficiency
- Antinuclear antibody positivity
- Recurrent enteroviral infections
- Recurrent fungal infections
- Autoimmunity
- Combined immunodeficiency
- Recurrent opportunistic infections
- Recurrent respiratory infections
- Severe T-cell immunodeficiency
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Absent circulating B cells
- Absent circulating T cells
- Absent natural killer cells
- Decreased naive CD4+ T cell proportion
- Decreased total CD8+ T cell proportion
- Elevated white blood count
- High blood eosinophil count
- Increased CD4:CD8 ratio
Näytä 16 piirrettä lisää
- Increased gamma-delta T cell proportion
- Low B cell count
- Low blood neutrophil count
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Oligoclonal T cell expansion
- Abnormal lymphocyte morphology
- Abnormal total B cell count
- Abnormal total T cell number
- Low T cell count
- Autoimmune hemolytic anemia
- Autoimmune neutropenia
- Decreased blood lymphocyte number
- High lymphocyte count
- Abnormal total natural killer cell count
- Cancer of lymphatic system
- Low platelet count
Abnormality of the integument
- Brittle hair
- Hair loss
- Hyperkeratosis
- Parakeratosis
- Psoriasiform acanthosis
- Scaling skin
- Sparse hair
- Spongiosis
Näytä 4 piirrettä lisää
Abnormal cellular phenotype
- Agammaglobulinemia
- Decreased anti-CD3/28-induced T-cell proliferation
- Decreased circulating IgA concentration
- Decreased circulating IgG concentration
- Impaired phytohemagglutinin-induced T lymphocyte transformation
- Increased circulating IgE concentration
- Decreased circulating antibody level
- Decreased circulating IgM concentration
Abnormality of the cardiovascular system
- Absent thymus
- Axillary lymphadenopathy
- Enlarged liver and spleen
- Generalized swelling of lymph nodes
- Inguinal lymphadenopathy
- Redness of skin or mucous membrane
- Swollen lymph nodes in the neck
- Increased spleen size
Näytä 3 piirrettä lisää
Abnormality of head or neck
- Absence of scalp hair
- Absent eyebrow
- Absent eyelashes
- Chronic oral thrush
- Recurrent upper and lower respiratory tract infections
- Sparse or absent eyebrows
- Mastoiditis
- Pink eye
Näytä 1 piirre lisää
Laboratory abnormality
- Bacteremia
- Elevated circulating C-reactive protein concentration
- Episodic fever
- Fever
- Fluid retention
- Low albumin
- Persistent fever
- High liver enzymes
Näytä 1 piirre lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). RAG1-geeni: recombination activating 1. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/rag1
Dante Labs. RAG1-geeni: recombination activating 1 [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/rag1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa