Geeni
NDUFA6
NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A6
- HGNC 7690↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000184983↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 4700↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 22q13.2
- Koordinaatit
- Kromosomi 22: 42 085 526–42 090 772 (GRCh38)
- Eksonit
- 3 eksonia 5,2 kb:n alueella
- Proteiini
- 128 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- B14, LYRM6, CI-B14, NADHB14
- MANE Select -transkripti
- ENST00000498737.8NM_002490.6
- Lokustyyppi
- Proteiinia koodaava
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ndufa6.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue NDUFA6 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Primaarinen mitokondriosairaus
- Mitokondrion hengitysketjun kompleksin puutos
Yksi 61 siihen liittyvästä geenistä
Kompleksien I, II, III, IV tai V yksittäinen puutos, jota aiheuttavat tumagenomin tai mitokondrion geenien variantit. Se voi vaikuttaa aivoihin, lihaksiin, sydämeen, maksaan ja muihin energiaa vaativiin elimiin.
- 3 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Tieto voi lopettaa diagnoosin etsimisen ja ohjata sairastuneiden elinten seurantaa sekä mitokondrioille myrkyllisten lääkkeiden välttämistä.
NDUFA6-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 1,1 kb geenin 5,2 kb:stä; 387 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: NDUFA6
1Helppo
Kuinka vaikea NDUFA6 on sekvensoida lyhyin lukemin, asteikolla 0–100
0 · Helppo100 · Vaikea
Lähes kaikki geenin NDUFA6 eksonit sijaitsevat alueilla, joilla lyhyet lukemat kartoittuvat selvästi.
Lisäksi vaikuttaa: geenin NDUFA6 eksonien osuus kussakin vaikeassa alueluokassa
- KartoitettavuusKohdat, joissa 100 tai 250 emäsparin lukemia ei voi sijoittaa yksiselitteisesti, joten muutos siellä voi jäädä huomaamatta tai olla virheellinen. Paino 35 %.0 %
- HomologiaSegmentaaliset duplikaatiot: kopiot muualla genomissa, kuten paraloogit ja pseudogeenit, vähintään 90 %:n identiteetillä. Paino 30 %.0 %
- ToistotTandem-toistot ja saman emäksen jaksot, joilla lukemat luistavat eivätkä välttämättä kata niitä. Paino 15 %.0 %
- GC-pitoisuusIkkunat, joissa G- ja C-emäksiä on alle 25 % tai yli 65 %, joita kirjastovalmistelu kattaa ohuesti. Paino 10 %.10 %
- ReferenssikattavuusReferenssikokoonpanon aukot lähellä, joissa ei ole sekvenssiä, johon lukemat voisivat kohdistua. Paino 10 %.0 %
Dante Labsin oman tutkimukseen perustuva pistemäärä, joka pohjautuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pistemäärä lasketaanJokainen palkki kuvaa sitä osuutta geenin NDUFA6 eksonien emäksistä, joka on kyseisessä vaikeassa alueluokassa. Pistemäärässä kukin luokka painotetaan sen mukaan, kuinka paljon se vaikeuttaa muutosten luotettavaa havaitsemista lyhyillä lukemilla: 0, kun mikään emäs ei ole missään luokassa, 100, kun jokainen emäs on kaikissa niistä.
2
NDUFA6-geenin kohdat, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei sijaitse alueella, jota lyhyet lukemat pitävät vaikeana.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 5,2 kb geenistä NDUFA6, intronit mukaan lukien, eikä vain eksonien 1,1 kb:tä.
ClinVar pathogenic variants (2)
The NDUFA6 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Todennäköisesti patogeeninen 2
| Variantti | Conditions | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|
| NM_002490.6(NDUFA6):c.285del (p.Val96fs) (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 33 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★1 tähti neljästä kriteerit annettu, yksi lähettäjä |
| NM_002490.6(NDUFA6):c.157del (p.Asp53fs) (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 33 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★1 tähti neljästä kriteerit annettu, yksi lähettäjä |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ACAD9acyl-CoA dehydrogenase family member 9Yhteinen sairaus: 1
- ATP5F1AATP synthase F1 subunit alphaYhteinen sairaus: 1
- ATP5F1DATP synthase F1 subunit deltaYhteinen sairaus: 1
- ATP5F1EATP synthase F1 subunit epsilonYhteinen sairaus: 1
- BCS1LBCS1 ubiquinol-cytochrome c reductase complex chaperoneYhteinen sairaus: 1
- COA6cytochrome c oxidase assembly factor 6Yhteinen sairaus: 1
- COA8cytochrome c oxidase assembly factor 8Yhteinen sairaus: 1
- COX10cytochrome c oxidase assembly factor heme A:farnesyltransferase COX10Yhteinen sairaus: 1
- COX15cytochrome c oxidase assembly factor COX15Yhteinen sairaus: 1
- COX16cytochrome c oxidase assembly factor COX16Yhteinen sairaus: 1
- COX20cytochrome c oxidase assembly factor COX20Yhteinen sairaus: 1
- COX6B1cytochrome c oxidase subunit 6B1Yhteinen sairaus: 1
Geeniin NDUFA6 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita NDUFA6 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Encephalopathy
- Focal T2 hyperintense brainstem lesion
- Global developmental delay
- Lethargy
- Leukodystrophy
- Leukoencephalopathy
- Poor eye contact
Näytä 14 piirrettä lisää
- Epilepsy
- Repeated seizures without recovery between them
- Abnormal craniofacial muscle tone
- Difficulty articulating speech
- Irritability
- Loss of ability to walk
- Motor regression
- Reduced cerebral white matter volume
- Simplified gyral pattern
- Small cerebellum
- Ventriculomegaly
- Inability to speak
- Poor speech
- Worsening neurological symptoms
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tiedot ovat peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-18: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut sairauksia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joita lyhyet lukemat pitävät vaikeina.
- Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Tietojulkaisu 2026.10.18-8b139e39.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). NDUFA6-geeni: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A6. Haettu 18. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/ndufa6
Dante Labs. NDUFA6-geeni: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A6 [Internet]. [viitattu 18. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/ndufa6
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa