Gen
RAG1
recombination activating 1
- HGNC 9831↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000166349↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 5896↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 11p12
- Koordinater
- Kromosom 11: 36 568 007–36 579 762 (GRCh38)
- Eksoner
- 2 eksoner over 11,8 kb
- Protein
- 1 043 aminosyrer
- Arvelighet
- Autosomal recessiv
- Også kjent som
- RNF74, MGC43321
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000299440.6NM_000448.3
- Lokustype
- gene with protein product
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
ReferansegenomGRCh38hg38
Posisjoner på gen- og variantsidene følger dette valget i denne nettleseren.
Les RAG1 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Alvorlig kombinert immunsvikt
- Autosomal recessiv
Alvorlig kombinert immunsvikt (SCID) omfatter en gruppe sjeldne monogene primære immunsviktlidelser preget av mangel på funksjonelle perifere T-lymfocytter, noe som fører til alvorlige luftveisinfeksjoner med tidlig debut og manglende vekstutvikling. De klassifiseres etter immunologisk fenotype i SCID med fravær av T-celler, men tilstedeværelse av B-celler (T-B+ SCID), eller SCID med fravær av både T- og B-celler (T-B- SCID). Begge disse gruppene omfatter flere former, med eller uten naturlige drepeceller (NK-celler).
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 6 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Bredere grupperinger
Andre medfødte immunsviktsykdommer
- Immunsviktsykdom
Ett av 170 gener knyttet til den
Sykdom der det finnes en mangel eller defekt i immunforsvarsmekanismene, enten cellulære eller humorale.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 6 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Hva kunnskapen endrer
HSCT ved SCID og alvorlige PID; immunglobulinerstatning (IVIG/SCIG) ved antistoffmangel; leniolisib (Joenja, FDA 2023) ved APDS; genterapi ved ADA-SCID; abatacept ved CTLA4- og LRBA-mangel; profylaktiske antibiotika; G-CSF ved CGD
Arv
- Autosomal recessiv
- Det kreves en endret kopi fra hver forelder. Med én er du bærer og vanligvis uten sykdom. Når begge foreldrene er bærere, har hvert barn en sjanse på én av fire til å arve to.
Slik er RAG1 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 6,6 kb av genets 11,8 kb, og 3 132 av disse basene koder for proteinet.
Slik leser en genetisk test RAG1
144
posisjoner i RAG1 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem faller i et område som korte avlesninger sliter med.
En helgenomsekvensering dekker alle 11,8 kb av RAG1, inkludert introner, og ikke bare de 6,6 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- ADAadenosine deaminaseDeler 2 tilstander
- AK2adenylate kinase 2Deler 2 tilstander
- BCL11BBCL11 transcription factor BDeler 2 tilstander
- CARD11caspase recruitment domain family member 11Deler 2 tilstander
- CARMIL2capping protein regulator and myosin 1 linker 2Deler 2 tilstander
- CD247CD247 moleculeDeler 2 tilstander
- CD3DCD3 delta subunit of T-cell receptor complexDeler 2 tilstander
- CD3ECD3 epsilon subunit of T-cell receptor complexDeler 2 tilstander
- CD70CD70 moleculeDeler 2 tilstander
- CIITAclass II major histocompatibility complex transactivatorDeler 2 tilstander
- CORO1Acoronin 1ADeler 2 tilstander
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CDeler 2 tilstander
Egenskaper knyttet til RAG1
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene RAG1 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the immune system
- Complete or near-complete absence of specific antibody response to tetanus vaccine
- Congenital exfoliative erythroderma
- Decreased circulating isohemagglutinin concentration
- Decreased immune function
- Eczema
- Eosinophilic dermal infiltration
- Infection in blood stream
- Meningitis
Vis 20 egenskaper til
- Pimple
- Pneumocystis jirovecii pneumonia
- Pneumonia
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent skin infections
- Recurrent viral infections
- Severe cytomegalovirus infection
- Skin rash
- Subcutaneous abscess
- Unusual bronchiolitis
- Red scaly skin caused by inflammatory skin disease
- Severe combined immunodeficiency
- Antinuclear antibody positivity
- Recurrent enteroviral infections
- Recurrent fungal infections
- Autoimmunity
- Combined immunodeficiency
- Recurrent opportunistic infections
- Recurrent respiratory infections
- Severe T-cell immunodeficiency
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Absent circulating B cells
- Absent circulating T cells
- Absent natural killer cells
- Decreased naive CD4+ T cell proportion
- Decreased total CD8+ T cell proportion
- Elevated white blood count
- High blood eosinophil count
- Increased CD4:CD8 ratio
Vis 16 egenskaper til
- Increased gamma-delta T cell proportion
- Low B cell count
- Low blood neutrophil count
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Oligoclonal T cell expansion
- Abnormal lymphocyte morphology
- Abnormal total B cell count
- Abnormal total T cell number
- Low T cell count
- Autoimmune hemolytic anemia
- Autoimmune neutropenia
- Decreased blood lymphocyte number
- High lymphocyte count
- Abnormal total natural killer cell count
- Cancer of lymphatic system
- Low platelet count
Abnormality of the integument
- Brittle hair
- Hair loss
- Hyperkeratosis
- Parakeratosis
- Psoriasiform acanthosis
- Scaling skin
- Sparse hair
- Spongiosis
Vis 4 egenskaper til
Abnormal cellular phenotype
- Agammaglobulinemia
- Decreased anti-CD3/28-induced T-cell proliferation
- Decreased circulating IgA concentration
- Decreased circulating IgG concentration
- Impaired phytohemagglutinin-induced T lymphocyte transformation
- Increased circulating IgE concentration
- Decreased circulating antibody level
- Decreased circulating IgM concentration
Abnormality of the cardiovascular system
- Absent thymus
- Axillary lymphadenopathy
- Enlarged liver and spleen
- Generalized swelling of lymph nodes
- Inguinal lymphadenopathy
- Redness of skin or mucous membrane
- Swollen lymph nodes in the neck
- Increased spleen size
Vis 3 egenskaper til
Abnormality of head or neck
- Absence of scalp hair
- Absent eyebrow
- Absent eyelashes
- Chronic oral thrush
- Recurrent upper and lower respiratory tract infections
- Sparse or absent eyebrows
- Mastoiditis
- Pink eye
Vis 1 egenskap til
Laboratory abnormality
- Bacteremia
- Elevated circulating C-reactive protein concentration
- Episodic fever
- Fever
- Fluid retention
- Low albumin
- Persistent fever
- High liver enzymes
Vis 1 egenskap til
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-16: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). RAG1-genet: recombination activating 1. Hentet 16. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/rag1
Dante Labs. RAG1-genet: recombination activating 1 [Internett]. [sitert 16. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/rag1
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker