Gen
NDUFA6
NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A6
- HGNC 7690↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000184983↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 4700↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 22q13.2
- Koordinater
- Kromosom 22: 42 085 526–42 090 772 (GRCh38)
- Eksoner
- 3 eksoner over 5,2 kb
- Protein
- 128 aminosyrer
- Også kjent som
- B14, LYRM6, CI-B14, NADHB14
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000498737.8NM_002490.6
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ndufa6.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes NDUFA6 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Primær mitokondriesykdom
- Mangel på respirasjonskjede-kompleks
Ett av 61 gener knyttet til den
Isolerte mangler på kompleks I, II, III, IV eller V, forårsaket av varianter i kjerne- eller mitokondriegener. Dette kan påvirke hjernen, musklene, hjertet, leveren og andre organer med høyt energibehov.
- 3 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Å få vite dette kan avslutte en diagnostisk leting og veilede oppfølging av berørte organer og unngåelse av legemidler som er giftige for mitokondriene.
Slik er NDUFA6 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 1,1 kb av genets 5,2 kb, og 387 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av NDUFA6
1Lett
Hvor vanskelig NDUFA6 er å sekvensere med korte leser, av 100
0 · Lett100 · Vanskelig
Nesten alle eksonene til NDUFA6 ligger der korte leser kartlegges godt.
Det som bidrar: andelen av eksonene til NDUFA6 i hver type vanskelig område
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, slik at en påvisning der kan mangle eller være feil. Vekt 35 %.0 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vekt 30 %.0 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av én base, som leser kan glippe på og kanskje ikke spenner over. Vekt 15 %.0 %
- GC-innholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som bibliotekforberedelsen dekker tynt. Vekt 10 %.10 %
- ReferansedekningHull i den nærliggende referanseassembleringen, der det ikke finnes sekvens for leser å justere mot. Vekt 10 %.0 %
En Dante Labs-score basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelig sekvenserbare områder.Slik beregnes poengsummenHver søyle er andelen av eksonbaser i NDUFA6 i den typen vanskelig område. Én type kan i seg selv gjøre et gen vanskelig, og hver ekstra type bidrar mindre: 0 når ingen baser er i noen, 100 når alle baser ligger der leser ikke kan plasseres entydig.
2
posisjoner i NDUFA6 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynlig patogen
Ingen av dem ligger i et område som korte leser har problemer med.
En helgenomsekvensering dekker alle 5,2 kb av NDUFA6, inkludert introner, ikke bare de 1,1 kb med eksoner.
ClinVar pathogenic variants (2)
The NDUFA6 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Sannsynligvis patogen 2
| Variant | Conditions | ClinVar-klassifisering | Vurderingsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_002490.6(NDUFA6):c.285del (p.Val96fs) (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 33 | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_002490.6(NDUFA6):c.157del (p.Asp53fs) (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 33 | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
Gener knyttet til de samme tilstandene
- ACAD9acyl-CoA dehydrogenase family member 9Deler 1 tilstand
- ATP5F1AATP synthase F1 subunit alphaDeler 1 tilstand
- ATP5F1DATP synthase F1 subunit deltaDeler 1 tilstand
- ATP5F1EATP synthase F1 subunit epsilonDeler 1 tilstand
- BCS1LBCS1 ubiquinol-cytochrome c reductase complex chaperoneDeler 1 tilstand
- COA6cytochrome c oxidase assembly factor 6Deler 1 tilstand
- COA8cytochrome c oxidase assembly factor 8Deler 1 tilstand
- COX10cytochrome c oxidase assembly factor heme A:farnesyltransferase COX10Deler 1 tilstand
- COX15cytochrome c oxidase assembly factor COX15Deler 1 tilstand
- COX16cytochrome c oxidase assembly factor COX16Deler 1 tilstand
- COX20cytochrome c oxidase assembly factor COX20Deler 1 tilstand
- COX6B1cytochrome c oxidase subunit 6B1Deler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til NDUFA6
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene NDUFA6 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Encephalopathy
- Focal T2 hyperintense brainstem lesion
- Global developmental delay
- Lethargy
- Leukodystrophy
- Leukoencephalopathy
- Poor eye contact
Vis 14 egenskaper til
- Epilepsy
- Repeated seizures without recovery between them
- Abnormal craniofacial muscle tone
- Difficulty articulating speech
- Irritability
- Loss of ability to walk
- Motor regression
- Reduced cerebral white matter volume
- Simplified gyral pattern
- Small cerebellum
- Ventriculomegaly
- Inability to speak
- Poor speech
- Worsening neurological symptoms
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-18: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende steder, og regionene som korte leser finner vanskelige.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.18-8b139e39.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). NDUFA6-genet: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A6. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/ndufa6
Dante Labs. NDUFA6-genet: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A6 [Internett]. [sitert 19. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/ndufa6
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker