Gén
RAG1
recombination activating 1
- HGNC 9831↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000166349↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 5896↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 11p12
- Koordináták
- 11. kromoszóma: 36 568 007–36 579 762 (GRCh38)
- Exonok
- 2 exon, összesen 11,8 kb
- Fehérje
- 1043 aminosav
- Öröklődés
- Autoszomális recesszív
- Más néven ismert
- RNF74, MGC43321
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000299440.6NM_000448.3
- Lokusz típusa
- gene with protein product
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Referencia genomGRCh38hg38
A gén- és variánsoldalakon a pozíciók ennek a választásnak megfelelően jelennek meg, ebben a böngészőben.
Olvassa el a RAG1-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Severe Combined Immunodeficiency
- Autoszomális recesszív
Severe combined immunodeficiency (SCID) comprises a group of rare monogenic primary immunodeficiency disorders characterized by a lack of functional peripheral T lymphocytes resulting in early-onset severe respiratory infections and failure to thrive. They are classified according to immunological phenotype into SCID with absence of T cells but presence of B cells (T-B+ SCID) or SCID with absence of both (T-B- SCID). Both of these groups include several forms, with or without natural killer (NK) cells.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: definitív
- 6 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Átfogóbb csoportosítások
Other Inborn Errors of Immunity
- Immunodeficiency Disease
A 170 hozzá kapcsolódó gén egyike
Disease in which there is a deficiency or defect in the mechanisms of immunity, either cellular or humoral.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: definitív
- 6 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Mit változtat az ismeret
HSCT for SCID and severe PIDs; immunoglobulin replacement (IVIG/SCIG) for antibody deficiencies; leniolisib (Joenja, FDA 2023) for APDS; gene therapy for ADA-SCID; abatacept for CTLA4/LRBA deficiency; prophylactic antibiotics; G-CSF for CGD
Öröklődési mód
- Autoszomális recesszív
- Mindkét szülőtől egy-egy megváltozott másolat szükséges. Egy megváltozott másolattal hordozó lesz, és általában nem érintett; ha mindkét szülő hordozó, minden gyermeknek 25%-os eséllyel öröklődik mindkét másolat.
A RAG1 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 11,8 kb-jából 6,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 3132 bázis kódolja a fehérjét.
Hogyan olvassa a genomteszt a(z) RAG1 gént
144
pozíció a(z) RAG1 génben, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül egyik sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen értelmeznek.
A teljes genom a RAG1 gén mind a 11,8 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 6,6 kb exonját.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ADAadenosine deaminase2 betegséget oszt meg
- AK2adenylate kinase 22 betegséget oszt meg
- BCL11BBCL11 transcription factor B2 betegséget oszt meg
- CARD11caspase recruitment domain family member 112 betegséget oszt meg
- CARMIL2capping protein regulator and myosin 1 linker 22 betegséget oszt meg
- CD247CD247 molecule2 betegséget oszt meg
- CD3DCD3 delta subunit of T-cell receptor complex2 betegséget oszt meg
- CD3ECD3 epsilon subunit of T-cell receptor complex2 betegséget oszt meg
- CD70CD70 molecule2 betegséget oszt meg
- CIITAclass II major histocompatibility complex transactivator2 betegséget oszt meg
- CORO1Acoronin 1A2 betegséget oszt meg
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1C2 betegséget oszt meg
A(z) RAG1 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) RAG1 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the immune system
- Complete or near-complete absence of specific antibody response to tetanus vaccine
- Congenital exfoliative erythroderma
- Decreased circulating isohemagglutinin concentration
- Decreased immune function
- Eczema
- Eosinophilic dermal infiltration
- Infection in blood stream
- Meningitis
Még 20 tulajdonság megjelenítése
- Pimple
- Pneumocystis jirovecii pneumonia
- Pneumonia
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent skin infections
- Recurrent viral infections
- Severe cytomegalovirus infection
- Skin rash
- Subcutaneous abscess
- Unusual bronchiolitis
- Red scaly skin caused by inflammatory skin disease
- Severe combined immunodeficiency
- Antinuclear antibody positivity
- Recurrent enteroviral infections
- Recurrent fungal infections
- Autoimmunity
- Combined immunodeficiency
- Recurrent opportunistic infections
- Recurrent respiratory infections
- Severe T-cell immunodeficiency
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Absent circulating B cells
- Absent circulating T cells
- Absent natural killer cells
- Decreased naive CD4+ T cell proportion
- Decreased total CD8+ T cell proportion
- Elevated white blood count
- High blood eosinophil count
- Increased CD4:CD8 ratio
Még 16 tulajdonság megjelenítése
- Increased gamma-delta T cell proportion
- Low B cell count
- Low blood neutrophil count
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Oligoclonal T cell expansion
- Abnormal lymphocyte morphology
- Abnormal total B cell count
- Abnormal total T cell number
- Low T cell count
- Autoimmune hemolytic anemia
- Autoimmune neutropenia
- Decreased blood lymphocyte number
- High lymphocyte count
- Abnormal total natural killer cell count
- Cancer of lymphatic system
- Low platelet count
Abnormality of the integument
- Brittle hair
- Hair loss
- Hyperkeratosis
- Parakeratosis
- Psoriasiform acanthosis
- Scaling skin
- Sparse hair
- Spongiosis
Még 4 tulajdonság megjelenítése
Abnormal cellular phenotype
- Agammaglobulinemia
- Decreased anti-CD3/28-induced T-cell proliferation
- Decreased circulating IgA concentration
- Decreased circulating IgG concentration
- Impaired phytohemagglutinin-induced T lymphocyte transformation
- Increased circulating IgE concentration
- Decreased circulating antibody level
- Decreased circulating IgM concentration
Még 3 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the cardiovascular system
- Absent thymus
- Axillary lymphadenopathy
- Enlarged liver and spleen
- Generalized swelling of lymph nodes
- Inguinal lymphadenopathy
- Redness of skin or mucous membrane
- Swollen lymph nodes in the neck
- Increased spleen size
Még 3 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of head or neck
- Absence of scalp hair
- Absent eyebrow
- Absent eyelashes
- Chronic oral thrush
- Recurrent upper and lower respiratory tract infections
- Sparse or absent eyebrows
- Mastoiditis
- Pink eye
Még 1 tulajdonság megjelenítése
Laboratory abnormality
- Bacteremia
- Elevated circulating C-reactive protein concentration
- Episodic fever
- Fever
- Fluid retention
- Low albumin
- Persistent fever
- High liver enzymes
Még 1 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-16 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.16-c6eea6bf.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). RAG1 gén: recombination activating 1. Lekérve: 2026. október 16., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/rag1
Dante Labs. RAG1 gén: recombination activating 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 16.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/rag1
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt